Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  80  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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2.0
19
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44
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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175
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0
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10
18
30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25752289--25752313
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2.3
11
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4.6
40
82
6
221
25
24
26
23
2.00
25779998--25780181
80
2.3
80
85
3
246
25
24
26
23
2.00
25791828--25791982
40
3.9
39
91
3
202
25
21
27
25
1.99
25796652--25796681
12
2.5
12
94
0
51
20
3
20
56
1.56
25797240--25797285
19
2.3
20
96
3
85
47
17
10
23
1.79
25797269--25797299
14
2.2
14
100
0
62
41
19
6
32
1.77
25800289--25800331
17
2.6
16
89
7
68
30
0
20
48
1.50
25808901--25808935
4
8.8
4
100
0
70
22
0
0
77
0.78
25812227--25812411
40
4.7
40
81
5
178
27
28
20
24
1.99
25812194--25812411
40
5.5
39
77
7
165
25
27
20
25
1.99
25817370--25817825
227
2.0
227
94
0
804
23
30
18
27
1.97
25820326--25820588
40
6.6
39
86
4
278
25
27
21
25
1.99
25820326--25820588
120
2.2
119
82
4
307
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25820520--25820597
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
25826986--25827070
41
2.1
41
97
0
161
42
23
15
18
1.88
25837931--25837967
18
2.1
18
100
0
74
21
0
10
67
1.21
25841018--25841077
30
2.0
30
100
0
120
23
36
6
33
1.81
25842610--25842692
42
2.0
43
92
2
141
33
28
16
20
1.95
25842579--25842735
43
3.7
42
80
5
138
33
22
17
26
1.96
25846934--25846979
22
2.1
22
83
0
56
19
10
13
56
1.66
25856522--25856557
10
3.5
10
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7
54
69
25
0
5
1.10
25873539--25873604
31
2.2
30
83
5
87
36
6
6
51
1.51
25873549--25873608
31
1.9
31
93
0
102
36
6
8
48
1.60
25875117--25875153
16
2.2
17
90
4
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18
0
21
59
1.38
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28
3.0
27
78
5
85
21
2
18
57
1.52
25875392--25875524
62
2.2
61
91
1
212
24
8
18
48
1.76
25877332--25877363
16
1.9
17
93
6
57
18
6
18
56
1.62
25877318--25877608
67
4.3
67
90
3
438
25
7
17
49
1.73
25885011--25885042
12
2.7
12
95
0
55
53
15
21
9
1.70
25884994--25885042
24
2.0
24
88
7
73
55
14
22
8
1.65
25893237--25893642
134
3.0
135
81
1
478
29
17
26
26
1.98
25893579--25893674
44
2.2
46
81
5
108
28
14
27
30
1.95
25895890--25896045
68
2.2
68
77
13
149
20
28
16
34
1.94
25903409--25903564
68
2.2
68
77
13
149
20
28
16
34
1.94
25913662--25913743
36
2.3
36
93
0
146
47
24
10
17
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25920462--25920685
79
2.8
78
84
6
281
25
27
22
25
2.00
25920462--25920685
40
5.7
40
88
6
289
25
27
22
25
2.00
25928393--25928577
79
2.3
81
84
7
236
25
27
22
24
2.00
25928393--25928577
40
4.7
40
83
7
234
25
27
22
24
2.00
25931614--25931658
3
15.0
3
100
0
90
66
0
0
33
0.92
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13
2.8
12
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54
75
0
25
0
0.81
25934107--25934160
27
2.0
27
85
0
72
38
14
7
38
1.75
25935927--25935957
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0
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0
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2.1
41
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0
152
27
28
10
34
1.90
25938243--25938299
22
2.6
22
100
0
114
21
33
31
14
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310