Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  277  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84638695--84638753
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101
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59
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19
42
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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3.2
32
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20
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1.68
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65
2.0
65
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18
2.2
20
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1.99
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3.2
44
67
3
126
24
23
23
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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26
1.99
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1.9
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21
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1.99
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22
22
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152
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26
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12.2
26
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385
17
19
18
44
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84817850--84818180
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18
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19
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2.0
33
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29
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0
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52
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2.8
17
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64
2
2
31
1.16
84832599--84832654
27
2.1
27
96
0
103
14
8
17
58
1.61
84834955--84835000
20
2.3
20
88
0
65
67
0
30
2
1.03
84839301--84839348
25
1.9
25
83
8
62
31
8
12
47
1.71
84839855--84839985
65
2.0
64
95
1
235
26
8
33
30
1.86
84842127--84842345
73
3.0
73
100
0
438
39
6
6
46
1.57
84843889--84843931
20
2.1
21
86
4
61
74
2
2
20
1.04
84843906--84843996
20
4.8
20
73
11
59
68
1
3
27
1.12
84849567--84849603
17
2.1
18
90
5
58
64
0
0
35
0.94
84871155--84871199
19
2.3
20
78
17
51
66
8
13
11
1.44
84876192--84876354
82
2.0
82
98
0
317
39
17
11
31
1.86
84879273--84879319
25
1.9
24
82
4
58
46
0
6
46
1.28
84879353--84879408
27
2.1
27
83
3
69
53
1
0
44
1.11
84884569--84884599
16
1.9
16
93
0
53
48
6
6
38
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84888174--84888357
91
2.0
91
100
0
368
40
10
14
34
1.81
84897354--84897467
57
2.0
57
98
0
219
10
27
39
22
1.87
84903617--84903657
20
2.0
20
100
0
82
26
19
4
48
1.69
84906301--84906352
25
2.0
27
81
11
63
50
3
5
40
1.45
84910714--84910761
21
2.4
20
83
10
62
33
0
8
58
1.28
84910706--84910773
31
2.2
31
84
10
86
30
0
7
61
1.23
84918890--84918934
20
2.3
20
84
3
56
42
0
28
28
1.56
84918897--84918936
20
2.0
20
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0
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37
0
27
35
1.57
84919257--84919308
26
2.0
26
96
0
95
38
19
13
28
1.89
84931773--84931814
16
2.6
16
81
7
50
59
0
4
35
1.19
84934602--84934632
16
1.9
16
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0
53
54
3
0
41
1.16
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29
2.0
29
100
0
118
10
23
6
59
1.54
84938734--84938781
15
3.3
15
79
2
53
52
33
0
14
1.42
84938734--84938794
29
2.1
29
84
6
79
52
27
0
19
1.46
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42
2.5
42
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1
122
21
24
18
35
1.96
84945848--84945927
40
2.0
40
92
0
133
36
27
6
30
1.81
84951355--84951392
20
1.9
20
84
10
51
42
13
18
26
1.87
84953977--84954017
20
2.0
20
100
0
82
36
9
19
34
1.85
84954111--84954304
103
1.9
103
87
0
289
40
19
18
22
1.92
84963316--84963378
12
5.4
12
71
22
55
47
0
3
49
1.17
84963316--84963378
22
2.7
23
77
20
69
47
0
3
49
1.17
84963442--84963492
26
2.0
26
88
3
77
50
7
1
39
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84963569--84963657
44
2.0
46
84
8
121
39
23
4
32
1.75
84963639--84963693
16
3.4
16
87
5
76
32
25
5
36
1.79
84966283--84966359
39
2.0
39
84
5
102
38
5
7
48
1.55
84967137--84967198
27
2.3
27
83
11
81
75
0
11
12
1.04
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106
1.9
106
96
0
375
30
19
20
29
1.97
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23
2.1
23
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7
73
65
12
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137
2.0
137
99
0
539
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2.0
133
99
0
525
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2.6
27
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70
18
21
17
42
1.89
84977540--84977612
33
2.2
34
82
4
87
49
2
1
46
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313