Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  29  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7931687--7931875
88
2.1
88
80
5
222
19
19
22
39
1.93
7931565--7932294
222
3.3
222
92
1
1171
20
20
21
37
1.95
7931912--7932075
88
1.9
88
84
5
224
23
18
19
37
1.94
7931909--7932097
88
2.1
88
78
5
213
21
17
20
40
1.92
7932182--7932384
43
4.7
41
72
15
126
18
23
22
35
1.95
7932141--7932384
88
2.8
86
84
7
305
20
22
21
36
1.95
7944643--7944692
21
2.5
21
87
6
77
56
6
2
36
1.36
7955324--7955373
9
5.3
9
76
9
55
32
0
2
66
1.03
7955331--7955382
18
2.6
19
75
24
54
28
0
1
69
0.99
7955896--7955959
31
2.1
31
82
5
76
32
10
10
45
1.74
7957926--7957973
24
2.0
25
84
12
64
56
2
6
35
1.36
7959225--7959282
19
2.9
19
75
14
55
37
8
10
43
1.70
7959787--7959857
30
2.4
30
83
6
83
59
4
2
33
1.31
7961829--7961892
20
3.3
19
82
6
83
29
0
4
65
1.13
7967715--7967770
24
2.2
27
87
9
82
57
0
7
35
1.26
7978930--7979002
32
2.3
31
79
6
76
27
1
9
61
1.35
7984341--7984380
21
1.9
21
85
10
55
67
2
0
30
1.04
7989099--7989145
14
3.3
15
80
11
55
42
14
6
36
1.72
7998123--7998165
16
2.6
17
81
3
52
48
0
4
46
1.22
7998160--7998184
5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
8006455--8006481
14
1.9
14
100
0
54
25
14
7
51
1.68
8006488--8006695
74
2.9
70
79
7
220
27
19
24
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8006480--8006709
69
3.2
69
79
7
244
26
17
22
33
1.96
8006768--8006907
74
1.9
74
89
2
219
28
20
21
30
1.98
8006997--8007031
14
2.5
14
90
0
52
20
22
2
54
1.58
8007160--8007311
72
2.1
72
81
7
175
29
17
18
34
1.94
8009222--8009258
3
12.0
3
88
5
56
32
0
0
67
0.91
8022128--8022154
14
1.9
14
100
0
54
25
14
7
51
1.68
8022173--8022382
69
3.0
69
81
3
231
28
17
23
30
1.97
8022153--8022422
69
3.8
69
78
7
218
27
17
22
32
1.96
8022441--8022580
74
1.9
74
89
2
219
28
20
21
30
1.98
8022670--8022704
14
2.5
14
90
0
52
20
22
2
54
1.58
8022833--8022984
72
2.1
72
81
7
175
29
17
18
34
1.94
8024913--8024955
3
14.0
3
90
4
68
32
0
0
67
0.91
8033227--8033252
10
2.6
10
100
0
52
42
19
7
30
1.79
8038714--8038760
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
8050916--8050940
13
1.9
13
100
0
50
48
8
0
44
1.32
8051371--8051405
18
1.9
18
94
0
61
31
2
0
65
1.07
8051661--8051693
17
1.9
17
93
0
57
3
27
0
69
1.03
8051668--8051714
21
2.2
21
85
14
62
0
27
4
68
1.08
8051765--8051796
5
6.4
5
100
0
64
59
0
0
40
0.97
8053534--8053596
33
1.9
32
87
9
92
39
0
6
53
1.26
8053761--8053824
22
3.0
22
75
6
60
71
4
14
9
1.27
8053974--8054004
11
2.8
11
100
0
62
41
0
19
38
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8054879--8054975
45
2.3
40
76
13
97
24
14
16
44
1.85
8058686--8058750
14
4.5
14
71
19
53
38
7
0
53
1.30
8059165--8059196
16
2.1
16
88
11
50
37
0
0
62
0.95
8059378--8059425
24
2.0
25
83
4
62
52
4
2
41
1.32
8061689--8062453
220
3.5
214
80
9
745
32
13
21
31
1.93
8066096--8066126
16
1.9
16
93
0
53
48
0
0
51
1.00
8066259--8066364
40
2.7
40
82
1
124
50
15
6
27
1.68
8066250--8066364
39
2.9
39
78
1
140
47
15
8
27
1.75
8076884--8076939
19
2.9
19
78
0
58
19
28
26
25
1.99
8081070--8081131
31
2.0
31
87
6
90
45
9
11
33
1.73
8083330--8083354
6
4.2
6
100
0
50
48
0
36
16
1.46
8085292--8085349
15
3.8
16
74
17
61
60
0
0
39
0.97
8085293--8085357
30
2.1
31
83
8
80
61
0
0
38
0.96
8086179--8086215
18
2.1
18
89
0
56
81
16
2
0
0.81
8088987--8089020
2
17.0
2
93
0
59
50
2
47
0
1.16
8091080--8091116
19
2.0
19
94
5
67
35
0
10
54
1.36
8091083--8091127
18
2.4
19
85
10
58
40
0
8
51
1.33
8093596--8093643
25
1.9
25
83
8
62
37
0
2
60
1.09
8101490--8101556
32
2.1
32
100
0
134
44
5
5
43
1.53
8101834--8101956
62
2.0
62
95
0
219
20
27
26
25
1.99
8102138--8102172
7
5.0
7
100
0
70
71
0
0
28
0.86
8102131--8102172
21
2.1
19
91
8
66
71
0
0
28
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8106600--8106790
38
5.0
38
86
2
231
20
21
26
31
1.98
8114157--8114347
38
5.0
38
90
1
265
20
21
26
31
1.98
8121241--8121435
98
2.0
98
98
0
381
33
10
15
40
1.83
8121791--8121848
30
1.9
30
89
6
91
51
13
24
10
1.72
8128562--8128677
43
2.7
43
81
10
139
31
25
18
25
1.97
8133495--8133727
48
4.9
48
85
0
304
28
28
17
24
1.97
8134586--8134831
125
2.0
125
94
0
429
42
12
20
24
1.86
8137033--8137057
13
1.9
13
100
0
50
16
24
36
24
1.94
8140256--8140294
6
6.5
6
90
0
51
51
10
15
23
1.73
8141090--8141223
60
2.2
59
81
9
146
26
26
19
27
1.99
8141217--8141262
20
2.3
20
85
3
67
28
30
17
23
1.97
8144361--8144401
22
1.9
21
85
5
55
2
19
7
70
1.22
8144454--8144506
22
2.3
23
84
9
65
33
5
7
52
1.53
8148503--8148549
15
3.2
15
90
3
69
34
0
17
48
1.47
8158918--8158962
16
2.9
16
83
9
58
55
0
4
40
1.20
8162551--8162592
20
2.0
20
86
9
57
26
9
11
52
1.68
8166117--8166162
23
2.0
23
87
4
67
45
8
6
39
1.61
8166124--8166168
23
2.0
23
86
0
63
40
11
8
40
1.72
8171542--8171713
93
1.8
93
94
0
308
27
29
21
22
1.99
8171535--8171710
46
3.8
46
76
12
198
28
28
21
21
1.98
8178558--8178613
27
2.1
27
100
0
112
19
3
3
73
1.13
8180164--8180199
17
2.1
17
94
0
63
52
13
16
16
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8184423--8184461
21
1.9
20
84
5
51
17
5
2
74
1.12
8190988--8191045
29
1.9
31
83
13
77
31
8
0
60
1.27
8193864--8194127
87
3.0
87
92
0
438
25
17
13
43
1.86
8201166--8201207
20
2.1
20
95
0
75
45
35
4
14
1.66
8202592--8202624
9
3.8
9
88
8
50
75
0
0
24
0.80
8210780--8210806
9
3.0
9
100
0
54
66
0
0
33
0.92
8211348--8211421
31
2.3
33
83
6
89
50
1
1
47
1.18
8211478--8211529
26
2.0
26
84
0
68
48
3
1
46
1.31
8211507--8211560
19
2.8
18
75
20
56
37
1
3
57
1.27
8211739--8211801
24
2.7
23
80
7
65
42
1
3
52
1.27
8211796--8211860
25
2.8
23
79
9
78
61
0
1
36
1.05
8212497--8212556
27
2.3
25
78
13
68
71
3
21
3
1.15
8213228--8213274
24
2.0
24
84
16
62
31
2
14
51
1.55
8218598--8218726
38
3.4
37
78
4
132
32
24
17
26
1.96
8220548--8220616
20
3.3
20
71
11
66
49
1
8
40
1.43
8220511--8220642
43
3.0
44
89
5
207
50
3
7
38
1.46
8220736--8220761
12
2.2
12
100
0
52
57
0
0
42
0.98
8220844--8220881
11
3.4
11
80
20
51
39
13
0
47
1.42
8222191--8222215
10
2.5
10
100
0
50
68
8
12
12
1.40
8222847--8222898
25
2.1
25
85
7
70
42
15
5
36
1.71
8230236--8230285
22
2.3
21
75
21
50
10
20
2
68
1.29
8241693--8241724
15
2.1
15
94
0
55
28
34
21
15
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8243982--8244037
26
2.2
26
90
3
87
39
7
21
32
1.80
8259168--8259197
15
2.0
15
100
0
60
46
20
20
13
1.83
8261398--8261574
40
4.4
40
83
4
225
23
22
28
25
1.99
8263620--8263672
25
2.1
26
86
10
74
13
7
13
66
1.45
8273064--8273115
11
4.7
11
75
0
50
13
13
23
50
1.77
8281362--8281393
16
2.0
16
100
0
64
37
6
31
25
1.81
8286439--8286482
21
2.2
20
84
8
54
11
18
40
29
1.85
8292693--8292733
18
2.3
19
80
20
52
24
29
17
29
1.97
8298461--8298523
31
2.0
31
100
0
126
36
9
9
44
1.70
8305449--8305479
11
2.8
11
95
0
53
70
0
3
25
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295