Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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This is table  272  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83145272--83145492
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142
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0
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1.98
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0
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0
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15
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83187702--83187894
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2.4
82
82
5
221
37
25
18
17
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2.0
25
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69
6
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2
1.21
83204422--83204505
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2.2
37
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2.2
26
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0
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83215585--83215646
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2.4
26
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6
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3.4
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33
0
1
64
1.05
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2.1
85
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2
2
35
1.24
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10
3.3
10
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4
50
61
0
0
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23
18
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2.1
28
100
0
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10
27
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
74
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229
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14
20
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1.91
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2.0
22
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11
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2.1
15
94
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18
28
1.94
83265301--83265748
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443
35
17
18
28
1.94
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3.3
132
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34
17
18
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1.94
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1.95
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18
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1.94
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1.94
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0
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1.94
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33
2.2
32
82
7
83
26
6
15
51
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83290658--83290698
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55
19
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2.1
17
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0
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0
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0
0.76
83300103--83300136
17
2.0
17
94
0
59
79
0
20
0
0.73
83301361--83301601
46
5.2
46
93
0
401
26
17
25
31
1.97
83301596--83302167
131
4.3
132
90
0
824
31
16
23
28
1.96
83301698--83302038
44
7.8
44
67
17
147
30
16
24
27
1.97
83301587--83302167
263
2.2
263
88
0
838
31
16
23
28
1.96
83302855--83302902
23
2.2
21
81
7
51
6
12
2
79
1.01
83303581--83303610
12
2.5
12
94
0
51
30
0
6
63
1.20
83303690--83303746
18
3.2
18
80
5
62
31
3
1
63
1.22
83304131--83304161
15
2.1
15
93
0
53
19
9
6
64
1.45
83304216--83304537
109
3.0
109
90
1
497
31
15
17
35
1.91
83309973--83309997
13
1.9
13
100
0
50
4
96
0
0
0.24
83309972--83310000
14
2.1
14
100
0
58
6
93
0
0
0.36
83317668--83317855
96
2.0
96
83
0
241
36
14
17
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83324381--83324497
61
1.9
61
84
5
155
35
12
9
41
1.76
83326891--83326987
37
2.6
39
77
18
100
41
3
4
51
1.36
83335275--83335331
24
2.6
20
76
17
51
3
10
5
80
0.98
83335294--83335333
14
2.8
16
82
17
52
5
12
2
80
0.98
83340376--83340444
6
11.7
6
83
9
70
69
10
7
13
1.36
83340367--83340446
23
3.5
22
77
11
79
70
10
6
13
1.34
83340435--83340481
21
2.3
21
85
7
62
74
2
21
2
1.03
83341333--83341364
14
2.2
15
94
5
57
78
0
9
12
0.97
83341324--83341365
21
2.0
22
85
4
59
73
0
11
14
1.09
83342625--83342920
44
6.7
44
88
0
405
29
21
24
23
1.99
83342883--83343875
129
7.7
129
92
0
1535
32
19
23
24
1.97
83346538--83346584
23
2.0
23
87
0
67
38
4
19
38
1.71
83346891--83346945
24
2.2
25
80
6
67
38
21
25
14
1.92
83347082--83347141
24
2.4
25
83
8
79
33
21
26
18
1.96
83347094--83347164
24
2.9
24
79
4
70
35
19
25
19
1.96
83353173--83353212
19
2.2
19
86
4
55
70
5
7
17
1.30
83358160--83358189
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
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136
2.0
136
100
0
544
44
17
13
25
1.85
83365449--83365509
6
10.7
6
79
11
58
70
9
4
14
1.31
83365461--83365515
27
2.0
27
82
6
67
74
7
5
12
1.20
83365438--83365556
46
2.6
45
79
10
109
72
7
10
10
1.29
83366498--83366549
7
7.7
7
87
8
81
67
0
17
15
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83366498--83366549
13
3.9
14
90
7
81
67
0
17
15
1.24
83366498--83366549
20
2.6
20
96
0
95
67
0
17
15
1.24
83367741--83368908
175
6.7
175
85
4
1482
30
19
22
27
1.98
83368135--83368689
304
1.8
304
93
0
959
30
19
22
27
1.98
83368401--83369036
219
2.9
218
94
0
1042
29
18
23
28
1.98
83368137--83368818
304
2.2
302
84
4
845
30
19
22
27
1.98
83367741--83368978
44
28.3
43
69
12
607
30
19
22
27
1.98
83369371--83369410
16
2.5
17
84
11
50
55
35
5
5
1.44
83382517--83382573
21
2.7
20
84
10
78
70
0
5
24
1.08
83382505--83382553
17
2.8
17
85
14
64
67
0
6
26
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313