Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  102  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.24
33715326--33715427
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30
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58
6
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34
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19
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1.9
32
90
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20
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133
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20
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.0
311
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2.5
126
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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10
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1.72
33868717--33868767
23
2.2
23
96
0
93
49
7
9
33
1.65
33869932--33869974
19
2.4
19
88
7
63
37
13
11
37
1.82
33869940--33869976
19
1.9
19
100
0
74
37
10
16
35
1.83
33869940--33869999
19
2.8
22
85
9
72
36
8
16
38
1.79
33870266--33870300
18
2.0
17
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5
52
31
0
0
68
0.90
33877591--33877621
12
2.7
12
95
5
55
32
12
0
54
1.38
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25
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25
100
0
108
38
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11
27
1.88
33903482--33903516
7
4.9
7
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0
0
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1
3
26
1.16
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1.9
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22
1.55
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170
2.0
170
97
0
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30
13
18
36
1.91
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26
2.5
25
78
7
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30
0
3
66
1.07
33912127--33912224
27
3.6
27
85
0
124
20
26
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33912601--33912646
19
2.3
20
96
3
85
47
17
10
23
1.79
33912840--33912932
30
3.1
30
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59
8
0
32
1.28
33912802--33912932
60
2.2
60
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0
181
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11
0
32
1.41
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25
1.9
25
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8
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4
0
30
1.10
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0
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1.74
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2.0
46
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4
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1.76
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0
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0
0
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0
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0
0
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117
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0
0
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2.0
17
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0
68
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0
0
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0.98
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2.0
21
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55
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5
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2.8
28
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54
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21
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10
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10
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25
8
0
65
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2.4
39
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109
26
10
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1.51
33922755--33922829
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2.0
39
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111
25
12
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120
5.0
120
93
1
908
29
19
17
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33936078--33936267
93
2.1
93
97
1
364
21
31
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1.84
33937932--33937957
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2.0
13
100
0
52
38
15
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1.76
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36
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0
0
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0
0
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3
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0
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0
0
66
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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