Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  11  of  313  ( 37448 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3565978--3566019
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2
2
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2.0
30
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205
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1.96
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1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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1.96
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27
6.6
27
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3
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26
15
28
29
1.96
3626352--3626507
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
3626348--3626528
82
2.2
81
83
2
229
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15
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0
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14
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2.8
24
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2.2
28
97
0
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14
19
31
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
283
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10
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2
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2.4
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22
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0
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1.92
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3.0
45
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35
14
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1.93
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14
2.3
15
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5
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1.79
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16
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1.97
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1.98
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17
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26
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13
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30
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87
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29
20
21
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1.98
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19
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19
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3
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1.10
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6.0
14
78
12
70
26
8
1
64
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3697053--3697189
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4.6
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8
2
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1.34
3697114--3697159
15
2.9
15
93
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74
26
8
0
65
1.21
3697053--3697182
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2.8
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17
133
27
7
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1.35
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3
59.3
3
82
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200
32
3
1
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5
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13
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27
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1.67
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0
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50
0
2
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9
4.9
9
86
8
63
77
4
0
18
0.94
3726958--3727011
16
3.1
17
86
7
65
77
5
0
16
0.94
3727119--3727167
3
16.7
3
76
19
50
0
32
0
67
0.91
3727120--3727171
12
4.5
12
76
16
56
0
30
0
69
0.89
3727120--3727175
17
3.1
17
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17
60
0
30
0
69
0.89
3727119--3727208
21
4.3
21
88
1
137
2
31
0
66
1.04
3727119--3727174
9
5.2
12
70
25
54
0
32
0
67
0.91
3727468--3727511
9
4.9
9
86
8
63
77
4
0
18
0.94
3727468--3727521
16
3.1
17
86
7
65
77
5
0
16
0.94
3727629--3727677
3
16.7
3
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19
50
0
32
0
67
0.91
3727630--3727681
12
4.5
12
76
16
56
0
30
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3727630--3727685
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3.1
17
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17
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0
30
0
69
0.89
3727629--3727718
21
4.3
21
88
1
137
2
31
0
66
1.04
3727629--3727684
9
5.2
12
70
25
54
0
32
0
67
0.91
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510
2.0
510
99
0
2028
28
25
13
32
1.94
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19
2.5
20
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14
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20
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10
1
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1.9
27
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0
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30
2.2
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2.0
54
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3
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2.0
30
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12
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1.9
38
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0
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27
2
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38
2.2
38
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48
2.5
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1.99
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61
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120
2.3
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2
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2.0
17
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45
0
0
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2.0
45
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2
121
37
28
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27
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16
4.2
16
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37
37
0
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3741939--3742007
33
2.1
32
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2
129
37
37
0
24
1.56
3742811--3742839
12
2.4
12
100
0
58
31
0
51
17
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3749205--3749230
5
5.2
5
100
0
52
38
19
19
23
1.93
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4.0
15
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4
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42
0
23
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1.55
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55
2.4
55
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5
136
27
26
27
17
1.98
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3.1
19
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31
0
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20
2.3
19
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0
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1.09
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20
2.6
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0
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64
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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