Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  51  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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66
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12
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0
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67
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23
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.98
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2.0
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23
1.96
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2.0
519
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0
2001
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133
99
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18
30
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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233
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15
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1.96
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20
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1.99
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2.2
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12
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1.46
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2.0
521
98
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2000
27
15
28
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15701626--15701738
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16
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23
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1.94
15701626--15701738
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2.1
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156
16
23
23
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11
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0
0
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22
23
18
1.95
15721678--15721754
24
3.2
25
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7
106
22
38
3
35
1.72
15730733--15730762
4
7.5
4
100
0
60
26
0
0
73
0.84
15737234--15737265
13
2.5
13
95
5
57
53
0
15
31
1.43
15737931--15738028
49
2.0
48
84
7
128
62
6
0
31
1.20
15739652--15739678
6
4.5
6
100
0
54
66
0
0
33
0.92
15746385--15746413
14
2.0
15
93
6
51
55
6
6
31
1.53
15751974--15752448
44
10.7
44
76
7
334
35
17
17
30
1.93
15752620--15752649
6
5.0
6
91
0
51
80
0
3
16
0.85
15754876--15754940
31
2.2
30
78
10
71
32
9
13
44
1.76
15755130--15755208
31
2.6
31
84
6
90
40
10
12
36
1.77
15756083--15756143
30
2.1
30
84
9
81
60
0
3
36
1.13
15758043--15758107
22
3.0
22
82
6
71
16
18
15
49
1.80
15763284--15763347
32
2.0
32
96
0
119
21
23
6
48
1.73
15765763--15765878
61
1.9
58
84
8
153
42
3
3
50
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15768164--15768251
43
2.0
43
100
0
176
34
22
11
31
1.90
15768726--15768890
87
1.9
86
89
1
258
35
21
15
26
1.94
15779411--15779446
18
1.9
19
94
5
65
41
16
0
41
1.48
15780458--15780505
23
2.1
23
92
0
78
31
8
20
39
1.82
15783601--15783732
55
2.4
55
86
5
169
28
29
19
22
1.98
15795684--15795715
8
3.9
8
92
8
55
53
0
0
46
1.00
15795684--15795716
17
1.9
17
100
0
66
54
0
0
45
0.99
15795686--15795725
17
2.4
17
91
0
62
52
2
2
42
1.28
15797009--15797070
31
2.0
32
90
3
99
41
9
11
37
1.74
15798184--15798208
13
1.9
13
100
0
50
32
0
4
64
1.12
15808190--15808344
28
5.5
27
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6
130
29
34
18
17
1.94
15808160--15808373
57
3.7
57
90
2
322
29
35
17
17
1.93
15808215--15808375
29
5.6
29
76
2
173
29
37
16
16
1.91
15810299--15810358
28
2.2
26
77
11
66
26
26
11
35
1.91
15810313--15810384
28
2.6
28
88
0
99
29
27
12
30
1.93
15837538--15837806
144
1.9
144
88
0
412
26
30
17
26
1.97
15837438--15837806
48
7.7
48
78
5
277
24
30
18
26
1.98
15841993--15842145
74
2.1
74
97
0
288
49
10
8
31
1.67
15844206--15844264
16
3.2
17
77
22
66
52
0
0
47
1.00
15844211--15844254
22
2.0
22
86
8
63
54
0
0
45
0.99
15844274--15844315
13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99
15844278--15844314
16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15844302--15844400
46
2.1
48
82
14
118
48
4
0
47
1.20
15847602--15847748
71
2.1
71
93
0
249
36
17
6
39
1.76
15847966--15848028
24
2.5
26
80
10
78
33
20
17
28
1.95
15849243--15849289
23
2.0
23
100
0
94
31
25
4
38
1.75
15851855--15851952
40
2.5
40
85
11
132
24
27
23
24
2.00
15863248--15863303
25
2.3
24
81
3
67
44
14
5
35
1.68
15869807--15869920
56
2.0
56
98
0
219
24
7
7
59
1.52
15869826--15869956
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2.3
56
83
8
142
28
6
8
57
1.52
15880067--15880109
20
2.2
19
83
4
50
23
2
2
72
1.08
15882231--15882391
46
3.5
46
77
9
168
27
18
29
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310