Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  62  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20988357--20988433
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3.4
22
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20988380--20988470
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22
26
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20994309--20994533
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21
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3.2
80
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251
25
21
27
25
1.99
20994309--20994566
119
2.2
119
81
6
283
25
21
27
25
1.99
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33
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24
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20997015--20997132
54
2.2
54
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157
26
18
16
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1.9
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18
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20997045--20997159
54
2.1
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2.0
80
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174
29
17
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2.1
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50
0
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30
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2.7
27
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20
4
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23
2.0
23
88
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10
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21026825--21026858
17
1.9
18
88
5
52
50
0
20
29
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21026963--21027016
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14
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14
56
48
0
5
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1.25
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15
4.1
14
80
10
66
74
1
5
18
1.09
21027470--21027517
9
5.1
9
79
18
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75
0
4
20
0.97
21027467--21027527
29
2.1
30
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73
1
4
19
1.10
21028081--21028152
27
2.7
27
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20
4
36
38
1.72
21028615--21028733
56
2.1
56
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1
220
34
1
19
44
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21031118--21031280
64
2.6
64
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204
23
30
21
25
1.99
21032165--21032200
14
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1.54
21037807--21037845
14
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13
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51
17
0
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79
0.84
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5
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11
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0
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0.80
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2.0
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2
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24
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25
23
22
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1.99
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23
22
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16
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38
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1.73
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21
2.0
21
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8
61
13
25
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1.90
21047878--21047922
21
2.1
21
84
8
56
11
22
40
26
1.87
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27
2.7
27
80
0
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21
2.8
20
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2
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30
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33
2.1
33
97
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129
40
13
11
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1.80
21071556--21071712
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3.7
43
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28
15
24
1.96
21076759--21076907
61
2.4
62
73
15
148
32
24
11
31
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21086273--21086649
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1.8
207
95
0
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16
34
1.94
21093329--21093411
34
2.4
34
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9
89
18
14
31
36
1.90
21094615--21094749
40
3.4
40
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2
146
36
18
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20
1.95
21094690--21094756
20
3.3
20
74
15
75
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19
25
17
1.94
21094654--21094766
40
2.8
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154
33
19
27
19
1.96
21097631--21097760
24
5.4
24
93
4
208
27
20
21
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1.98
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20
3.0
20
94
0
109
30
22
13
33
1.92
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1.9
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117
20
30
22
25
1.98
21125355--21125463
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2.5
43
82
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121
26
28
21
23
1.99
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2.4
28
90
0
100
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25
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1.95
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2.0
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28
1.90
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2.5
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4
113
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21
20
30
1.98
21155577--21155733
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142
25
22
22
29
1.99
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2.0
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22
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1.69
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3.7
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133
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21
26
29
1.99
21168449--21168612
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140
22
21
26
29
1.99
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116
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1.66
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1.65
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100
25
26
33
14
1.94
21175398--21175448
25
2.0
26
84
3
68
41
9
11
37
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21175649--21175755
19
5.8
18
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2
2
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1.30
21181580--21181683
19
5.6
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20
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3
41
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0
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1.00
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0
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90
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90
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0
383
41
20
17
19
1.90
21192209--21192245
5
7.2
5
87
6
56
40
21
0
37
1.54
21192196--21192245
15
3.2
16
81
13
61
40
20
0
40
1.52
21194834--21194858
8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
21194836--21194903
29
2.3
31
80
14
81
60
2
0
36
1.12
21194838--21194909
31
2.4
30
73
22
71
61
2
0
36
1.11
21195395--21195443
26
2.0
24
88
8
71
63
4
0
32
1.13
21195414--21195472
21
2.8
22
82
7
61
67
6
1
23
1.24
21197078--21197181
52
2.0
52
100
0
208
48
7
5
38
1.56
21200811--21200853
16
2.7
15
78
7
50
32
25
0
41
1.56
21201158--21201210
16
3.3
15
84
10
61
43
1
26
28
1.65
21201379--21201521
29
5.0
26
70
20
81
51
3
1
44
1.27
21201393--21201521
58
2.2
59
87
4
181
51
3
0
43
1.25
21201393--21201536
59
2.4
58
85
6
184
52
3
1
42
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21201393--21201553
59
2.8
55
78
11
128
52
3
1
41
1.30
21204028--21204052
11
2.3
11
100
0
50
20
0
36
44
1.52
21207209--21207249
2
20.5
2
100
0
82
48
0
51
0
1.00
21208954--21208992
19
2.1
19
95
0
69
33
5
17
43
1.72
21209129--21209168
17
2.3
19
83
16
59
60
0
0
40
0.97
21210653--21210761
57
1.9
57
90
0
173
29
11
15
43
1.83
21214690--21214803
43
2.7
43
83
1
158
21
17
30
30
1.96
21227139--21227196
25
2.4
25
85
2
73
72
0
5
22
1.04
21227155--21227215
25
2.5
23
80
12
68
63
0
8
27
1.22
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10
167
30
22
15
30
1.95
21237879--21238051
27
6.4
27
84
0
193
34
19
20
25
1.96
21237879--21238051
81
2.1
81
84
0
220
34
19
20
25
1.96
21237879--21238036
54
2.9
54
88
0
226
34
19
20
25
1.96
21238703--21238754
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
21240819--21240878
17
3.4
17
77
20
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50
5
1
43
1.34
21244505--21244655
55
2.7
56
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7
157
26
27
20
25
1.99
21253287--21253604
43
7.5
43
74
9
267
25
20
25
28
1.99
21253284--21253604
85
3.8
85
90
0
482
25
20
25
28
1.99
21254050--21254117
20
3.3
20
66
18
59
30
7
26
35
1.84
21254045--21254129
41
2.1
41
100
0
170
29
7
27
36
1.83
21260489--21260513
9
2.8
9
100
0
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52
0
24
24
1.48
21260801--21261003
43
4.8
42
72
11
155
25
19
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21260801--21260999
85
2.3
85
89
0
299
25
19
26
28
1.99
21260801--21261024
85
2.6
85
85
2
227
27
18
25
28
1.98
21266013--21266045
16
2.1
16
100
0
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39
6
6
48
1.53
21270924--21271054
48
2.7
48
79
1
136
28
19
25
26
1.99
21281199--21281244
19
2.4
19
96
0
83
28
30
28
13
1.94
21293657--21294244
299
2.0
297
96
1
1079
38
13
18
28
1.89
21296107--21296284
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
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1.9
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88
3
233
29
28
15
26
1.96
21304170--21304347
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
21304191--21304346
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313