Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  215  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66134300--66134344
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15
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12
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0
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12
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1.80
66188546--66188602
19
3.1
19
71
19
66
28
12
14
45
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
48
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0
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16
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1.8
104
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20
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2
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1.9
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27
22
25
2.00
66205616--66205859
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6.1
40
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27
22
25
2.00
66212143--66212592
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49
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26
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66219555--66219673
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222
22
23
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23
2.9
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10
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27
1.71
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22
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2
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10
52
47
0
11
40
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43
0
12
44
1.42
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40
3.6
39
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11
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19
34
1.95
66235531--66235682
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1.9
80
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27
19
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1.95
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2
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28
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1.99
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3.8
24
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92
18
15
16
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2.2
20
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18
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2
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1.10
66250757--66250790
13
2.6
13
86
13
52
73
5
8
11
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.35
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2.0
96
98
0
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22
19
1.96
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19
2.1
19
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2
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12
1.09
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31
2.1
31
94
0
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7
15
1.23
66257505--66257570
12
5.8
12
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18
70
69
4
7
18
1.29
66257535--66257568
13
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13
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13
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11
1.24
66257518--66257556
18
2.2
18
86
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53
76
2
7
12
1.09
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19
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1.95
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5
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1.96
66319603--66319780
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164
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137
30
28
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1.96
66327750--66327927
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1.96
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27
6.6
27
77
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137
30
28
15
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66337381--66337558
54
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7
164
30
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15
25
1.96
66340370--66340483
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2.7
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11
144
31
29
17
21
1.96
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28
25
26
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22
22
17
1.94
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131
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22
23
17
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1.9
19
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0
56
78
2
2
16
0.98
66358788--66358899
27
4.1
27
82
7
104
38
22
22
16
1.93
66358788--66358899
54
2.1
54
83
6
138
38
22
22
16
1.93
66359005--66359097
28
3.3
28
95
0
159
31
6
26
35
1.82
66366742--66366829
42
2.1
42
97
0
167
34
12
20
32
1.90
66373774--66374156
116
3.3
116
96
0
694
39
3
8
47
1.51
66377178--66377715
126
4.3
125
90
1
826
26
21
18
33
1.96
66377178--66377723
251
2.2
252
89
0
842
26
21
18
33
1.96
66377832--66378006
95
1.8
98
85
6
250
40
14
1
43
1.56
66386228--66386396
48
3.6
48
75
3
146
28
21
26
23
1.99
66386320--66386492
49
3.5
48
75
9
138
31
20
26
21
1.98
66394034--66394206
94
1.8
94
90
2
276
30
16
30
23
1.96
66394041--66394207
48
3.5
46
76
11
169
30
16
29
23
1.96
66395306--66395380
21
3.5
21
75
3
69
38
25
20
16
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66395306--66395392
23
4.0
23
72
17
67
37
24
20
17
1.93
66397321--66397497
49
3.6
49
79
8
157
27
18
28
25
1.98
66398731--66399235
169
3.0
169
99
0
992
28
14
18
38
1.90
66403451--66403537
44
2.0
43
93
4
140
35
21
13
27
1.92
66404948--66405031
26
3.3
26
70
9
75
33
7
29
29
1.84
66406426--66406455
16
1.9
16
93
6
53
30
6
10
53
1.60
66406722--66406746
13
1.9
13
100
0
50
48
4
0
48
1.20
66407492--66407519
3
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3
100
0
56
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0
32
0
0.91
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23
2.1
23
100
0
96
54
25
0
20
1.45
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24
3.8
24
89
0
128
34
28
14
23
1.93
66412821--66412846
10
2.6
10
100
0
52
7
0
0
92
0.39
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10
2.7
10
100
0
54
40
0
7
51
1.30
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30
2.0
30
96
0
111
31
23
10
35
1.88
66428273--66428342
27
2.5
28
90
2
106
24
12
31
31
1.93
66428273--66428355
27
3.0
27
84
5
78
27
12
27
32
1.92
66432817--66433039
40
5.6
40
86
3
236
24
21
27
26
1.99
66432892--66433074
79
2.3
80
82
1
226
25
20
27
25
1.99
66439346--66439467
28
4.4
28
89
2
165
27
12
27
33
1.92
66439346--66439467
55
2.2
57
86
2
167
27
12
27
33
1.92
66439371--66439481
28
4.0
27
89
3
98
30
11
24
33
1.91
66440744--66440820
38
2.0
38
97
0
145
38
18
15
27
1.91
66442598--66442678
26
3.2
26
65
19
71
29
28
14
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66442557--66442742
50
3.8
48
79
11
182
28
27
17
26
1.98
66442557--66442741
101
1.9
97
85
4
253
28
27
17
26
1.98
66447332--66447409
29
2.7
28
84
11
104
25
14
30
29
1.94
66447362--66447690
175
1.9
174
95
0
595
30
14
24
31
1.94
66452674--66452920
50
4.8
51
80
7
241
28
21
27
22
1.99
66452674--66452905
100
2.2
104
82
8
271
29
22
26
21
1.99
66456599--66456631
17
1.9
17
93
0
57
27
15
18
39
1.90
66460310--66460501
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3.7
50
82
8
204
26
22
29
22
1.99
66461018--66461066
26
1.9
25
83
4
62
38
4
18
38
1.70
66463120--66463157
18
2.1
18
90
0
58
52
13
7
26
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313