Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  218  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67091909--67091990
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3.0
27
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1
110
41
8
21
28
1.82
67091939--67091998
28
2.1
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0
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1.85
67102148--67102324
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6.8
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185
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23
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1.87
67102164--67102323
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3.0
54
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5
166
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21
9
41
1.84
67107617--67107669
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10
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67139827--67140092
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1.02
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2.0
30
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16
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2.4
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67162367--67162564
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4.2
47
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2
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21
17
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0
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37
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2.2
29
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56
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4.1
41
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4
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20
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2.3
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3
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3.0
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3
5
45
1.43
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2.2
28
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45
0
3
50
1.17
67200384--67200526
44
3.2
43
69
20
121
46
2
3
48
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67200578--67200886
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5.2
58
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20
188
41
2
4
51
1.36
67200567--67200979
120
3.4
120
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0
729
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2
5
51
1.36
67200640--67200947
61
5.1
61
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257
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1
6
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1.37
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18
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0
0
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0
1
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1.11
67200803--67200844
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17
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40
0
0
59
0.97
67200641--67200944
59
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23
178
41
1
6
50
1.37
67200941--67200982
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0
2
52
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67200932--67200973
15
2.9
15
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0
0
52
1.00
67201113--67201214
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1.79
67201127--67201216
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2.0
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1.80
67201196--67201244
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3.1
16
90
0
80
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1.79
67201364--67201416
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2.0
27
85
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26
15
28
1.96
67204213--67204719
274
1.8
275
84
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697
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13
21
35
1.92
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284
2.0
284
97
0
1065
28
17
16
37
1.91
67212915--67213047
71
1.9
71
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171
27
14
10
47
1.77
67213053--67213580
263
2.0
263
92
1
880
28
13
10
48
1.74
67213516--67213703
56
3.3
57
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177
31
13
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47
1.71
67218588--67218644
21
2.7
20
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10
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22
22
29
24
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2.5
17
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11
50
43
2
2
51
1.28
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19
2.0
20
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17
2
15
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1.41
67252247--67252383
61
2.2
63
88
5
199
37
21
4
36
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67255906--67255945
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11
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0
47
0
52
1.00
67255906--67255937
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2.1
15
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55
0
46
0
53
1.00
67256243--67256285
15
2.8
16
75
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52
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23
6
32
1.82
67261828--67261872
18
2.5
17
79
10
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4
13
2
80
0.97
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1.9
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11
99
37
7
0
55
1.28
67265300--67265349
18
2.7
20
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17
72
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0
54
1.30
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2.0
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0
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5
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11
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8
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16
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0
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26
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2.00
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25
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2
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1.18
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52
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2
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1.31
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17
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50
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1.72
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53
3.0
53
84
1
203
27
22
13
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67307331--67307357
4
6.8
4
100
0
54
0
22
0
77
0.76
67309259--67309300
11
3.6
11
81
12
57
40
0
2
57
1.12
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18
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18
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43
15
12
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1.83
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25
1.95
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1
19
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16
82
0
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14
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0
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1.17
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27
2.6
25
80
14
70
40
4
1
54
1.29
67324872--67324905
10
3.3
10
87
4
50
32
0
2
64
1.08
67328273--67328318
13
3.5
13
90
0
74
23
10
21
43
1.84
67328273--67328325
26
2.0
26
88
0
79
32
9
18
39
1.83
67328484--67328523
21
2.0
20
85
5
53
45
0
2
52
1.14
67328577--67328604
8
3.5
8
100
0
56
50
0
0
50
1.00
67328577--67328610
16
2.1
16
88
0
50
55
0
0
44
0.99
67328919--67328962
22
2.0
21
91
4
70
40
4
13
40
1.65
67329158--67329288
64
2.0
64
98
0
253
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15
16
27
1.88
67329598--67329655
30
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30
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107
22
25
17
34
1.96
67333094--67333269
41
4.3
41
91
0
280
23
27
19
29
1.98
67333100--67333269
82
2.1
82
98
0
331
23
28
18
29
1.98
67333481--67333517
19
1.9
19
94
0
65
45
18
0
35
1.50
67344890--67344929
20
2.0
20
85
9
55
22
5
12
60
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67345138--67345243
20
5.2
20
73
10
63
19
16
7
55
1.65
67345138--67345244
41
2.6
39
78
11
101
19
16
7
56
1.64
67345178--67345245
21
3.3
20
76
12
66
17
16
10
55
1.67
67345480--67345520
20
2.0
20
90
9
66
26
19
2
51
1.59
67345674--67345724
21
2.5
20
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9
57
41
7
0
50
1.31
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20
9.5
20
66
23
71
56
9
14
18
1.65
67346569--67346659
40
2.3
40
84
3
112
58
8
15
17
1.62
67346557--67346659
20
5.2
20
70
4
82
58
9
14
17
1.63
67346691--67346790
20
4.9
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12
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17
22
1.63
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2.4
26
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15
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31
6
1
60
1.32
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21
2.3
21
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7
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29
6
2
62
1.31
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24
3.5
24
74
12
73
31
7
3
57
1.44
67351133--67351217
38
2.2
38
89
0
134
35
22
10
31
1.88
67352810--67352861
15
3.3
16
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10
72
32
19
7
40
1.80
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12
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71
0
28
0
0.86
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20
2.0
20
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0
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1.09
67356650--67356687
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4.3
9
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3
51
73
0
26
0
0.83
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3
11.3
3
100
0
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0
0
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20
2.0
20
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15
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3.2
98
68
13
306
28
19
26
25
1.99
67372416--67372837
210
2.0
210
99
0
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27
19
27
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1.99
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20
2.0
20
90
10
62
56
5
23
15
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67373795--67373833
20
2.0
20
90
10
62
56
5
23
15
1.59
67380764--67380939
31
5.7
31
89
0
246
30
6
15
46
1.72
67380768--67380939
93
1.9
92
90
1
272
30
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16
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1.73
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16
2.1
16
100
0
66
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0
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20
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19
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0
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11
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0
0
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6
82
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1
3
50
1.26
67400520--67400577
22
2.5
24
86
8
75
50
1
1
46
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313