Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  307  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94439773--94439868
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2
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44
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12
26
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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94557976--94558111
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110
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2.1
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2.0
23
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21
8
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.80
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22
23
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22
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1.98
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19
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1.81
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18
15
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1.9
150
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20
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2.1
27
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13
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44
5
12
37
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94652974--94653025
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18
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0
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27
1.93
94680799--94681022
45
4.9
45
76
7
229
26
26
15
31
1.96
94680962--94681256
78
3.8
78
88
1
430
26
23
17
32
1.97
94693084--94693116
17
1.9
17
88
11
50
69
0
0
30
0.88
94693084--94693117
18
1.9
17
88
5
50
70
0
0
29
0.87
94693349--94693424
22
3.7
21
76
15
68
40
17
6
35
1.75
94693385--94693472
19
4.8
19
91
8
155
36
14
11
37
1.83
94693378--94693472
35
2.6
37
87
12
144
35
15
10
37
1.82
94693399--94693454
17
3.5
15
88
9
60
35
16
10
37
1.83
94693594--94693632
21
1.9
20
84
5
51
10
2
15
71
1.23
94696663--94696707
18
2.4
19
81
3
56
37
22
6
33
1.80
94702370--94702529
41
3.9
41
78
12
186
21
22
28
26
1.99
94710121--94710160
18
2.2
19
86
4
55
62
0
22
15
1.32
94710243--94710281
6
6.3
6
93
3
60
66
0
17
15
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94710359--94710420
26
2.4
26
86
0
79
41
14
9
33
1.79
94722892--94722956
32
2.0
32
100
0
130
30
6
24
38
1.80
94732319--94732365
16
2.9
16
81
12
51
23
0
4
72
1.02
94732325--94732447
20
6.7
18
70
21
69
29
1
1
67
1.09
94732377--94732446
25
2.8
25
79
20
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35
0
0
64
0.94
94732373--94732631
3
84.0
3
65
24
80
33
3
1
61
1.21
94732373--94732480
29
3.8
29
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18
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35
2
0
62
1.10
94732382--94732486
45
2.3
46
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126
36
2
0
60
1.11
94732379--94732580
28
6.8
29
69
21
118
34
2
0
61
1.17
94732373--94732592
63
3.5
62
74
16
190
32
3
1
62
1.19
94732414--94732630
21
10.0
22
68
22
97
32
4
1
61
1.25
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20
2.9
22
79
18
58
31
4
1
62
1.26
94732768--94732817
23
2.3
21
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16
57
36
2
0
62
1.07
94732877--94732942
17
3.9
17
73
16
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34
1
0
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1.04
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35
2.2
35
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0
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22
18
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34
1.96
94749229--94749280
22
2.4
22
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0
77
26
9
28
34
1.88
94752319--94752490
93
1.8
93
94
0
308
27
30
21
20
1.98
94752311--94752486
46
3.8
46
81
10
214
28
29
21
21
1.98
94761888--94762014
41
3.1
40
77
4
128
19
15
22
41
1.89
94763804--94763862
23
2.6
23
81
7
68
10
10
30
49
1.70
94774935--94774987
16
3.3
16
75
0
52
20
7
9
62
1.50
94777859--94777899
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94785859--94785914
20
2.7
21
75
10
53
55
10
14
19
1.68
94786066--94786103
19
2.0
19
89
0
58
44
0
10
44
1.38
94786933--94786992
25
2.7
21
74
20
59
35
1
5
58
1.30
94787025--94787094
21
3.3
21
76
7
70
41
1
2
54
1.24
94787038--94787093
15
3.9
15
73
19
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1
1
50
1.22
94790882--94790932
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17
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50
0
0
49
1.00
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2.0
60
98
0
231
45
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1.75
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2.2
24
89
0
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9
1
32
1.43
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2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
94802495--94802581
27
3.2
26
85
4
93
36
19
22
20
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313