Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  12  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.2
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32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3202254--3202290
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17
100
0
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24
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14
95
36
6
1
55
1.35
3240679--3240724
22
2.1
22
100
0
92
47
17
4
30
1.67
3246383--3246417
11
3.2
11
91
0
61
31
0
2
65
1.07
3247098--3247177
40
2.0
40
100
0
160
52
12
20
15
1.74
3247190--3247225
18
2.0
18
100
0
72
50
11
11
27
1.72
3251752--3251811
22
2.9
21
79
13
63
31
3
10
55
1.50
3251761--3251806
22
2.1
22
100
0
92
26
4
8
60
1.44
3252016--3252047
3
10.7
3
100
0
64
34
0
0
65
0.93
3252213--3252277
22
3.0
21
77
8
67
73
4
20
1
1.08
3252227--3252285
22
2.7
21
78
17
66
71
3
23
1
1.11
3265958--3266012
6
9.8
6
81
15
64
18
0
49
32
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3265967--3265992
10
2.6
10
100
0
52
11
0
57
30
1.34
3266215--3266599
125
3.1
123
80
5
423
36
16
17
29
1.92
3266215--3266603
126
3.1
124
79
6
435
36
16
17
29
1.92
3269697--3269785
29
3.1
29
67
23
89
51
5
4
38
1.46
3269704--3269801
27
3.6
27
70
22
87
57
5
4
33
1.40
3269687--3269819
56
2.4
56
98
0
257
51
6
3
38
1.44
3269726--3269812
27
3.2
26
67
23
70
52
6
2
37
1.41
3270239--3270273
18
1.9
18
100
0
70
40
0
28
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1.57
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7
8.6
7
84
0
84
55
13
3
28
1.54
3271901--3271977
25
3.2
25
72
20
81
58
1
6
33
1.32
3271896--3271993
48
2.0
48
90
0
151
57
2
6
34
1.35
3272148--3272196
22
2.2
22
82
7
55
44
0
28
26
1.54
3272145--3272209
32
2.0
32
88
5
96
41
0
24
33
1.55
3277582--3277652
5
14.6
5
74
21
62
38
1
4
56
1.28
3277610--3277652
19
2.3
19
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8
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41
2
0
55
1.12
3277662--3277695
17
2.0
17
94
0
59
79
0
17
2
0.86
3277662--3277695
9
3.9
9
84
7
52
79
0
17
2
0.86
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30
1.9
30
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6
82
43
3
22
31
1.70
3278662--3278747
46
1.9
44
90
4
136
33
13
23
29
1.93
3278664--3278788
44
2.8
45
81
4
135
34
14
23
28
1.94
3282028--3282061
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
3291066--3291099
17
2.0
17
94
0
59
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3302685--3302709
13
1.9
13
100
0
50
72
28
0
0
0.86
3302852--3302901
26
1.9
26
95
0
91
56
14
16
14
1.69
3303594--3303636
20
2.3
19
81
14
54
13
0
20
65
1.27
3304354--3304462
43
2.5
43
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5
114
19
15
31
33
1.93
3306897--3306934
19
2.0
19
89
0
58
34
2
2
60
1.24
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265
2.0
265
100
0
1060
29
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21
42
1.79
3310569--3310606
4
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4
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0
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0
0
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0
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0
0
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25
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13
4.0
13
78
9
61
28
1
0
69
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310