Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  255  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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13
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.99
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17
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78486710--78486743
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10
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6
51
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7
0
15
0.99
78502208--78502251
23
2.0
21
91
8
70
72
9
0
18
1.10
78502208--78502251
11
4.0
11
94
5
72
72
9
0
18
1.10
78502292--78502349
15
3.6
16
90
9
91
62
5
12
20
1.49
78502294--78502349
18
3.3
18
85
9
73
64
5
10
19
1.44
78503874--78503957
39
2.2
39
97
0
159
41
14
25
19
1.88
78508920--78509182
39
6.7
40
87
6
326
25
22
27
24
2.00
78515670--78515748
37
2.1
37
88
0
113
25
31
17
25
1.97
78515867--78516367
47
10.4
47
89
4
669
29
28
8
33
1.88
78528358--78528397
18
2.2
18
86
4
53
12
27
0
60
1.33
78529452--78529505
14
4.0
14
92
7
94
22
12
0
64
1.27
78529452--78529505
26
2.0
28
92
7
94
22
12
0
64
1.27
78529544--78529588
12
3.7
12
87
3
63
11
4
8
75
1.17
78529543--78529588
13
3.6
13
85
5
67
10
4
8
76
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78533803--78533859
15
3.7
15
97
2
105
17
12
5
64
1.44
78533803--78533857
16
3.5
16
95
5
103
16
10
5
67
1.39
78533899--78533943
12
3.8
12
96
0
81
11
0
8
80
0.92
78534936--78534982
23
2.1
23
84
7
62
51
12
4
31
1.59
78540321--78540362
15
2.7
16
92
3
68
16
14
4
64
1.45
78540400--78540447
12
3.9
12
91
5
78
16
0
4
79
0.89
78540402--78540447
13
3.6
13
88
2
67
13
0
4
82
0.81
78542167--78543036
79
11.0
79
99
0
1731
18
3
22
54
1.60
78543240--78543340
52
1.9
52
91
0
166
32
22
17
26
1.97
78549830--78549930
52
1.9
52
95
0
184
32
21
18
26
1.97
78552122--78552218
49
2.0
49
97
0
185
30
13
7
48
1.69
78556549--78556619
12
5.9
12
71
12
56
9
15
4
70
1.30
78557633--78557666
11
2.9
12
86
8
52
20
8
2
67
1.31
78567185--78567231
17
2.7
18
87
12
71
4
21
0
74
0.99
78567185--78567231
19
2.6
19
90
9
73
4
21
0
74
0.99
78571455--78571529
33
2.2
34
92
2
125
42
13
6
37
1.70
78573013--78573045
13
2.5
13
90
9
50
12
18
0
69
1.18
78573005--78573063
31
1.9
31
82
6
75
11
22
1
64
1.35
78583261--78583335
33
2.2
34
95
2
134
44
13
5
37
1.66
78585074--78585117
18
2.4
18
88
11
63
6
20
0
72
1.07
78595157--78595199
22
2.0
22
85
0
59
27
16
30
25
1.97
78596316--78596379
33
1.9
33
96
0
119
39
12
17
31
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78598853--78598901
18
2.5
20
87
9
66
71
4
20
4
1.19
78598990--78601019
679
3.0
679
94
1
3404
35
17
19
27
1.94
78603691--78603745
12
4.4
12
78
17
51
3
21
1
72
1.09
78603678--78603732
25
2.2
25
83
9
67
5
23
1
69
1.19
78618602--78618664
30
2.1
31
90
3
101
42
6
26
23
1.78
78619168--78619261
46
2.0
46
93
4
163
24
18
22
35
1.96
78620430--78620484
15
3.8
15
80
2
60
1
21
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72
1.09
78623752--78623782
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16
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1.70
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2.1
56
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0
231
45
9
23
22
1.81
78633280--78633504
40
5.6
39
81
8
224
24
20
28
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313