Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  27  of  310  ( 37082 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7168788--7168841
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0
0
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0
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2
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3.3
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1.84
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2.0
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7186670--7186762
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2.6
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16
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11
2.8
11
95
0
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29
3
48
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1.64
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0
100
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4.1
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1.81
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30
100
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13
90
9
50
6
21
0
71
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7214803--7216462
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548
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1
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1.92
7221897--7222179
117
2.5
116
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4
376
21
29
15
33
1.94
7221916--7222232
117
2.8
115
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2
316
22
27
15
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1.94
7222259--7222308
25
2.0
25
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0
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10
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2.2
25
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5
5
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1.50
7234336--7234424
43
2.0
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2
144
49
11
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32
1.65
7234626--7234670
17
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0
0
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1.9
20
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0
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0
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2
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1.10
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2.4
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2
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2.1
29
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6
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1.55
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2.4
30
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31
1.9
31
85
0
82
35
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11
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1.72
7254847--7254925
29
2.6
30
88
6
106
41
15
10
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1.80
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22
2.5
20
80
19
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60
0
0
39
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2.0
29
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0
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13
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0
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17
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53
1
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1
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1.03
7258996--7259033
16
2.3
17
86
4
51
2
23
2
71
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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12
12
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2
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2
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0
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0
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1.9
75
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167
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15
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1.91
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17
2.4
16
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8
51
57
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2
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1.35
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2.0
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23
19
13
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20
2.5
20
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1.70
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0
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2.0
26
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0
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0
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7
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1.11
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2.6
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11
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2.3
19
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0
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129
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0
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28
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70
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25
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1
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18
2.9
17
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11
50
21
15
7
55
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7335161--7335272
57
2.0
57
87
0
161
19
22
22
35
1.96
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2.0
27
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3
70
69
1
0
28
0.99
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27
3.1
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15
67
36
3
1
58
1.24
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2.4
21
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12
59
30
10
8
52
1.64
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17
2.7
18
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12
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0
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1.12
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1
3
54
1.28
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1.9
23
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0
4
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0
0
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0
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19
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144
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3.2
64
61
20
142
29
26
18
26
1.98
7373809--7374094
137
2.1
136
96
0
527
31
25
19
24
1.98
7375389--7375472
26
3.2
26
96
0
150
35
25
5
33
1.80
7393890--7393922
15
2.2
16
89
10
52
51
3
0
45
1.16
7402841--7403207
46
8.0
46
98
0
617
36
13
26
23
1.91
7406718--7406807
25
3.6
25
75
0
81
33
15
30
21
1.94
7408410--7408462
18
2.8
19
86
8
65
58
3
3
33
1.34
7408682--7408722
20
2.0
22
90
9
68
36
0
0
63
0.95
7408673--7408722
23
2.2
22
83
16
59
36
0
0
64
0.94
7409614--7409672
28
2.0
28
90
6
91
35
8
3
52
1.49
7410788--7410820
12
2.8
12
86
4
50
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7410944--7411005
30
2.1
30
96
0
115
58
11
3
27
1.48
7411035--7411076
22
1.9
22
85
0
57
54
9
14
21
1.68
7414703--7414743
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
7429259--7429291
3
11.3
3
90
6
50
0
27
0
72
0.85
7439991--7440031
9
4.8
9
79
8
50
12
7
2
78
1.06
7440048--7440121
36
2.0
36
85
12
98
22
5
2
68
1.23
7440075--7440122
18
2.7
17
81
9
60
29
4
0
66
1.10
7440111--7440204
21
4.1
24
70
19
67
40
0
2
57
1.11
7440220--7440290
37
1.9
36
83
8
90
43
1
4
50
1.30
7440961--7441049
10
9.4
9
72
11
63
52
2
1
43
1.20
7440961--7441065
19
5.4
19
70
15
72
53
1
1
42
1.23
7440952--7441063
29
3.8
29
74
9
102
53
1
1
42
1.21
7441019--7441108
35
2.7
34
78
14
98
53
1
1
44
1.15
7444555--7444647
30
3.1
30
88
0
132
26
26
21
24
1.99
7449264--7449319
6
9.5
6
80
3
60
39
0
0
60
0.97
7449421--7449464
22
2.1
21
84
16
56
61
0
2
36
1.09
7449513--7449590
34
2.3
33
78
10
86
71
5
6
16
1.25
7449589--7449652
26
2.4
28
81
7
78
45
1
3
50
1.27
7449589--7449654
27
2.5
26
82
5
78
43
1
3
51
1.26
7449804--7449851
16
2.8
18
78
15
57
41
0
0
58
0.98
7450115--7450201
22
4.0
21
69
23
63
56
2
0
41
1.12
7450113--7450203
23
4.1
22
72
13
62
54
2
0
42
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7450191--7450264
37
2.0
37
85
12
100
68
4
5
21
1.26
7450186--7450237
18
2.9
18
74
5
52
67
1
3
26
1.18
7450280--7450312
9
3.8
9
92
8
59
84
0
6
9
0.76
7450280--7450312
17
1.9
17
100
0
66
84
0
6
9
0.76
7450833--7450980
30
4.9
30
100
0
296
23
9
30
36
1.87
7451666--7451725
23
2.6
23
74
10
59
55
5
1
38
1.32
7451818--7451883
26
2.4
27
78
14
73
42
1
4
51
1.31
7452033--7452073
21
1.9
22
90
5
66
53
0
0
46
1.00
7452364--7452444
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23
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55
2
0
41
1.13
7452376--7452459
23
3.8
22
74
13
75
55
1
0
42
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310