Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  31  of  310  ( 37082 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8385967--8386070
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53
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2
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2.0
30
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2.0
22
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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0
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2.0
17
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0
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3
0
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8475059--8475123
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23.3
3
76
14
68
33
3
0
63
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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0
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0
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0
10
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1
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11
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2.2
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158
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30
25
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8514047--8514129
25
3.4
24
86
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114
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16
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1.96
8514178--8514244
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3.3
20
89
0
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20
13
32
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20
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7
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27
22
11
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1.88
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8
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73
13
0
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1.10
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1.99
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21
25
25
1.99
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60
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50
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32
2.0
33
93
3
114
52
6
20
21
1.68
8542647--8542685
20
1.9
20
84
5
51
46
7
15
30
1.74
8545729--8545812
31
2.7
31
88
5
125
33
21
3
41
1.70
8552642--8552671
15
2.0
15
100
0
60
20
33
0
46
1.51
8555528--8555572
22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
8570438--8570507
35
2.0
35
94
0
122
24
21
24
30
1.99
8573129--8573179
20
2.5
20
81
6
59
52
1
3
41
1.31
8573391--8573494
19
5.6
18
71
20
72
33
3
1
60
1.26
8573401--8573497
9
10.1
9
70
17
63
31
4
2
61
1.26
8575205--8575353
63
2.4
63
82
0
172
27
20
26
25
1.99
8577066--8577090
13
1.9
13
100
0
50
40
8
20
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8580334--8580371
18
2.2
18
86
13
53
10
0
2
86
0.66
8580869--8580989
63
1.9
63
81
6
147
27
19
30
22
1.98
8584260--8584284
6
4.2
6
100
0
50
68
0
0
32
0.90
8587232--8587265
17
2.0
17
100
0
68
35
11
11
41
1.78
8587698--8587730
6
5.7
6
96
3
59
87
0
12
0
0.53
8595365--8595411
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
8595672--8595936
46
6.0
46
83
7
323
22
23
15
39
1.91
8595672--8595935
91
3.0
90
85
5
324
22
23
14
39
1.91
8595850--8595925
38
2.0
38
97
0
143
25
26
17
31
1.97
8598076--8598152
31
2.5
32
77
10
88
54
3
1
40
1.27
8603091--8603173
34
2.5
33
84
4
94
13
16
7
62
1.52
8607857--8607925
36
1.9
36
87
0
102
17
8
31
42
1.80
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11
3.6
12
80
9
50
75
7
0
17
1.02
8612379--8612433
22
2.5
22
82
5
67
70
7
0
21
1.11
8612409--8612433
10
2.5
10
100
0
50
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8
0
24
1.16
8616059--8616111
26
2.0
26
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7
72
39
22
13
24
1.90
8622565--8622629
32
2.0
32
100
0
130
30
6
24
38
1.80
8631772--8631835
21
3.1
21
70
17
71
34
20
26
18
1.96
8631704--8631835
41
3.3
40
85
4
167
32
16
28
21
1.96
8632631--8632659
14
2.1
14
100
0
58
24
27
0
48
1.51
8637755--8637804
22
2.3
22
79
3
57
12
34
38
16
1.85
8639732--8639909
49
3.7
49
81
8
186
24
20
30
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8639684--8639866
49
3.7
50
80
7
180
24
20
30
24
1.99
8645490--8645604
37
3.1
37
85
5
160
41
28
11
18
1.85
8647849--8647893
20
2.2
20
88
0
63
48
2
13
35
1.54
8653689--8653756
34
2.0
34
97
0
127
57
11
10
20
1.63
8664978--8665094
42
2.8
42
86
0
144
19
18
16
45
1.86
8673566--8673755
42
4.4
42
78
4
157
29
24
14
31
1.95
8681943--8682050
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
8684405--8684505
20
5.1
20
71
4
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39
20
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11
1.88
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2.3
45
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3
129
34
17
24
24
1.96
8690240--8690452
113
1.9
113
89
1
329
32
19
24
23
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310