Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  182  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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102
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10.7
3
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0
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0
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0
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0.86
56287461--56289094
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2.0
105
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0
0
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1
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32
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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130
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2
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18
2.0
20
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2
2
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2.5
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
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1.96
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0
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0
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63
4.1
63
99
0
509
31
12
18
37
1.89
56550524--56550564
15
2.5
17
85
14
52
43
2
0
53
1.13
56550565--56550759
66
3.1
65
67
21
173
41
2
6
49
1.40
56550523--56550790
120
2.2
120
93
1
448
42
1
5
50
1.35
56550648--56550699
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
56550596--56550783
61
3.1
61
70
14
199
42
1
6
48
1.39
56556181--56556227
23
2.0
23
100
0
94
21
21
48
8
1.76
56570179--56570203
7
3.6
7
100
0
50
12
88
0
0
0.53
56572245--56572277
5
6.6
5
100
0
66
78
0
0
21
0.75
56576538--56576562
12
2.1
12
100
0
50
40
0
0
60
0.97
56576549--56576603
22
2.6
21
80
16
60
47
0
0
52
1.00
56576969--56577022
23
2.3
23
87
0
81
37
1
14
46
1.56
56576978--56577020
13
3.5
13
78
18
56
34
2
16
46
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56577875--56577939
25
2.7
23
79
11
67
16
3
4
75
1.10
56581394--56581597
43
4.7
44
77
11
172
34
24
13
27
1.93
56595058--56595124
23
3.0
22
77
14
84
35
23
20
19
1.95
56596057--56596102
14
3.3
14
93
0
83
56
2
0
41
1.11
56601110--56601143
16
2.2
16
89
5
52
38
0
0
61
0.96
56601807--56601875
31
2.3
29
78
9
75
39
0
2
57
1.13
56607959--56608020
28
2.2
29
85
5
90
41
25
8
24
1.82
56608792--56608839
7
7.1
7
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9
64
39
0
47
12
1.41
56609767--56610146
101
3.7
105
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10
430
40
15
15
27
1.88
56609948--56610187
97
2.4
99
86
1
340
43
15
14
26
1.85
56610115--56610279
92
1.9
85
83
10
206
44
15
13
25
1.84
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116
1.8
115
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3
320
34
16
15
32
1.91
56610487--56611190
111
6.4
107
84
7
869
31
15
14
39
1.87
56610497--56611239
220
3.4
217
82
9
919
30
15
14
38
1.88
56613967--56614009
22
2.0
22
86
9
61
37
2
4
55
1.33
56616702--56616831
70
1.9
70
87
4
192
40
4
4
50
1.44
56616810--56616860
18
2.9
16
78
16
57
49
1
0
49
1.12
56616810--56616860
17
2.9
17
80
11
59
49
1
0
49
1.12
56616884--56616945
9
7.3
9
73
10
51
54
0
0
45
0.99
56616900--56616956
8
7.0
8
73
11
53
50
0
0
49
1.00
56616888--56616954
25
2.7
25
77
13
75
53
0
0
46
1.00
56616885--56616952
17
4.1
16
74
12
57
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56616766--56617087
165
1.9
165
85
6
434
45
4
2
47
1.37
56617061--56617099
17
2.3
17
95
0
69
51
0
2
46
1.14
56617101--56617140
20
2.0
21
85
5
55
37
2
0
60
1.11
56617919--56617979
28
2.2
28
94
5
108
42
6
0
50
1.28
56618021--56618072
27
1.9
27
96
0
95
30
23
32
13
1.93
56618358--56618453
19
5.2
19
81
5
124
37
13
0
48
1.43
56618358--56618453
37
2.6
37
98
0
183
37
13
0
48
1.43
56618618--56618682
29
2.3
27
77
12
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49
0
4
46
1.22
56618660--56618723
19
3.4
19
78
4
85
51
0
10
37
1.37
56619001--56619060
27
2.2
27
81
0
75
18
28
23
30
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313