Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  192  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62593614--62593659
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2.2
21
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6
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62600772--62600911
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3.5
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18
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20
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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146
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20
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4.4
88
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0
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25
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1.98
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44
5.5
44
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24
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1.99
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7.2
178
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21
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1.97
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2
15
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2
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5
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0
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1.25
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2.4
22
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1.28
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10
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17
100
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5
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7
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0
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0
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2.9
16
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3
51
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6
8
6
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
27
1.24
62753307--62753394
20
4.7
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18
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65
3
3
27
1.24
62753921--62753965
21
2.2
20
92
4
72
28
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1.42
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27
2.1
27
86
3
78
58
0
1
39
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62833837--62833876
17
2.4
17
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32
1.32
62835697--62835753
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2.3
26
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31
0
3
64
1.10
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0
50
14
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1.34
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2.0
19
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0
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0
0
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46
1
4
47
1.32
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25
2.0
25
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27
12
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1.56
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0
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15
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22
2.0
22
87
8
65
46
15
4
33
1.66
62876497--62876526
12
2.4
13
94
5
53
56
0
0
43
0.99
62877036--62877078
19
2.3
19
84
12
61
53
0
2
44
1.13
62878465--62878514
23
2.3
23
82
6
59
62
8
0
30
1.24
62891642--62891721
3
28.7
3
77
16
75
70
1
2
26
1.08
62891642--62891726
11
7.7
11
82
5
93
70
1
2
25
1.06
62891645--62891721
14
5.6
14
80
11
88
70
1
2
25
1.08
62897061--62897142
29
2.9
27
80
12
85
35
7
0
57
1.27
62897704--62897738
17
2.1
17
88
0
52
22
0
5
71
1.07
62911128--62911170
20
2.2
20
83
8
52
30
6
2
60
1.35
62911941--62912008
18
3.9
18
77
11
70
5
17
35
41
1.74
62920884--62921040
43
3.7
43
77
6
165
31
25
14
29
1.94
62923888--62923990
25
4.1
25
72
18
106
44
21
6
27
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62925363--62925415
20
2.7
20
82
5
54
62
16
13
7
1.53
62934616--62934672
27
2.0
29
86
6
82
57
5
5
31
1.43
62945403--62945459
28
2.0
28
96
0
105
43
22
7
26
1.78
62945798--62946017
46
4.7
47
77
9
179
24
28
19
28
1.98
62953846--62953921
21
3.6
23
76
13
74
64
2
3
28
1.25
62953952--62954002
22
2.4
21
74
6
50
56
0
7
35
1.28
62954900--62954948
20
2.4
20
82
3
53
59
2
2
36
1.21
62955166--62955348
10
18.6
10
66
13
60
31
5
0
62
1.22
62955268--62955364
28
3.5
27
73
17
83
31
3
0
64
1.09
62955333--62955365
16
2.1
16
88
11
50
27
3
0
69
1.03
62957195--62957228
3
11.7
3
87
6
52
70
29
0
0
0.87
62957823--62957863
21
2.0
21
90
0
64
29
19
7
43
1.78
62963886--62964406
260
2.0
260
95
0
943
25
17
30
25
1.97
62969335--62969382
15
3.3
15
74
11
55
70
4
0
25
1.04
62969337--62969383
14
3.4
14
77
8
51
70
4
0
25
1.05
62983902--62984052
75
2.0
75
94
0
266
39
11
20
29
1.87
62984127--62984410
142
2.0
142
95
0
514
33
19
25
22
1.97
62988060--62988092
15
2.1
16
88
5
50
15
0
21
63
1.30
62988506--62988930
44
9.7
44
74
10
275
27
21
19
31
1.98
62988436--62988840
175
2.3
178
84
3
516
27
20
20
31
1.98
62988462--62988929
87
5.3
87
74
8
274
26
20
20
32
1.97
62988724--62988890
45
3.8
45
77
12
175
29
23
16
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62989423--62989590
46
3.7
46
87
0
237
26
22
17
33
1.96
62990940--62990974
6
5.8
6
93
0
61
11
0
2
85
0.69
62996517--62996572
28
2.0
28
92
0
94
32
30
16
21
1.95
63012206--63012256
25
2.0
27
84
7
70
19
23
0
56
1.42
63015025--63015097
28
2.5
28
80
17
69
65
4
2
27
1.24
63015117--63015186
30
2.3
29
86
11
97
55
1
1
41
1.17
63015146--63015191
21
2.2
20
92
7
74
60
0
0
39
0.97
63015716--63015809
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112
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4
2
62
1.26
63015714--63015791
36
2.2
34
86
8
113
29
5
3
61
1.35
63015769--63015854
10
9.0
9
76
16
68
34
2
2
60
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310