Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  41  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13945306--13945420
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1.9
60
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0
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1.18
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1.9
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12
1.25
13950992--13951058
24
2.9
24
87
10
95
74
8
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11
1.19
13954111--13954162
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2.3
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21
26
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1.99
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120
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3.2
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27
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10
3.8
10
90
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60
33
17
15
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14029632--14029671
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1.9
21
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0
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35
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32
1.91
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2.8
25
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0
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25
24
22
27
2.00
14029716--14029799
25
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24
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22
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14033640--14033670
16
2.0
15
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32
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0
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2.1
13
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9
13
13
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14054086--14054154
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5.5
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20
28
1.99
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2.9
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89
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400
28
22
21
28
1.99
14057706--14057991
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5.7
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13
203
28
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20
27
1.99
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3.3
101
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294
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23
19
27
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2.0
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8
82
22
23
20
32
1.98
14067937--14068033
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3.2
30
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2
88
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1.94
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1.8
260
99
0
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28
27
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14074730--14074794
20
3.3
19
73
16
51
38
16
21
23
1.93
14076571--14076633
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1.9
33
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12
85
12
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55
1.60
14076631--14076686
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5
51
8
17
1
71
1.21
14076630--14076686
14
4.1
14
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16
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17
1
71
1.19
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18
5.6
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73
10
84
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18
3
71
1.24
14076648--14076755
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17.7
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18
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71
1.23
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9
3.2
9
90
9
51
13
0
3
83
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14082860--14083096
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4.8
49
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278
26
16
26
30
1.97
14082856--14083083
100
2.3
98
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3
287
25
17
26
30
1.97
14085802--14085835
15
2.2
16
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5
61
11
11
17
58
1.62
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49
4.7
50
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2
308
25
18
27
29
1.98
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2.1
44
97
0
177
29
17
19
34
1.94
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67
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32
17
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22
1.96
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16
1.9
15
93
6
51
40
10
16
33
1.82
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11
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30
26
20
23
1.99
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1.8
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2
247
29
26
20
23
1.99
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46
2.9
46
68
19
107
29
27
20
23
1.99
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2.4
43
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25
14
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1.94
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15
26
1.96
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211
32
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14
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1.95
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10
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18
18
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18
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3.6
25
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46
16
18
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1.85
14114206--14114269
19
3.7
19
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46
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17
18
1.84
14114409--14114482
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37
21
22
17
1.94
14114641--14114705
22
3.0
22
80
8
78
33
23
23
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14115146--14115345
27
7.7
27
77
13
125
24
20
21
34
1.97
14115132--14115346
54
4.1
54
79
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236
24
20
21
34
1.97
14115161--14115345
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2.4
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9
243
23
20
21
35
1.96
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7.0
27
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207
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5
21
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1.76
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81
2.1
80
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223
23
19
22
35
1.96
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2.5
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81
7
209
24
16
21
37
1.93
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234
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21
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1.77
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54
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1
241
30
6
22
41
1.78
14115330--14115662
27
12.6
27
73
9
197
30
7
21
40
1.80
14115355--14115514
81
2.0
81
90
2
250
30
5
21
43
1.74
14115384--14115534
81
1.9
81
88
2
232
31
5
22
41
1.76
14115367--14115550
81
2.3
81
83
3
228
32
5
22
39
1.78
14119561--14119651
29
3.2
29
81
6
89
28
29
14
27
1.95
14120909--14121950
49
21.4
49
98
0
1945
28
29
7
34
1.85
14126676--14126727
27
1.9
27
92
0
86
25
25
11
38
1.89
14126825--14126964
31
4.5
31
78
8
126
27
26
15
30
1.95
14126817--14126964
62
2.4
62
82
4
174
28
26
15
29
1.96
14126957--14127069
33
3.5
30
77
16
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27
23
11
37
1.90
14126986--14127069
33
2.6
32
80
12
98
25
22
11
40
1.88
14128759--14128835
31
2.5
30
75
6
73
57
6
0
36
1.25
14132315--14132385
28
2.5
29
86
2
99
30
30
15
22
1.95
14132487--14132511
9
2.8
9
100
0
50
20
36
12
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14135484--14136395
47
19.4
47
98
0
1725
32
8
29
29
1.87
14136514--14136592
37
2.1
37
88
4
115
25
18
30
25
1.98
14144604--14144655
25
2.1
25
96
0
95
21
21
26
30
1.98
14147038--14147082
20
2.2
20
88
0
63
35
13
0
51
1.41
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21
2.0
21
100
0
84
47
14
9
28
1.75
14153237--14153275
19
2.1
19
85
0
51
71
7
5
15
1.26
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28
2.2
29
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8
94
31
23
22
22
1.98
14153907--14153967
28
2.2
28
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0
95
32
8
27
31
1.86
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19
2.1
19
85
0
51
69
5
7
17
1.32
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2.3
28
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0
103
32
7
27
32
1.85
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79
2.3
81
82
7
218
24
21
27
26
1.99
14164231--14164415
40
4.7
40
82
6
216
24
21
27
26
1.99
14164284--14164448
79
2.1
79
82
6
192
26
20
27
26
1.99
14174756--14174805
26
2.0
24
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7
73
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6
0
30
1.18
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1.9
35
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63
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0
24
1.28
14174881--14174913
15
2.1
16
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0
0
30
0.88
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2.4
28
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2
89
19
24
22
33
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23
2.5
23
88
0
87
43
0
12
43
1.41
14179522--14179564
13
3.5
13
75
18
56
37
0
13
48
1.43
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12
4.6
13
69
20
50
5
28
0
66
1.13
14180154--14180204
18
2.8
18
75
18
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5
29
0
64
1.17
14181431--14181543
28
4.1
28
83
1
147
18
23
19
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14181431--14181543
56
2.0
55
87
1
163
18
23
19
38
1.93
14183968--14184208
94
2.6
94
94
0
419
39
18
10
31
1.85
14191367--14191642
94
2.9
94
94
0
471
39
19
10
29
1.86
14193628--14193751
27
4.6
27
92
2
167
31
28
13
26
1.94
14193628--14193751
55
2.3
54
91
1
194
31
28
13
26
1.94
14206290--14206583
50
5.8
50
79
3
277
30
24
18
26
1.98
14206351--14206532
101
1.8
101
92
0
310
28
25
19
25
1.99
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1.9
151
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405
31
25
17
25
1.97
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2.1
34
82
5
85
35
20
19
24
1.95
14211460--14211634
46
3.8
45
76
7
172
30
29
18
21
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313