Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  76  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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18
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2.2
26
87
0
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17
19
29
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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0
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26
2.5
27
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50
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1.26
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23
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2.1
21
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33
1.23
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18
2.9
18
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71
0
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26
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22
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2
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0.98
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14
3.8
14
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18
56
56
1
3
37
1.28
24364415--24364461
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3.5
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4
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3
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19
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2
0
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1.12
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2.9
18
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5
61
67
0
3
28
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
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2.00
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337
25
22
27
24
2.00
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3.2
35
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28
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1.88
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18
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1.85
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98
35
15
13
35
1.86
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0
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0
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18
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1.00
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11
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1
18
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76
1.03
24417308--24417384
11
7.4
10
74
14
59
1
18
5
75
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24418497--24418562
5
12.2
5
73
20
53
36
3
18
42
1.66
24418508--24418562
12
4.8
12
86
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34
3
16
45
1.65
24418505--24418562
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17
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0
15
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11
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11
67
1
18
4
76
1.03
24420451--24420527
11
7.4
10
74
14
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1
18
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75
1.06
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17
76
2
64
36
3
15
44
1.63
24432498--24432557
31
1.9
32
83
10
79
48
1
1
48
1.21
24432791--24432849
26
2.2
27
85
8
77
57
0
3
38
1.15
24432797--24432848
18
2.9
17
80
8
50
55
0
3
40
1.18
24435196--24435226
6
5.0
6
96
4
53
0
16
19
64
1.29
24437473--24437547
33
2.3
33
83
2
89
54
1
6
37
1.35
24439113--24439161
4
12.2
4
95
0
89
24
0
26
48
1.51
24443399--24443446
20
2.3
22
79
13
57
39
22
25
12
1.89
24456235--24456361
62
2.0
62
84
0
164
40
15
6
37
1.73
24457798--24458108
45
6.9
45
96
0
550
18
25
15
40
1.89
24462895--24463112
48
4.6
48
84
5
243
27
31
16
25
1.96
24463039--24463251
46
4.6
47
76
10
183
23
27
19
29
1.98
24463085--24463254
93
1.8
92
85
8
238
22
26
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24467912--24467997
42
2.0
42
90
0
136
34
17
6
40
1.77
24472328--24472371
22
2.0
22
81
0
52
29
20
11
38
1.87
24474309--24474390
42
2.0
42
90
0
128
34
6
9
50
1.60
24476478--24476516
18
2.2
18
86
9
53
30
2
7
58
1.39
24477442--24477506
20
3.2
20
68
8
51
20
29
29
21
1.98
24477442--24477531
40
2.2
41
90
2
146
18
30
30
21
1.97
24477450--24477514
20
3.2
20
65
8
51
16
26
32
24
1.96
24479502--24479604
51
2.0
51
94
0
179
55
10
6
27
1.59
24479792--24479828
5
7.6
5
93
6
67
81
0
0
18
0.70
24479792--24479828
14
2.6
14
95
4
65
81
0
0
18
0.70
24482068--24482099
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
24482069--24482099
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
24488281--24488340
24
2.5
24
86
8
77
35
3
15
46
1.62
24489534--24489566
15
2.2
15
89
10
50
42
9
3
45
1.51
24491786--24491841
13
4.2
13
78
21
62
66
0
7
26
1.18
24491801--24491873
19
3.9
18
73
7
67
67
1
6
24
1.23
24491802--24491840
16
2.4
16
87
8
53
71
0
2
25
0.98
24499725--24499782
28
2.1
28
87
6
82
58
0
10
31
1.31
24499855--24499909
28
2.2
26
81
15
62
54
5
5
34
1.46
24500654--24500680
13
2.1
13
100
0
54
70
7
14
7
1.32
24503712--24503923
26
8.2
26
92
0
352
33
7
23
35
1.83
24503712--24503923
52
4.1
52
99
0
415
33
7
23
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24504408--24504463
26
2.2
26
96
0
103
30
7
25
37
1.82
24506062--24506256
27
7.2
27
79
12
222
18
24
22
34
1.96
24506059--24506256
54
3.7
54
94
1
326
18
24
22
34
1.96
24516851--24516880
3
10.0
3
92
0
51
33
0
3
63
1.11
24524544--24524603
25
2.4
25
77
0
66
26
20
21
31
1.98
24526956--24527008
21
2.6
20
85
11
72
64
0
9
26
1.24
24528286--24528456
44
3.9
43
74
7
146
25
23
20
30
1.99
24528534--24528639
44
2.4
44
85
0
131
23
21
24
30
1.99
24528799--24528966
45
3.8
45
77
6
171
26
23
22
28
1.99
24528794--24528964
89
1.9
89
82
7
213
25
23
22
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310