Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  121  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Score
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35
14
21
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39262930--39263198
98
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98
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0
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34
14
22
28
1.93
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3.0
37
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177
35
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22
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1.95
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53
17
0
51
30
1.46
39285570--39285624
20
2.8
20
78
10
53
16
0
52
30
1.44
39285571--39285632
6
9.8
6
79
11
54
16
0
50
33
1.45
39285489--39285803
107
3.1
101
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7
409
24
1
33
40
1.65
39285712--39285867
82
1.9
82
95
0
285
25
0
28
45
1.58
39285857--39285915
14
4.4
14
74
16
54
22
0
47
30
1.51
39285861--39285925
20
3.3
19
79
14
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21
1
46
30
1.61
39286319--39286524
84
2.4
83
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5
198
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1.92
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27
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1.94
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3.0
43
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5
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15
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39293291--39293346
4
14.0
4
92
0
94
23
1
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48
1.61
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14
4.0
14
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17
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39
0
0
60
0.97
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16
4.2
16
96
3
129
24
0
37
37
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39319750--39319818
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2.1
32
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2
129
24
0
37
37
1.56
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45
2.0
45
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2
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27
6
28
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1.82
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18
2.0
17
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5
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54
0
0
45
0.99
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18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
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120
4.3
121
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1
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5
2
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1.39
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240
2.1
240
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0
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4
2
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1.38
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2.0
206
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48
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3
159
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10
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45
3
0
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1.16
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0
0
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1.00
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2.0
26
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0
0
50
1.00
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26
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0
0
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1.00
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0
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203
41
2
5
51
1.36
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120
2.2
120
99
0
531
41
1
4
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1.32
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12
2.1
12
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0
50
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0
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18
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64
0
0
35
0.94
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1
0
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30
2.2
30
81
0
80
29
32
22
14
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39371785--39371919
54
2.5
54
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4
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25
23
29
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1.99
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21
1.9
21
90
10
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65
0
2
32
1.06
39375787--39375832
19
2.4
21
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20
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58
4
0
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1.18
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19
2.3
19
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22
2
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68
1.25
39376071--39376141
20
3.4
19
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22
63
22
1
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70
1.16
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0
0
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1
5
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1.22
39416612--39416672
31
2.0
31
87
6
88
39
24
18
18
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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