Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  191  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62280298--62280434
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0
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5
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1.62
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2.0
246
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2.5
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0
80
50
15
22
12
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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25
17
28
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62361191--62361353
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2.3
70
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2
220
28
25
17
28
1.97
62362255--62362296
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2.0
21
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30
1.66
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2.0
433
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2
22.0
2
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2.0
29
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1.94
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2.4
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17
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2.0
33
85
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14
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2
28
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62429060--62429120
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2.3
27
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42
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1.89
62429074--62429129
26
2.2
26
87
6
80
37
23
25
14
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62429188--62429250
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2.6
23
80
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33
22
26
17
1.96
62429194--62429250
24
2.3
24
84
6
69
33
21
29
15
1.94
62429060--62429252
74
2.6
73
76
5
174
37
19
22
19
1.94
62432825--62432883
19
3.1
19
88
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61
6
0
32
1.22
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2.0
27
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0
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0
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0
0
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52
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0
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1.13
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52
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0
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2.9
114
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1
415
25
21
23
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62477969--62478106
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1.9
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197
28
21
19
30
1.98
62477969--62478130
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2.2
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81
4
184
25
19
22
32
1.97
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17
4
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39
1.68
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13
3
43
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3
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38
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177
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13
21
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1.92
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2.6
17
100
0
88
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15
0
36
1.46
62481869--62481911
13
3.3
13
86
0
68
39
6
2
51
1.42
62483923--62483993
21
3.4
21
80
0
79
33
18
45
2
1.64
62484217--62484250
14
2.4
14
95
0
59
17
8
20
52
1.71
62484404--62484731
42
7.9
41
86
1
431
24
21
21
33
1.97
62484405--62484731
84
3.9
83
92
2
487
24
20
21
33
1.97
62484318--62484731
126
3.3
124
85
3
501
26
20
20
32
1.97
62484893--62484944
25
2.1
25
96
0
95
40
5
3
50
1.45
62485343--62485378
16
2.3
16
90
4
56
19
0
19
61
1.35
62485434--62485479
25
1.9
24
86
8
67
73
0
2
23
0.94
62485806--62485832
14
1.9
14
100
0
54
37
14
3
44
1.63
62486146--62486210
31
2.1
31
82
5
78
47
7
3
41
1.48
62486977--62487034
31
1.9
31
85
3
82
34
8
1
55
1.41
62489057--62489143
21
4.0
23
80
10
92
37
25
21
14
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62489514--62489571
15
3.8
15
88
2
89
51
12
0
36
1.39
62499461--62500012
142
3.9
142
92
0
861
27
22
17
32
1.96
62501160--62501184
3
8.3
3
100
0
50
68
0
32
0
0.90
62523834--62524313
69
7.0
69
76
4
351
40
19
20
20
1.92
62523801--62524224
138
3.1
137
78
4
388
39
18
21
20
1.92
62524118--62524224
33
3.1
34
68
20
96
42
19
18
19
1.90
62523835--62524314
207
2.3
208
78
3
504
40
19
20
20
1.92
62530336--62530520
44
4.2
44
77
8
187
28
27
15
29
1.96
62540289--62540330
8
4.9
8
86
13
57
80
2
2
14
0.90
62548512--62548581
32
2.2
32
97
0
131
51
0
8
40
1.33
62551232--62551261
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
62555899--62556055
44
3.6
44
79
8
158
29
23
17
29
1.97
62555977--62556268
46
6.7
45
72
12
209
27
21
20
31
1.98
62555937--62556268
44
7.6
44
73
11
197
27
21
20
31
1.98
62561375--62561410
17
2.1
18
89
5
56
47
2
16
33
1.61
62561544--62561573
14
2.2
14
94
5
53
80
0
0
20
0.72
62561910--62562336
110
3.9
110
90
2
596
33
18
17
31
1.94
62561910--62562342
219
2.0
217
85
3
593
33
18
17
31
1.94
62562648--62562686
16
2.4
17
86
4
53
51
0
0
48
1.00
62562767--62562827
20
3.4
20
64
36
57
63
4
4
26
1.35
62562768--62562831
33
1.9
33
100
0
128
62
6
4
26
1.39
62562820--62562860
21
2.0
21
85
4
57
58
4
4
31
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62563082--62563147
3
22.0
3
100
0
132
66
0
0
33
0.92
62583793--62584367
287
2.0
287
100
0
1150
33
17
13
36
1.88
62584846--62584894
10
4.5
11
80
16
57
34
0
2
63
1.06
62585538--62585564
14
1.9
14
100
0
54
29
22
18
29
1.97
62588767--62588855
3
29.3
3
70
10
56
28
6
4
60
1.42
62590947--62590978
16
2.0
16
100
0
64
56
18
12
12
1.67
62591531--62592374
44
19.1
44
99
0
1652
49
2
15
31
1.57
62593466--62593662
3
65.3
3
66
14
50
31
6
2
59
1.35
62593598--62593645
21
2.3
21
85
0
60
27
10
0
62
1.27
62593593--62593669
18
4.1
18
75
9
64
23
10
0
66
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310