Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  111  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36258886--36258953
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0
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2.0
157
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1.94
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2.0
69
82
2
168
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16
32
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
201
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5.8
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14
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2.0
113
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1.94
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250
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14
32
23
1.94
36276693--36276901
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4.7
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16
30
22
1.96
36276682--36276901
88
2.5
88
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2
262
30
16
30
22
1.96
36276688--36277059
44
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10
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19
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1.95
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2.0
29
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0
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4
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2.3
79
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0
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55
4
3
36
1.38
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1.9
20
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60
64
2
0
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1.08
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0
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1.08
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1
0
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22
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53
4
1
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1.28
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282
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4.7
46
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0
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28
28
22
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.77
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2.1
19
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53
2
2
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39
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53
3
4
38
1.39
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2.5
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20
7
39
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36379038--36379104
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4.2
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10
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15
20
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0
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5
17
1.73
36403358--36403406
21
2.3
20
80
10
53
10
12
0
77
0.99
36403515--36403552
16
2.5
15
84
16
51
0
18
0
81
0.69
36410496--36410526
16
1.9
16
93
0
53
29
16
6
48
1.70
36411626--36411718
46
2.0
46
95
0
168
39
15
8
36
1.78
36411934--36411989
28
2.0
28
85
0
76
32
12
23
32
1.92
36412092--36412182
28
3.2
28
85
0
119
26
19
20
32
1.97
36412118--36412255
73
1.9
73
86
0
195
21
21
22
34
1.97
36412092--36412283
101
1.9
101
81
4
235
22
21
21
33
1.97
36412189--36412327
28
4.9
28
84
0
152
23
20
22
33
1.97
36413733--36413763
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
36421494--36421522
8
3.8
8
95
4
51
10
0
48
41
1.37
36422532--36422676
48
3.0
48
88
4
220
36
4
18
40
1.72
36423539--36423565
6
4.5
6
100
0
54
14
0
0
85
0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36427125--36427156
8
4.0
8
91
0
55
46
25
25
3
1.67
36427403--36427467
28
2.3
28
94
0
112
33
27
7
30
1.85
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28
3.0
27
85
7
112
20
25
21
31
1.98
36427583--36427673
27
3.2
28
82
4
94
21
25
19
32
1.97
36427573--36427687
55
2.1
56
82
8
137
19
23
21
35
1.96
36428757--36428790
10
3.3
10
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8
50
29
8
8
52
1.62
36435300--36435364
28
2.3
28
94
0
112
33
27
7
30
1.85
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28
3.2
27
85
7
119
20
24
23
32
1.98
36435470--36435584
55
2.1
56
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19
24
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1.96
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1.9
29
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0
76
19
23
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23
1.97
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2.0
22
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4
70
23
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48
1.76
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5
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5
80
14
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77
4
18
0
0.94
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2.7
51
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5
172
27
17
24
30
1.97
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20
2.9
20
76
0
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20
32
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1.95
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25
2.0
24
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3
64
44
0
0
56
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14
2.1
14
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0
51
26
0
0
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21
1.9
22
85
5
57
17
12
24
46
1.82
36448580--36448621
22
1.9
22
85
9
59
16
11
23
47
1.80
36449926--36450008
14
6.1
13
68
18
53
61
2
3
32
1.26
36450618--36450677
28
2.1
29
81
3
68
41
13
5
40
1.66
36451684--36452213
88
6.0
88
87
2
731
21
24
20
33
1.97
36451684--36452213
266
2.0
264
87
3
753
21
24
20
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36453332--36453785
88
5.1
88
87
3
646
22
24
20
33
1.97
36453332--36453785
178
2.6
176
87
2
660
22
24
20
33
1.97
36458539--36458603
22
2.9
23
73
17
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63
3
4
29
1.30
36459654--36459789
43
3.1
43
63
23
104
31
22
25
20
1.98
36459874--36460061
44
4.2
43
72
12
164
34
20
23
21
1.97
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5.1
88
89
1
640
34
20
24
20
1.97
36459951--36460040
47
1.9
46
88
2
135
34
22
22
21
1.97
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43
71
13
137
31
21
25
21
1.98
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134
2.0
134
87
2
357
34
20
24
20
1.97
36461728--36461753
10
2.6
10
100
0
52
7
0
0
92
0.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313