Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  29  of  310  ( 37082 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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2.1
60
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4
11
39
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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10
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31
2.3
32
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2
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1.80
7895048--7895176
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0
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4
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53
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3.1
27
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9
70
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1
2
38
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.16
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1
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19
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1
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1.24
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35
13
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1.92
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13
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13
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11
274
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13
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2.1
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2.0
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2.7
17
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12
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15
39
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7977068--7977105
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18
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0
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0
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4
0
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16
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0
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8
8
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1.66
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3.2
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13
2.2
13
100
0
56
53
14
0
32
1.41
8039375--8039425
26
2.0
26
96
0
93
13
21
23
41
1.89
8041619--8041667
11
4.5
11
77
10
55
61
8
12
18
1.55
8043093--8043145
26
2.0
27
85
7
74
26
15
22
35
1.93
8044623--8044730
52
2.1
52
94
3
191
35
22
8
34
1.84
8044623--8044730
26
4.2
26
90
0
162
35
22
8
34
1.84
8051280--8051374
48
2.0
48
97
0
181
28
26
9
35
1.88
8051768--8051875
26
4.2
26
89
0
171
37
25
6
31
1.81
8057935--8057994
28
2.1
28
81
6
68
38
1
3
56
1.26
8057961--8058025
24
2.7
23
74
6
58
30
3
1
64
1.18
8058001--8058037
15
2.4
16
90
4
58
24
2
0
72
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8062612--8062667
25
2.3
25
84
3
69
30
3
1
64
1.21
8064474--8064513
20
2.0
20
95
0
71
17
5
30
47
1.69
8075448--8075474
14
1.9
14
100
0
54
48
22
14
14
1.81
8077010--8077154
33
4.4
33
70
8
89
31
18
26
24
1.98
8077148--8077349
46
4.4
46
87
1
273
46
14
21
17
1.83
8077148--8077406
46
5.7
46
83
3
272
45
14
20
18
1.84
8082210--8082250
21
2.0
21
85
9
57
26
12
34
26
1.92
8083241--8083273
16
2.0
17
88
5
50
48
0
6
45
1.27
8083323--8083364
22
1.9
22
85
0
57
50
4
0
45
1.23
8084893--8085056
89
1.9
88
97
1
310
43
5
10
40
1.63
8085311--8085345
18
1.9
18
94
0
61
62
22
0
14
1.31
8085782--8085835
28
1.9
28
88
0
81
51
12
9
25
1.70
8090993--8091237
49
4.9
49
81
3
292
28
25
19
26
1.99
8093717--8093778
18
3.4
17
74
23
54
59
0
1
38
1.07
8096832--8096862
8
3.9
8
91
0
53
19
0
12
67
1.22
8096831--8096866
16
2.2
16
100
0
72
19
0
11
69
1.18
8096831--8096879
16
2.9
16
90
6
62
22
2
10
65
1.34
8099214--8099240
1
27.0
1
100
0
54
0
0
0
100
0.00
8100209--8100244
13
2.8
13
87
4
56
55
0
11
33
1.35
8101963--8102418
90
5.1
90
91
0
626
32
15
25
26
1.95
8105121--8105174
28
2.0
28
88
3
83
57
5
18
18
1.59
8105862--8105914
24
2.2
24
86
0
70
50
7
3
37
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8110408--8110451
14
3.1
14
76
3
52
79
4
0
15
0.89
8111655--8111693
17
2.4
16
83
8
51
38
2
2
56
1.27
8111814--8111854
15
2.6
16
88
7
57
29
4
4
60
1.38
8123714--8124283
44
13.0
44
82
4
625
28
14
27
29
1.95
8123982--8124062
41
2.0
41
82
4
101
29
18
24
27
1.98
8124563--8124588
7
3.7
7
100
0
52
88
11
0
0
0.52
8124559--8124601
14
3.1
14
86
0
59
83
6
0
9
0.80
8124554--8124601
7
6.7
7
87
2
51
81
6
0
12
0.87
8125672--8125770
9
11.1
9
66
27
52
28
3
4
64
1.26
8125670--8125728
17
3.7
17
80
15
81
28
1
3
66
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310