Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  26  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6872180--6872382
3
67.0
3
73
11
137
30
4
3
61
1.34
6872230--6872369
38
3.6
39
75
13
121
29
4
4
62
1.33
6872305--6872382
29
2.7
30
84
7
72
30
2
5
61
1.31
6872650--6872700
21
2.4
21
83
6
59
68
9
1
19
1.27
6872658--6872700
21
2.0
22
86
4
61
69
9
2
18
1.26
6872746--6872778
15
2.1
16
88
11
50
69
0
0
30
0.88
6873069--6873132
27
2.4
27
82
12
71
29
0
7
62
1.23
6873368--6873426
27
2.2
27
85
8
77
30
8
8
52
1.61
6873378--6873441
27
2.2
30
83
8
89
34
6
6
53
1.51
6873378--6873437
26
2.3
26
82
8
77
33
6
6
53
1.53
6873709--6873812
25
4.2
25
71
13
79
34
6
6
51
1.54
6873709--6873874
75
2.2
75
93
1
289
35
7
6
50
1.56
6875314--6875344
5
6.2
5
92
0
53
83
0
16
0
0.64
6886019--6886069
27
1.9
27
92
4
86
62
5
3
27
1.36
6886253--6886298
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
6886260--6886304
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
6889243--6889282
17
2.4
17
86
0
53
60
5
2
32
1.32
6890800--6890842
22
2.0
22
100
0
86
37
6
9
46
1.63
6894290--6894345
23
2.2
26
75
12
64
50
1
3
44
1.29
6895663--6895688
8
3.2
8
100
0
52
30
11
11
46
1.76
6896782--6896832
13
3.9
14
77
12
54
64
0
3
31
1.11
6897146--6897187
17
2.4
18
92
7
70
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6897571--6897606
18
2.0
18
94
0
63
16
0
58
25
1.38
6897585--6897659
37
2.0
37
97
0
141
17
0
53
29
1.44
6900530--6900564
15
2.3
15
90
0
52
8
11
2
77
1.10
6907400--6907442
22
2.0
22
81
9
52
20
4
9
65
1.40
6907414--6907447
14
2.4
14
85
0
50
23
2
5
67
1.26
6908405--6908456
14
3.5
14
73
14
50
25
3
0
71
1.03
6908408--6908486
31
2.5
32
80
12
92
27
2
1
68
1.10
6908408--6908486
30
2.5
31
82
13
83
27
2
1
68
1.10
6908542--6908582
19
2.2
19
86
8
57
48
31
2
17
1.60
6914856--6914924
31
2.2
31
97
2
129
44
2
15
36
1.62
6918288--6918329
10
3.8
11
81
9
50
83
0
16
0
0.65
6918288--6918329
6
7.5
6
79
15
54
83
0
16
0
0.65
6918289--6918329
21
2.0
21
90
0
64
82
0
17
0
0.66
6920777--6920822
23
2.0
23
83
8
58
21
19
23
34
1.96
6930838--6931030
47
4.0
48
80
8
187
24
17
28
30
1.97
6938266--6938306
20
2.0
21
85
4
57
36
0
2
60
1.10
6938265--6938306
22
2.0
21
85
4
57
38
0
2
59
1.10
6950860--6950948
7
13.3
7
72
10
53
23
4
29
42
1.74
6950904--6950991
28
3.1
28
70
15
74
20
4
36
38
1.73
6959571--6959647
38
2.0
38
97
0
145
31
9
31
28
1.88
6961132--6961185
16
3.6
15
80
7
56
27
3
7
61
1.40
6961221--6961555
140
2.4
142
80
11
366
31
4
6
58
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6961418--6961476
27
2.2
27
78
3
66
33
1
3
61
1.23
6961754--6961816
27
2.2
30
83
8
87
34
6
6
52
1.52
6961754--6961813
26
2.3
26
82
8
77
33
6
6
53
1.53
6961810--6961858
22
2.3
23
86
13
77
34
4
6
55
1.44
6962015--6962065
19
2.5
19
78
15
50
29
7
7
54
1.57
6966358--6966391
15
2.3
15
94
0
59
38
8
0
52
1.33
6967673--6967715
21
2.0
21
100
0
86
44
18
13
23
1.86
6968634--6968688
20
2.8
20
81
15
69
54
0
0
45
0.99
6990313--6990337
13
1.9
13
100
0
50
40
48
0
12
1.40
6990299--6990336
18
2.1
18
100
0
76
42
47
0
10
1.38
6990362--6990402
6
6.5
6
83
10
55
78
4
0
17
0.93
6990365--6990404
20
2.0
20
90
0
62
75
7
0
17
1.03
6990422--6990495
9
8.6
9
74
14
66
27
8
21
43
1.80
6992015--6992060
11
4.4
11
79
20
53
26
2
2
69
1.11
6992015--6992052
20
1.9
20
89
10
60
26
2
0
71
1.00
6999212--6999280
35
2.0
35
97
0
129
37
15
8
37
1.79
6999717--6999756
21
2.0
20
85
5
53
50
0
0
50
1.00
7000328--7000368
21
2.0
21
90
4
66
26
0
14
58
1.37
7001599--7001633
16
2.2
16
90
10
54
34
0
14
51
1.42
7004151--7004187
16
2.3
16
90
0
56
29
13
0
56
1.37
7009223--7009269
13
3.6
13
75
11
51
74
2
21
2
1.03
7024718--7024873
42
3.7
41
75
17
158
24
18
26
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7032036--7032191
42
3.7
41
75
17
158
24
18
26
30
1.98
7036958--7037013
26
2.2
26
100
0
112
35
26
7
30
1.83
7037725--7037767
22
2.0
22
100
0
86
58
13
4
23
1.55
7038334--7038376
22
2.0
22
85
0
59
62
2
4
30
1.28
7042010--7042071
29
2.1
30
81
3
72
30
3
9
56
1.47
7043556--7043589
9
3.9
9
88
3
52
35
0
8
55
1.31
7047042--7047075
17
2.0
17
100
0
68
52
11
5
29
1.61
7055737--7055796
18
3.3
18
75
9
59
30
15
11
43
1.82
7057210--7057250
21
2.0
21
85
0
55
51
7
0
41
1.30
7075393--7075441
24
2.0
25
88
4
73
65
0
6
28
1.16
7075503--7075629
3
40.7
3
74
12
87
62
4
4
28
1.36
7077179--7077258
41
2.0
41
82
5
99
32
16
15
36
1.89
7077280--7078115
45
18.5
44
69
13
428
28
21
18
32
1.96
7077544--7077621
41
1.9
41
83
0
102
24
20
21
33
1.97
7077184--7078075
182
4.9
182
91
0
1345
28
20
17
32
1.96
7078097--7078298
68
3.0
67
90
1
314
26
23
26
24
2.00
7078295--7079349
86
12.2
86
89
2
1265
22
24
21
30
1.99
7078295--7079349
174
6.1
174
92
1
1399
22
24
21
30
1.99
7081123--7081186
7
8.9
7
76
19
51
3
7
4
84
0.86
7081121--7081201
36
2.3
35
81
14
94
2
6
7
83
0.87
7081146--7081201
16
3.6
16
77
15
55
0
5
10
83
0.78
7086277--7086465
3
62.7
3
76
13
129
60
3
5
30
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7086334--7086386
16
3.1
17
86
5
54
69
1
3
24
1.15
7093200--7093266
31
2.1
32
86
8
93
23
17
1
56
1.49
7097234--7097259
7
3.7
7
100
0
52
42
0
0
57
0.98
7104252--7104276
8
3.1
8
100
0
50
12
52
12
24
1.72
7105401--7105454
23
2.3
23
83
0
72
31
7
3
57
1.44
7105246--7105485
3
80.7
3
66
15
52
25
7
4
62
1.40
7105564--7105618
3
18.3
3
88
0
83
32
3
1
61
1.24
7206185--7206310
54
2.3
55
81
9
152
26
26
17
28
1.98
7206187--7206309
27
4.6
26
82
5
129
26
27
17
28
1.98
7213995--7214172
27
6.6
27
79
3
115
28
28
16
26
1.97
7213995--7214172
54
3.3
55
80
10
204
28
28
16
26
1.97
7214016--7214171
82
1.9
81
85
3
215
28
28
16
26
1.97
7216917--7217247
41
8.1
41
86
5
438
35
23
22
18
1.96
7217509--7217545
15
2.5
15
86
4
58
18
5
32
43
1.73
7222322--7222368
19
2.5
19
76
10
51
21
2
4
72
1.12
7222609--7222727
44
2.7
43
79
5
132
26
15
30
27
1.96
7222704--7222751
24
2.0
24
91
0
78
33
20
25
20
1.97
7222669--7222794
67
1.9
67
89
0
198
31
19
26
22
1.98
7224997--7225021
6
4.2
6
100
0
50
16
36
16
32
1.90
7229939--7230130
63
3.0
63
93
0
321
36
14
14
34
1.87
7232350--7232410
23
2.6
25
71
19
60
62
1
0
36
1.05
7233686--7233737
17
2.9
17
78
15
52
21
7
3
67
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7243922--7243947
8
3.2
8
100
0
52
50
26
0
23
1.50
7245282--7245323
10
4.4
9
88
8
57
71
0
2
26
0.98
7245282--7245323
19
2.2
19
87
8
59
71
0
2
26
0.98
7245642--7245685
18
2.5
18
96
3
81
72
4
0
22
1.02
7245672--7245726
21
2.8
20
81
8
58
69
7
1
21
1.23
7245805--7245834
14
2.1
14
93
0
51
36
16
13
33
1.88
7246066--7246138
37
1.9
39
91
5
123
31
9
5
53
1.56
7247407--7247464
26
2.3
26
82
8
66
58
1
1
37
1.18
7247429--7247479
14
3.3
15
82
17
61
58
0
0
41
0.98
7247429--7247478
15
3.1
16
78
18
59
58
0
0
42
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295