Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  250  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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55
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.96
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139
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107
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1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.93
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2.0
20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77076034--77076113
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0
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77113674--77113721
23
2.1
23
84
0
60
18
4
35
41
1.70
77113867--77113974
42
2.6
40
89
2
153
21
23
3
51
1.63
77120272--77120305
17
1.9
18
88
5
52
38
11
5
44
1.65
77126473--77126537
32
2.1
32
97
2
123
30
9
12
47
1.72
77126840--77126870
4
8.0
4
92
7
55
25
0
0
74
0.82
77142171--77142207
18
2.0
19
89
5
58
2
62
0
35
1.10
77142169--77142210
18
2.4
17
84
11
57
2
57
0
40
1.12
77142695--77142724
1
30.0
1
93
0
51
0
3
0
96
0.21
77142692--77142724
12
2.8
12
95
4
59
0
6
0
93
0.33
77142690--77142724
14
2.5
14
90
9
54
0
8
0
91
0.42
77146572--77146675
43
2.5
42
90
1
154
26
15
28
28
1.96
77146563--77146727
43
3.9
42
75
12
149
29
14
25
30
1.95
77149223--77149351
69
1.9
69
91
1
215
20
24
5
49
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77149488--77149543
21
2.6
21
91
5
85
21
30
1
46
1.62
77166648--77166814
90
1.9
90
81
7
205
35
14
20
28
1.92
77166612--77166832
90
2.5
91
71
10
204
36
13
20
29
1.90
77176657--77177203
276
2.0
276
96
0
1015
30
12
23
32
1.92
77180608--77180789
50
3.5
50
79
6
159
28
21
26
23
1.99
77180660--77180800
50
2.8
50
80
0
165
27
21
27
22
1.99
77180613--77180847
50
4.6
50
77
5
143
28
22
25
22
1.99
77182663--77182695
16
2.1
16
94
0
57
6
0
21
72
1.05
77187924--77187992
31
2.2
31
92
0
111
40
14
14
30
1.86
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11
3.2
11
91
0
61
17
34
2
45
1.63
77188459--77188509
22
2.3
22
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6
68
23
33
1
41
1.66
77188473--77188570
51
1.9
51
87
4
144
26
25
2
45
1.64
77190911--77190950
7
5.9
7
85
14
57
47
0
0
52
1.00
77191105--77191158
15
3.8
15
71
14
60
46
29
0
24
1.53
77190967--77191128
22
7.5
22
89
2
231
44
29
1
25
1.62
77190975--77191135
86
1.9
87
89
3
256
42
29
1
26
1.63
77190967--77191158
64
3.0
63
81
8
185
44
29
1
25
1.61
77190967--77191157
22
8.6
22
82
7
199
44
29
1
25
1.61
77190967--77191158
86
2.2
84
83
10
213
44
29
1
25
1.61
77191170--77191204
18
1.9
18
88
0
52
48
34
0
17
1.47
77191362--77191524
37
4.4
38
69
15
115
45
7
6
39
1.60
77191372--77192092
53
13.2
51
75
13
495
45
7
6
40
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77191309--77192114
112
7.3
106
77
11
746
45
7
6
40
1.58
77191207--77192114
165
5.5
165
99
0
1807
45
7
6
39
1.59
77191527--77191689
37
4.4
38
69
15
115
45
7
6
39
1.60
77191692--77191854
37
4.4
38
69
15
115
45
7
6
39
1.60
77191857--77192019
37
4.4
38
69
15
115
45
7
6
39
1.60
77195098--77195402
124
2.4
125
90
1
479
30
20
18
30
1.96
77195530--77195575
22
2.1
21
88
4
65
50
32
0
17
1.47
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2.0
27
96
0
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12
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1.92
77200130--77200194
32
2.0
32
100
0
130
27
3
24
44
1.68
77204212--77204249
16
2.4
16
86
0
58
44
2
5
47
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313