Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102024878

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   

This is table  288  of  310  ( 37082 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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10
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20
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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8
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2
0
31
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94992670--94992750
10
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95
29
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1.28
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30
0
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1.22
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32
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34
0
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0
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1.82
94997320--94997452
28
4.7
27
72
16
83
36
0
3
58
1.21
94998022--94998057
19
1.9
18
88
5
54
41
2
0
55
1.14
94998292--94998331
17
2.3
18
86
4
55
42
0
2
55
1.13
94998356--94998424
33
2.1
34
84
7
90
60
13
2
23
1.46
94998420--94998457
20
1.9
20
88
0
58
55
10
2
31
1.48
94998731--94998791
30
2.0
31
81
12
74
52
0
0
47
1.00
94998807--94998836
10
3.1
10
90
9
53
33
0
0
66
0.92
95001315--95002099
98
8.0
98
93
0
1237
35
16
16
31
1.92
95002112--95002173
29
2.1
29
90
0
97
40
16
17
25
1.90
95004877--95004920
19
2.3
18
81
11
52
54
0
9
36
1.32
95020097--95020406
47
6.6
47
95
1
557
32
9
29
29
1.88
95020097--95020406
143
2.2
140
95
3
550
32
9
29
29
1.88
95020379--95020434
28
2.0
28
96
0
103
33
14
30
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95020332--95020481
75
2.0
75
96
0
273
32
11
29
26
1.91
95020285--95020528
122
2.0
122
97
0
461
32
9
29
27
1.89
95020238--95020549
169
1.8
169
95
0
570
32
8
29
28
1.88
95020407--95020600
47
4.1
47
87
0
271
31
9
31
26
1.89
95020191--95020600
216
1.9
216
92
0
694
31
9
30
27
1.89
95020719--95020797
37
2.1
37
88
4
115
25
18
30
25
1.98
95026186--95026230
22
2.0
22
82
4
54
40
2
4
53
1.33
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2.1
39
100
0
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0
14
16
1.20
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2.2
41
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0
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23
19
27
1.98
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21
2.7
21
77
17
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24
32
20
22
1.98
95052842--95052901
29
2.1
29
93
0
102
31
8
16
43
1.78
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45
2.9
45
84
0
163
22
22
16
37
1.94
95065636--95065836
45
4.5
45
76
7
160
21
20
17
39
1.92
95067736--95067821
42
2.0
42
97
0
163
30
9
17
43
1.80
95067743--95067812
21
3.2
23
62
15
58
32
8
18
40
1.81
95068051--95068230
46
3.9
46
75
2
146
29
18
20
31
1.96
95080552--95080605
24
2.3
23
78
15
56
7
5
11
75
1.16
95082357--95082472
39
3.0
39
85
2
153
31
4
18
46
1.68
95082358--95082494
39
3.5
39
82
5
152
32
5
18
43
1.72
95091470--95091513
22
2.1
22
83
8
56
47
4
0
47
1.22
95091480--95091523
22
2.0
23
86
4
63
43
6
0
50
1.29
95093914--95095692
44
40.5
46
81
7
518
27
23
19
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95093799--95094468
175
3.8
175
94
0
1126
28
21
18
31
1.97
95093909--95094337
87
4.9
88
66
11
128
29
22
18
30
1.97
95094128--95094774
306
2.1
306
94
0
1132
28
20
19
31
1.97
95094308--95094599
131
2.2
131
98
0
557
27
20
20
31
1.97
95094439--95095697
176
7.2
175
94
1
992
26
24
19
29
1.99
95093884--95095384
350
4.3
347
81
7
1135
27
22
19
30
1.98
95093953--95095296
481
2.8
480
87
3
1765
27
22
19
30
1.98
95094571--95095698
44
25.7
44
88
3
1562
26
25
19
28
1.99
95107985--95108016
15
2.0
17
88
11
50
62
9
0
28
1.26
95108070--95108123
26
2.0
28
82
10
69
46
7
1
44
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310