Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  186  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.04
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2
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0
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2
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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29
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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0
19
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1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61015043--61015208
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16
32
28
1.96
61063092--61063135
6
7.2
6
89
5
70
47
15
18
18
1.83
61063116--61063225
45
2.4
45
90
3
168
41
17
18
22
1.90
61063438--61063516
41
2.0
40
87
2
113
39
16
8
35
1.80
61069985--61070181
21
9.6
21
73
6
145
45
17
21
15
1.86
61070037--61070081
19
2.4
19
88
0
63
44
20
22
13
1.85
61069989--61070182
42
4.7
43
76
11
192
45
17
21
15
1.85
61071744--61071784
15
2.8
15
92
3
66
29
31
7
31
1.85
61072562--61072598
19
1.9
19
94
0
65
48
8
10
32
1.67
61074873--61074915
11
3.9
11
81
0
50
34
0
4
60
1.17
61074962--61075026
33
1.9
34
84
3
87
32
7
1
58
1.36
61075040--61075091
3
17.0
3
78
4
50
34
3
3
57
1.35
61075040--61075079
16
2.6
15
88
4
53
32
5
5
57
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61075185--61075255
26
2.8
25
76
18
65
32
8
1
57
1.37
61075216--61075275
23
2.5
26
82
17
76
35
10
0
55
1.34
61075234--61075271
17
2.2
18
85
4
51
34
10
0
55
1.34
61077309--61077341
15
2.1
16
88
5
50
51
0
0
48
1.00
61080453--61080495
18
2.4
18
88
7
61
53
0
0
46
1.00
61082343--61082669
169
1.9
168
89
3
505
38
17
7
37
1.77
61092750--61092880
63
2.2
60
81
5
156
51
10
12
25
1.72
61093121--61093172
24
2.2
24
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6
70
57
7
0
34
1.27
61094063--61094103
22
2.0
20
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9
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43
0
2
53
1.13
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2.0
23
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0
58
44
0
4
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1.21
61095148--61095189
21
2.0
21
86
9
59
40
2
7
50
1.43
61096752--61096813
31
2.0
31
84
6
81
20
3
25
50
1.64
61111908--61111962
22
2.4
23
81
6
67
45
5
5
43
1.50
61112149--61112201
10
5.2
10
78
13
54
39
0
0
60
0.97
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14
100
0
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51
14
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1.73
61115499--61115560
32
1.9
32
100
0
124
32
22
9
35
1.87
61116936--61117010
34
2.2
34
92
2
134
26
22
22
28
1.99
61119036--61119070
16
2.1
17
89
5
54
45
5
0
48
1.26
61119644--61119677
15
2.3
15
100
0
68
41
11
0
47
1.40
61119939--61119979
20
2.0
20
85
0
55
29
26
0
43
1.55
61126438--61126560
63
2.0
63
90
0
192
30
26
17
24
1.97
61126612--61126646
16
2.1
17
89
5
54
45
5
0
48
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61143588--61143687
43
2.3
43
84
6
123
23
16
28
33
1.95
61143804--61143889
31
2.7
31
85
3
100
55
20
10
12
1.66
61146098--61146140
21
2.0
21
100
0
86
51
9
9
30
1.65
61147644--61147669
12
2.2
12
100
0
52
30
26
7
34
1.85
61149389--61149503
9
13.7
9
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15
59
39
0
14
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1.45
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3.0
25
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0
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3.2
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0
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2
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0
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29
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72
59
27
0
13
1.35
61162779--61162807
5
5.8
5
100
0
58
41
0
0
58
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310