Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  281  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85862960--85863019
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26
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
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Indels
Score
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T
Entropy
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2.0
29
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3
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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254
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30
2.1
30
83
8
78
60
9
1
28
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86045022--86045299
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2.0
141
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86063264--86063311
25
2.0
23
92
8
78
37
8
6
47
1.59
86063454--86063502
18
2.6
19
77
6
55
46
16
12
24
1.81
86063498--86063548
18
2.9
17
77
8
57
47
7
9
35
1.66
86064033--86064089
26
2.2
26
93
0
96
7
29
42
21
1.79
86064196--86064239
19
2.3
19
84
4
52
4
13
11
70
1.31
86064196--86064249
22
2.6
21
82
11
58
3
12
12
70
1.30
86064205--86064252
21
2.4
19
83
13
60
2
8
12
77
1.08
86064706--86064823
59
2.0
60
94
1
211
32
22
23
21
1.98
86064863--86064979
30
3.9
29
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11
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44
3
22
29
1.69
86064878--86064979
30
3.4
30
84
2
134
44
3
22
29
1.71
86064975--86065011
15
2.4
16
90
4
58
27
0
2
70
1.01
86064957--86065260
154
2.0
152
96
2
558
32
13
14
39
1.85
86065125--86065153
15
1.9
15
100
0
58
24
0
0
75
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86065126--86065165
20
2.0
20
90
5
62
22
0
2
75
0.93
86065407--86065656
53
4.7
54
90
6
386
35
18
15
30
1.92
86065667--86065699
13
2.4
14
95
5
59
69
9
9
12
1.36
86065660--86065707
14
3.5
14
85
5
62
62
8
10
18
1.52
86065779--86066507
146
5.0
144
94
2
1149
33
18
17
30
1.95
86065783--86066521
72
10.2
72
94
2
1135
33
18
17
30
1.94
86078426--86078472
21
2.3
19
80
20
51
34
6
8
51
1.58
86078451--86078888
17
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17
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16
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10
11
33
1.75
86078624--86078897
17
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17
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7
154
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10
12
31
1.75
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22
3.0
22
88
4
96
40
7
7
44
1.62
86078661--86078725
21
3.0
21
90
2
94
40
7
7
44
1.62
86078594--86078765
94
1.9
87
83
8
218
45
8
8
37
1.66
86078849--86078895
18
2.6
18
82
0
58
48
17
12
21
1.79
86078892--86078942
18
2.9
17
77
8
57
47
7
9
35
1.66
86079659--86079775
30
3.9
29
77
11
94
44
3
21
30
1.69
86079674--86079775
30
3.4
30
83
2
125
44
3
21
30
1.70
86079773--86079809
17
2.2
17
95
0
65
18
0
0
81
0.70
86081289--86081318
15
1.9
16
93
6
53
46
46
0
6
1.29
86082829--86082862
8
4.2
8
88
11
52
26
8
2
61
1.40
86083073--86083385
109
2.9
109
94
0
538
30
16
19
34
1.93
86083073--86083394
108
3.0
108
93
0
536
29
16
18
35
1.93
86086131--86086179
25
1.9
27
84
12
68
20
16
8
55
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86086851--86086922
6
11.7
6
82
10
56
69
6
8
15
1.35
86086851--86086902
12
4.3
12
90
0
68
67
5
11
15
1.40
86086887--86086932
21
2.2
21
88
0
65
78
6
4
10
1.08
86086901--86087000
51
1.9
53
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8
134
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6
11
9
1.23
86087438--86087477
20
2.0
20
90
0
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27
10
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86087417--86087493
14
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15
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9
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1.80
86088529--86088559
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13
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67
0
16
16
1.23
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22
27
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2.1
86
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1
282
31
21
21
25
1.98
86090117--86090324
46
4.8
44
77
8
169
29
21
22
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313