Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  219  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67400551--67400592
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2.6
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0
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123
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125
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0
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2.3
15
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5
52
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5
2
23
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
29
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1.9
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33
1.58
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1
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17
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2.0
24
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100
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20
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1.96
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1.38
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5
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27
2.2
27
96
0
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30
21
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15
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19
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99
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0
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3.2
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124
18
31
20
29
1.96
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2.2
17
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5
2
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1.20
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2.3
27
91
0
97
53
1
9
35
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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14
16
31
1.89
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26
2.2
26
100
0
112
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26
1.92
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2.0
15
100
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20
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58
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1.41
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20
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23
20
27
1.99
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20
28
1.99
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1.99
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1.99
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1.92
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25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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24
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13.6
27
74
11
157
36
17
19
26
1.94
67605929--67606104
27
6.5
27
77
7
169
31
18
21
28
1.97
67605902--67606103
81
2.5
80
80
6
212
32
17
21
28
1.96
67606123--67606206
24
3.5
24
75
6
80
26
8
25
40
1.83
67606322--67606387
26
2.5
26
82
4
89
16
19
27
36
1.93
67606381--67606566
32
5.8
32
85
0
219
21
18
21
38
1.94
67606381--67606581
96
2.1
95
86
0
276
20
18
21
39
1.93
67606572--67606641
22
3.2
22
75
0
77
17
20
17
45
1.85
67614991--67615021
7
4.4
7
91
0
53
16
51
0
32
1.44
67614991--67615031
21
1.9
22
90
5
66
17
48
0
34
1.47
67628501--67628629
41
3.3
41
70
21
132
30
25
18
25
1.98
67628461--67628670
75
2.8
74
86
2
305
29
27
20
23
1.98
67628570--67628772
104
2.0
102
87
3
291
30
27
21
21
1.98
67634907--67635038
33
3.7
34
72
19
117
30
26
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67634916--67635080
74
2.2
75
94
1
287
31
27
18
22
1.97
67635022--67635122
42
2.4
42
98
0
193
30
27
16
24
1.97
67635106--67635259
33
4.5
33
70
24
122
31
27
20
20
1.97
67634948--67635159
117
1.8
116
92
1
361
31
27
17
23
1.97
67635064--67635261
104
1.9
102
93
2
342
30
28
19
21
1.98
67637947--67637988
21
2.0
22
85
4
59
71
11
4
11
1.29
67638978--67639091
44
2.6
44
80
2
122
25
24
21
28
1.99
67639227--67639627
87
4.6
87
90
0
606
24
24
22
27
2.00
67639227--67639729
174
3.0
172
86
4
663
24
24
23
28
2.00
67639472--67639608
42
3.2
43
64
13
100
23
23
26
27
2.00
67639557--67639699
72
2.0
72
90
0
223
24
20
25
30
1.99
67646947--67646986
20
2.0
21
85
5
55
70
12
5
12
1.33
67647724--67647758
17
2.0
18
88
5
54
22
0
11
65
1.24
67649717--67649762
17
2.7
17
89
0
74
45
6
0
47
1.28
67653944--67654011
30
2.2
31
84
2
84
26
17
7
48
1.73
67663434--67663484
22
2.3
22
86
6
68
33
13
21
29
1.92
67670077--67670112
19
1.9
19
88
5
56
19
16
41
22
1.90
67670153--67670199
21
2.2
21
84
0
58
25
21
31
21
1.98
67671019--67671064
17
2.7
17
84
15
60
71
0
6
21
1.08
67671440--67671488
25
2.0
24
91
0
71
44
6
26
20
1.74
67674605--67674666
28
2.2
28
88
0
88
30
29
8
32
1.86
67676828--67676924
25
3.8
25
81
5
113
23
24
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67681050--67681122
30
2.4
30
86
4
94
23
17
27
31
1.97
67685248--67685584
51
6.6
51
74
10
255
26
17
24
30
1.97
67685402--67685586
101
1.8
102
84
3
257
25
17
24
32
1.97
67685248--67685593
152
2.3
151
88
2
523
26
17
25
30
1.97
67685508--67685588
26
3.2
26
64
22
62
24
13
27
34
1.93
67686607--67686639
15
2.2
15
100
0
66
18
0
30
51
1.46
67691081--67691417
51
6.7
50
74
7
232
25
16
26
31
1.97
67691081--67691313
101
2.3
101
84
4
274
25
15
27
32
1.95
67691233--67691417
101
1.8
102
83
3
248
25
17
24
31
1.97
67691079--67691419
152
2.2
152
92
1
549
25
16
26
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313