Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  41  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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41
1.79
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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22
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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46
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0
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32
35
0
1.58
12028715--12028744
8
3.8
8
90
0
51
50
0
33
16
1.46
12028769--12028893
55
2.2
56
79
12
132
46
6
17
29
1.73
12030103--12030182
20
3.9
19
69
15
61
41
0
1
57
1.07
12030151--12030199
20
2.5
20
80
6
55
40
0
2
57
1.10
12031269--12031329
30
2.1
29
82
11
72
45
4
1
47
1.34
12037716--12037791
33
2.3
33
81
0
89
14
18
18
48
1.81
12039611--12039642
12
2.6
13
90
9
50
18
6
25
50
1.70
12057194--12057469
55
4.9
55
82
7
322
25
9
15
50
1.73
12057315--12057433
60
2.0
60
86
1
166
25
8
14
52
1.69
12057196--12057465
115
2.4
110
83
5
328
25
9
15
50
1.73
12069978--12070136
38
4.1
37
79
10
108
46
11
10
32
1.73
12070045--12070142
38
2.5
38
86
6
126
46
12
8
32
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12076705--12076781
28
2.8
28
68
14
70
35
22
0
42
1.54
12077268--12077305
3
13.0
3
88
5
60
63
0
2
34
1.09
12082841--12082865
13
1.9
13
100
0
50
24
24
48
4
1.68
12086282--12086384
31
3.3
31
78
4
109
27
26
19
27
1.99
12094112--12094207
36
2.6
37
85
9
124
45
11
6
36
1.65
12095133--12095195
19
3.4
19
82
8
94
42
0
22
34
1.54
12095132--12095201
36
1.9
36
100
0
140
42
0
20
37
1.52
12095694--12095834
57
2.4
58
80
5
162
31
17
20
30
1.95
12099570--12099697
56
2.3
56
93
0
211
34
25
11
28
1.91
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14
2.0
15
93
6
51
51
20
0
27
1.47
12107769--12107801
17
2.0
17
88
5
50
33
18
0
48
1.48
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101
2.6
101
83
1
309
28
24
14
32
1.94
12108183--12108260
33
2.4
32
79
10
86
26
19
15
38
1.91
12114544--12114582
19
2.1
19
100
0
78
43
20
0
35
1.52
12114856--12114909
28
2.0
26
85
7
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51
1
1
44
1.22
12118347--12118384
3
12.7
3
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0
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63
0
0
36
0.95
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14
2.6
15
83
12
51
56
2
0
40
1.13
12124977--12125032
27
2.1
27
100
0
112
35
25
14
25
1.93
12126183--12126231
3
16.3
3
100
0
98
34
0
0
65
0.93
12137004--12137097
23
4.1
23
80
0
116
45
4
26
23
1.71
12141511--12141604
23
4.1
23
85
0
134
47
4
25
22
1.69
12149107--12149140
6
5.7
6
86
13
52
14
2
11
70
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12149112--12149154
18
2.4
18
88
0
59
23
4
9
62
1.44
12149107--12149144
12
3.2
12
88
0
58
15
2
10
71
1.25
12149189--12149258
12
5.8
12
77
0
59
22
7
18
51
1.70
12149189--12149258
6
11.7
6
83
6
52
22
7
18
51
1.70
12149763--12149808
15
3.1
15
83
0
56
26
6
30
36
1.82
12151386--12151488
40
2.6
40
92
0
161
23
8
23
44
1.81
12152740--12152771
7
4.6
7
100
0
64
46
0
28
25
1.53
12153053--12153136
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22
13
22
1.88
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2.1
75
85
9
207
54
10
0
34
1.39
12155151--12155213
20
3.2
20
93
0
99
25
11
12
50
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310