Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  231  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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2.7
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4.6
40
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216
23
22
28
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
123
36
1
37
24
1.67
80235782--80235895
27
4.3
26
84
7
140
15
23
21
38
1.92
80235782--80235904
53
2.3
53
83
2
149
17
24
21
36
1.94
80239408--80239457
26
1.9
26
95
0
91
12
24
34
30
1.91
80239329--80239593
103
2.6
103
89
3
408
20
20
29
29
1.97
80246818--80247083
103
2.6
104
90
3
419
19
20
29
29
1.97
80252285--80252385
24
4.2
24
90
0
148
32
1
40
24
1.67
80253795--80253890
27
3.6
27
85
0
129
18
25
19
36
1.95
80258981--80259254
136
2.0
136
94
0
476
33
16
28
21
1.95
80260455--80260699
49
4.9
49
80
4
258
25
17
26
29
1.98
80264198--80264325
29
4.5
28
88
2
175
32
25
12
28
1.92
80264197--80264325
57
2.3
57
87
2
188
32
26
12
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80271936--80272010
28
2.6
29
89
2
107
32
24
13
30
1.93
80274107--80274275
41
4.1
41
76
8
130
24
30
21
23
1.99
80274129--80274276
41
3.6
41
77
7
158
25
29
22
23
1.99
80296732--80296850
29
4.2
29
71
10
93
29
14
29
26
1.95
80298607--80298645
20
2.0
20
85
10
53
69
0
30
0
0.89
80298968--80299081
51
2.2
51
87
3
158
40
12
20
27
1.88
80299125--80299230
52
2.0
52
96
0
194
45
1
8
44
1.45
80299450--80299487
15
2.5
15
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0
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0
13
52
1.40
80299878--80299924
21
2.1
22
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7
78
12
25
27
34
1.92
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21
2.5
21
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0
70
18
26
22
32
1.97
80303018--80303042
13
1.9
13
100
0
50
32
16
16
36
1.90
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49
2.4
48
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2
193
36
6
26
30
1.82
80304735--80304802
35
1.9
35
96
0
127
32
5
27
33
1.81
80304770--80305475
47
14.9
47
93
2
1144
33
8
28
29
1.87
80304770--80305475
192
3.7
190
94
2
1202
33
8
28
29
1.87
80304772--80305475
239
3.0
236
94
1
1205
33
8
28
29
1.87
80312907--80313006
50
2.0
50
100
0
200
20
30
26
24
1.98
80313789--80313874
41
2.1
41
91
0
136
34
15
31
18
1.92
80318390--80318425
16
2.2
16
95
0
63
22
16
16
44
1.86
80330898--80331109
79
2.7
79
81
10
236
25
26
21
25
1.99
80330914--80331107
40
4.8
40
83
5
232
25
27
21
25
1.99
80339076--80339131
27
2.1
27
100
0
112
21
7
26
44
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80340105--80340288
40
4.5
40
79
6
158
32
26
15
25
1.96
80346110--80346156
23
2.0
23
100
0
94
34
17
4
44
1.68
80349088--80349132
17
2.7
18
77
22
53
64
8
15
11
1.49
80353139--80353203
28
2.4
27
84
2
76
27
23
26
23
2.00
80380030--80380119
44
2.1
43
95
2
162
16
27
18
36
1.93
80382392--80382418
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
80386892--80387402
255
2.0
255
98
0
995
33
13
21
31
1.92
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2.1
28
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20
21
30
28
1.98
80395558--80395699
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2.2
64
82
8
171
21
26
29
21
1.99
80401049--80401073
13
1.9
13
100
0
50
20
24
40
16
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290   291   292   293   294   295