Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  64  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21651958--21652003
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2.0
23
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0
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19
4
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1.64
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0
0
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0
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25
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1.67
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2.2
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1.86
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2.1
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15
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0
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5
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1.54
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0
0
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19
2.2
19
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16
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2.0
68
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2.0
35
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14
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0
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2.2
54
95
0
207
44
9
4
41
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
90
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0
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20
1.96
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33
2.4
32
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14
95
25
3
10
59
1.47
21733702--21733747
24
2.0
23
83
12
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1.32
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18
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18
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6
0
26
1.16
21734620--21734663
19
2.4
19
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11
56
65
6
0
27
1.17
21735533--21735589
24
2.4
24
96
0
105
28
43
12
15
1.83
21741610--21741663
21
2.6
21
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24
11
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1.90
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27
23
17
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4.0
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2.1
110
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10
19
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9
20.7
9
67
18
60
61
3
2
32
1.25
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29
2.2
30
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53
3
3
40
1.32
21761971--21762057
19
4.4
20
72
15
65
65
3
2
28
1.21
21761987--21762039
20
2.7
20
75
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56
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1
3
32
1.24
21763303--21763337
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5
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0
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77
0
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0
0.78
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28
2.1
28
84
12
75
34
0
1
63
1.04
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3.7
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6
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1.75
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2.6
22
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17
5
36
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19
4.8
19
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166
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15
11
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1.83
21778812--21778908
36
2.6
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90
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155
35
16
10
38
1.83
21779487--21780608
132
8.4
132
94
1
1839
26
24
17
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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24
18
30
1.97
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1.8
147
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25
18
29
1.98
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1
15
0
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0.75
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7.8
6
79
15
53
2
14
0
82
0.75
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2.9
18
88
2
81
1
16
0
81
0.78
21781523--21781579
13
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12
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1
15
0
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19
9
34
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19
5.2
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7
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10
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17
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1.82
21786911--21787008
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88
9
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15
10
37
1.81
21786922--21787018
36
2.6
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11
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2
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18
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24
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21804246--21804446
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2.3
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83
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246
25
18
30
24
1.98
21804251--21804446
43
4.6
43
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3
171
25
19
30
25
1.98
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18
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1.76
21810400--21810618
9
25.1
9
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14
124
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0
16
46
1.51
21810384--21810618
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1.53
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29
2.3
28
85
7
98
55
0
0
44
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21810795--21810857
15
4.1
16
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15
53
52
0
0
47
1.00
21810633--21811213
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3.0
195
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50
6
9
34
1.61
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20
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19
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15
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50
6
0
42
1.28
21810992--21811074
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39
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51
4
0
43
1.23
21810994--21811059
20
3.3
20
73
12
73
54
3
0
42
1.15
21811011--21811077
19
3.5
19
74
11
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52
5
0
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1.26
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5
5
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16
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0
59
55
11
14
17
1.68
21814286--21814336
19
2.7
19
90
0
84
41
11
41
5
1.66
21814496--21814541
21
2.1
22
84
4
58
43
2
36
17
1.61
21814708--21814991
115
2.5
115
78
6
299
35
20
15
27
1.93
21815453--21815493
7
5.7
7
85
5
55
21
0
34
43
1.53
21816867--21816950
41
2.0
41
88
4
125
9
22
17
50
1.75
21819130--21819183
25
2.1
25
83
16
67
62
3
7
25
1.38
21819376--21819433
26
2.3
25
85
11
82
63
0
3
32
1.11
21819366--21819485
16
7.2
16
67
20
52
63
0
4
31
1.19
21821549--21821590
19
2.1
21
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23
11
9
54
1.66
21823552--21824201
96
6.8
95
80
6
643
23
29
18
28
1.98
21823552--21824204
144
4.5
144
80
4
676
23
29
18
28
1.98
21823552--21824215
48
13.9
47
79
5
564
23
29
18
28
1.98
21841838--21842201
48
7.6
48
76
5
317
21
27
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21841838--21842204
96
3.8
96
83
6
431
22
27
21
29
1.99
21845544--21845589
22
2.1
22
100
0
92
26
21
21
30
1.99
21862790--21862814
5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
21864483--21864531
23
2.3
21
83
13
64
14
2
14
69
1.28
21864495--21864532
11
3.4
11
80
20
51
10
2
13
73
1.19
21871677--21871714
18
2.1
18
100
0
76
36
0
39
23
1.55
21873957--21873997
14
2.7
16
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11
50
53
0
0
46
1.00
21882084--21882207
39
3.2
39
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0
167
21
20
29
29
1.98
21882084--21882245
39
4.2
39
80
5
132
21
20
29
28
1.98
21882084--21882245
78
2.1
78
81
3
184
21
20
29
28
1.98
21889142--21889249
39
2.8
39
78
0
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22
21
27
28
1.99
21898012--21898218
53
3.8
53
75
5
200
36
16
25
20
1.94
21900548--21900628
39
2.0
40
97
2
155
27
32
7
33
1.84
21920956--21921051
42
2.3
42
83
3
122
21
33
20
23
1.97
21926780--21927004
40
5.6
40
86
3
299
23
22
28
25
1.99
21926784--21927004
83
2.7
80
86
5
286
22
23
28
25
1.99
21934541--21934586
14
3.3
14
84
6
58
56
17
6
19
1.62
21940831--21941424
297
2.0
297
100
0
1188
30
17
20
31
1.96
21946649--21946763
43
2.7
43
78
6
144
33
14
23
28
1.94
21949677--21949713
14
2.5
15
83
16
51
21
40
0
37
1.54
21953694--21953871
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
21953715--21953870
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21961757--21961934
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
21961778--21961933
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
21966214--21966251
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88
21968136--21968409
46
6.0
46
95
0
451
39
14
23
22
1.91
21969006--21969042
18
2.1
18
100
0
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32
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1.80
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49
2.6
49
83
2
141
24
29
17
28
1.98
21973827--21974002
98
1.8
97
81
3
219
26
28
18
26
1.98
21973910--21974005
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2.0
49
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0
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22
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29
1.99
21974023--21974143
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2.6
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2
147
23
30
16
29
1.96
21980562--21980693
49
2.7
48
83
3
167
21
26
21
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313