Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  25  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8513055--8513262
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2.00
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2.00
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2.0
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27
21
24
1.99
8579066--8579330
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27
21
24
1.99
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1.58
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19
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99
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6.7
40
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7
337
25
22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
26
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0
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2.0
15
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192
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27
25
2.00
8686448--8686632
40
4.7
40
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225
24
22
27
25
2.00
8686501--8686665
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2.1
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201
26
20
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1.99
8693675--8693852
27
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1.9
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224
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8695767--8695970
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2.8
72
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2.1
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2.1
19
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28
2
7
60
1.38
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3
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2.0
88
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331
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2
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1.39
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2.4
11
100
0
52
46
0
0
53
1.00
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18
65
15
62
37
1
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1.29
8700240--8700316
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2.5
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1.20
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137
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4
652
27
8
6
57
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.9
19
94
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0
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0
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10
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1.25
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31
2.3
31
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7
101
44
8
1
45
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2.0
20
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0
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5
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66
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22
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17
23
29
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4.4
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1
1514
29
17
23
29
1.97
8715348--8715402
18
2.9
19
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5
94
38
10
14
36
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8719552--8719658
21
4.8
22
69
22
64
63
2
3
29
1.26
8719519--8719658
57
2.6
54
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19
141
62
2
4
31
1.26
8719698--8719758
23
2.6
22
87
10
77
67
0
1
31
1.01
8721193--8721385
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2.4
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3
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28
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188
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27
18
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1.98
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3.4
41
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11
132
23
27
20
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26
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96
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103
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25
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1.82
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0
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2.1
60
84
5
161
28
25
17
29
1.97
8734910--8734934
12
2.1
12
100
0
50
60
8
0
32
1.26
8738630--8738783
44
3.5
44
88
0
218
27
28
13
30
1.94
8738759--8739210
220
2.1
220
88
1
667
27
22
17
32
1.97
8746002--8746092
22
4.1
22
85
0
119
31
24
28
15
1.95
8746002--8746110
44
2.5
44
86
0
137
33
22
29
14
1.94
8753703--8753733
14
2.2
14
100
0
62
29
22
6
41
1.78
8756245--8757155
40
22.8
40
89
4
1322
25
19
28
25
1.99
8756245--8757144
80
11.3
80
95
2
1499
25
20
28
25
1.99
8760181--8760238
25
2.3
25
100
0
116
20
13
20
44
1.85
8765044--8765314
40
6.8
40
87
1
366
24
22
28
24
1.99
8773679--8773738
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8773777--8773828
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
8784816--8785184
200
1.8
200
88
1
560
38
10
23
27
1.88
8788789--8788868
37
2.2
37
86
4
108
27
31
17
23
1.97
8788999--8789390
47
8.4
47
90
2
567
26
31
9
32
1.89
8789131--8789255
25
5.2
25
61
18
68
27
28
8
35
1.87
8789250--8789324
22
3.3
22
65
17
62
26
33
10
29
1.90
8794481--8794652
93
1.8
93
89
0
272
28
29
20
22
1.98
8794474--8794649
46
3.8
46
74
12
171
29
28
19
21
1.98
8794482--8794668
46
4.0
44
70
16
112
28
28
19
22
1.98
8798552--8798611
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
8798536--8799387
98
8.7
98
99
0
1679
32
20
25
21
1.97
8798650--8798709
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
8798748--8798807
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
8798846--8798905
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
8798944--8799003
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
8799042--8799101
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
8799140--8799199
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
8799238--8799297
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
8799336--8799387
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
8804881--8805062
55
3.4
54
77
2
186
19
23
18
38
1.93
8808922--8809010
43
2.1
42
93
4
160
30
25
13
29
1.93
8809451--8809496
18
2.6
18
92
0
74
13
30
41
15
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8829250--8829287
19
2.0
19
94
0
67
28
0
21
50
1.49
8830513--8830537
13
1.9
13
100
0
50
88
4
8
0
0.64
8831616--8831877
39
6.7
40
87
7
337
25
22
27
24
2.00
8841266--8841428
40
4.1
40
84
2
213
20
22
30
25
1.98
8841796--8842367
286
2.0
286
98
0
1101
25
15
22
36
1.93
8856229--8856378
55
2.8
54
80
4
149
26
15
29
28
1.96
8856201--8856378
27
6.6
27
77
6
146
25
15
28
30
1.96
8856202--8856357
82
1.9
81
81
6
190
25
16
28
30
1.96
8860194--8860360
38
4.3
39
86
3
203
22
23
25
28
1.99
8860194--8860346
78
2.0
78
84
5
202
23
24
26
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313