Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  244  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75351021--75351217
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0
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11
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2
78
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2.0
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58
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2.2
12
100
0
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.0
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20
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2.0
18
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19
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1.94
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11.5
76
78
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848
29
17
19
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.96
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1.97
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2.6
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3.8
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0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75488375--75488465
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0
0
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124
2.0
124
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0
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15
22
31
1.95
75495713--75496373
331
2.0
331
94
0
1151
29
17
23
30
1.97
75495506--75496580
538
2.0
538
98
0
2069
29
17
23
29
1.97
75496047--75496792
207
3.6
207
91
0
1127
29
17
22
30
1.97
75497190--75497278
19
4.8
19
87
8
139
37
11
14
37
1.82
75497211--75497266
18
3.5
15
81
18
60
37
10
16
35
1.83
75497198--75497278
35
2.2
37
91
6
130
37
12
13
37
1.83
75498496--75498604
43
2.5
42
85
2
128
37
26
12
22
1.91
75500176--75500212
15
2.4
16
82
13
51
48
43
8
0
1.32
75501248--75501327
27
3.0
26
83
10
83
37
3
5
53
1.41
75501463--75501504
21
2.0
21
85
0
57
38
9
7
45
1.64
75501887--75501938
21
2.5
21
80
0
59
28
3
5
61
1.37
75518082--75518123
21
2.0
21
85
0
57
38
9
7
45
1.64
75518504--75518555
21
2.5
21
80
0
59
28
3
5
61
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75518759--75518802
19
2.4
18
85
11
54
31
4
11
52
1.57
75520327--75520397
35
2.0
35
97
0
133
42
21
11
25
1.86
75521062--75521123
20
3.0
20
92
7
97
4
11
0
83
0.78
75521063--75521124
13
4.7
13
76
9
63
3
12
0
83
0.75
75524878--75524914
19
1.9
19
88
0
56
62
0
0
37
0.96
75527545--75527587
6
7.0
6
78
5
50
23
2
0
74
0.93
75527835--75527875
3
13.7
3
94
0
73
34
2
0
63
1.08
75528533--75528574
4
10.5
4
89
0
66
23
2
2
71
1.10
75531098--75531403
153
2.0
153
100
0
612
23
17
16
41
1.89
75534992--75535026
12
2.9
12
100
0
70
51
8
0
40
1.33
75534977--75535036
10
5.6
10
88
7
57
55
6
0
38
1.27
75534992--75535040
12
4.2
12
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10
57
51
10
0
38
1.36
75540992--75541048
8
7.5
8
77
15
50
84
5
1
8
0.84
75540992--75541048
14
3.9
14
76
13
60
84
5
1
8
0.84
75540993--75541055
23
2.8
22
77
17
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6
3
7
0.93
75541489--75541537
8
6.2
8
84
11
57
83
0
12
4
0.77
75542494--75542757
86
3.1
86
89
0
393
26
22
24
26
2.00
75542946--75543412
44
10.7
43
68
11
157
31
18
22
27
1.97
75542986--75543324
131
2.6
131
90
1
511
30
19
23
26
1.98
75543441--75543541
46
2.2
46
82
3
123
22
21
24
30
1.99
75545344--75545389
24
1.9
24
86
0
65
52
2
0
45
1.13
75545608--75545641
13
2.6
13
85
0
50
41
14
17
26
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75556749--75556794
23
2.0
23
83
8
58
56
2
2
39
1.24
75558301--75558327
7
3.9
7
100
0
54
25
14
14
44
1.84
75567292--75567324
16
2.1
16
88
11
50
48
0
3
48
1.17
75567994--75568022
14
2.0
15
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6
51
68
0
0
31
0.89
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24
1.9
24
95
0
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34
6
26
32
1.82
75579064--75579098
18
1.9
18
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0
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40
0
5
54
1.24
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2.0
18
94
0
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66
13
5
13
1.41
75581383--75581437
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2.8
20
88
0
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29
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29
1.97
75585237--75585308
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2.7
27
89
8
112
43
9
0
47
1.36
75585237--75585307
28
2.6
27
93
4
117
42
9
0
47
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313