Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  258  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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56
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60
0
10
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51
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5
1
25
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
24
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2.1
17
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0
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2.2
14
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0
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1.84
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14
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2.0
20
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0
2
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0
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7
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1.70
79235358--79235475
28
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7
100
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5
33
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0
52
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11
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12
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0
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17
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53
1.63
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61
2.0
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51
2
5
41
1.38
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53
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13
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6.7
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0
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0
62
0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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32
1.82
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2.1
20
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0
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2.0
31
83
3
77
20
40
1
38
1.62
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17
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20
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1.37
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19
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133
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19
19
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10
10
10
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1.42
79351847--79351905
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1
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1.13
79355080--79355132
11
4.6
11
76
15
54
28
5
5
60
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79358779--79358847
3
22.7
3
72
19
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26
4
1
68
1.17
79358775--79358847
34
2.1
34
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9
87
26
4
1
68
1.15
79358776--79358847
12
5.9
12
78
12
67
26
4
1
68
1.16
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24
2.5
24
78
21
67
24
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3
62
1.40
79358953--79359025
3
24.3
3
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15
53
26
5
2
65
1.27
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13
2.7
12
90
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50
23
5
0
70
1.09
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2.6
17
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20
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27
4
0
67
1.10
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8
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1.74
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22
2.2
22
88
0
71
18
24
14
42
1.87
79367157--79367190
16
2.1
16
89
10
52
41
0
0
58
0.98
79367164--79367246
34
2.5
34
77
13
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53
0
0
46
1.00
79367234--79367265
9
3.8
9
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16
50
37
0
0
62
0.95
79367235--79367265
16
2.0
15
93
6
53
35
0
0
64
0.94
79367201--79367246
20
2.2
22
84
7
60
52
0
0
47
1.00
79367566--79367598
15
2.1
16
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5
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24
21
6
48
1.72
79375580--79375652
31
2.4
31
90
2
121
26
15
16
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1.87
79376143--79376174
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0
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1.82
79377368--79377408
8
5.4
8
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8
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0
0
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17
2.2
16
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4
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5
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0
1.04
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3
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3
100
0
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32
0
0
67
0.91
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278
2.0
278
99
0
1104
35
11
2
50
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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8
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37
6
11
44
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71
1.9
71
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2
233
30
16
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31
1.96
79392671--79392712
22
2.0
22
90
4
68
61
7
4
26
1.42
79392671--79392720
22
2.3
22
86
6
66
60
6
4
30
1.39
79392700--79392818
9
12.8
9
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65
2
0
31
1.12
79392701--79392770
19
3.7
20
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2
0
31
1.07
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2.0
19
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17
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1.32
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16
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0
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1.52
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11.4
50
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1
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29
20
23
26
1.99
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100
5.6
100
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1
684
29
20
23
26
1.99
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6.0
130
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0
1207
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20
25
1.98
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14
2.1
14
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0
51
43
16
0
40
1.48
79423724--79424136
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47
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30
7
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1.86
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2.6
44
77
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104
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19
20
30
1.97
79433004--79433157
46
3.5
43
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7
152
29
21
18
30
1.97
79433040--79433157
46
2.6
46
93
0
191
29
22
18
29
1.97
79433327--79433477
50
3.0
50
73
7
146
28
23
24
23
2.00
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21
2.5
19
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17
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26
23
0
50
1.50
79443714--79443818
39
2.6
39
86
5
122
24
22
27
24
2.00
79443674--79443837
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4.1
40
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12
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25
23
27
24
2.00
79443674--79443824
79
1.9
80
82
6
191
25
23
27
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79448875--79449054
27
6.7
26
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6
184
45
18
12
22
1.84
79448858--79449054
54
3.7
53
82
5
218
45
17
14
22
1.85
79448858--79449029
54
3.2
54
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2
231
44
16
15
23
1.86
79448858--79449054
80
2.4
79
81
9
211
45
17
14
22
1.85
79448858--79449057
107
1.9
108
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3
260
45
18
14
22
1.85
79449414--79449472
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1.9
31
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20
25
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1.98
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2.0
20
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12
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2.0
19
89
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58
0
18
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1.23
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27
2.4
27
92
0
103
36
18
21
23
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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