Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  14  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.51
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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0
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11
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indels
Score
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1.03
3685189--3685268
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20
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27
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2
2
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3732687--3732738
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0
0
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1.00
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1
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1.05
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6
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35
1.73
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1.13
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83
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0
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40
40
6
12
1.68
3766562--3767054
143
3.4
146
84
5
601
27
16
23
32
1.95
3766570--3767055
73
6.8
71
77
8
475
27
16
23
32
1.96
3766569--3767054
213
2.3
215
81
7
542
27
16
23
32
1.96
3767222--3767405
72
2.5
72
82
2
217
28
17
23
30
1.97
3768180--3768211
16
2.0
16
93
0
55
40
40
6
12
1.68
3768887--3769047
80
2.0
79
91
6
261
26
19
6
47
1.73
3769089--3769208
60
2.0
60
95
0
213
12
33
35
18
1.88
3769514--3769560
20
2.3
20
83
16
62
34
0
2
63
1.06
3769515--3769560
21
2.3
21
85
14
62
34
0
2
63
1.07
3769599--3769629
13
2.3
14
94
5
55
41
0
6
51
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3769711--3769742
12
2.7
12
95
0
55
37
0
0
62
0.95
3769758--3769877
26
4.7
24
75
14
89
34
1
6
57
1.35
3769889--3769931
21
2.1
20
86
4
59
34
11
4
48
1.60
3784846--3784990
79
1.8
78
86
4
211
34
15
22
26
1.95
3785335--3785486
72
2.1
73
86
6
211
23
16
23
37
1.93
3785429--3785631
88
2.3
88
82
3
221
27
14
20
36
1.92
3787191--3787233
21
2.1
20
86
4
59
34
11
4
48
1.60
3803330--3803448
44
2.7
44
75
7
107
29
18
22
29
1.97
3804863--3805019
27
5.8
27
89
0
224
29
21
8
40
1.84
3804863--3805018
81
1.9
81
90
0
249
29
21
8
40
1.83
3804850--3805047
81
2.4
81
79
6
238
33
20
8
37
1.83
3804971--3805136
27
6.2
27
76
3
120
39
21
8
31
1.83
3805429--3805523
25
3.8
25
90
0
136
27
25
20
27
1.99
3805428--3805534
25
4.4
25
83
9
107
29
22
20
27
1.98
3805440--3805548
50
2.2
50
80
6
114
28
24
20
26
1.99
3817367--3817636
76
3.5
76
85
7
345
31
24
15
28
1.96
3817367--3818184
239
3.5
239
77
12
656
33
22
17
27
1.96
3817649--3818097
75
6.0
73
80
7
456
32
21
18
28
1.97
3824643--3824736
46
2.0
46
97
0
179
17
26
23
32
1.96
3828587--3828679
47
2.0
46
91
4
143
16
29
19
34
1.93
3829144--3829228
43
2.0
43
95
0
152
34
20
28
17
1.95
3830484--3830583
11
9.6
11
71
13
52
50
7
4
39
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3831394--3831582
95
2.0
95
97
0
360
52
12
17
17
1.74
3833115--3833185
31
2.3
31
85
7
101
32
4
11
52
1.56
3833115--3833195
31
2.6
31
83
9
87
32
6
11
50
1.62
3833523--3833572
22
2.2
23
89
7
84
66
14
0
20
1.26
3833530--3833573
22
2.0
22
100
0
88
63
13
0
22
1.29
3841409--3841593
56
3.3
55
83
6
194
27
25
16
30
1.96
3841474--3841566
28
3.3
28
71
15
93
27
29
17
25
1.97
3841454--3841604
56
2.7
57
88
2
223
24
25
15
34
1.94
3841390--3841604
113
1.9
112
81
2
261
26
26
15
31
1.96
3841454--3841593
28
5.0
28
67
17
83
25
27
15
32
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310