Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  84  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28193950--28194056
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429
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3.3
14
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12
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2
29
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28259950--28260009
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30
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18
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1
39
1.22
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90
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2.0
49
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57
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0
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2.0
15
100
0
60
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6
6
13
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.97
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240
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17
30
1.97
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88
3.3
87
78
7
239
27
22
19
30
1.98
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2.1
46
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138
23
24
19
32
1.97
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45
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131
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17
30
1.97
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19
19
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2.0
20
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15
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1.87
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31
1.9
31
83
6
77
40
1
20
38
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28384310--28384358
24
2.0
24
100
0
98
12
16
20
51
1.76
28390717--28390775
29
2.0
29
96
0
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27
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10
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1.71
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22
1.99
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25
28
22
22
1.99
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1.36
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62
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10
18
1.52
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145
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17
17
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72
90
2
531
32
18
16
32
1.94
28414558--28414630
38
1.9
38
91
5
121
39
10
15
34
1.82
28414565--28414649
18
4.5
19
71
17
70
40
10
14
35
1.80
28414566--28414687
17
6.8
18
68
17
67
40
11
16
31
1.84
28414724--28414810
16
5.2
16
73
10
75
58
10
9
21
1.59
28414724--28414810
17
5.2
16
72
13
59
58
10
9
21
1.59
28414800--28414847
23
2.1
23
88
11
73
47
10
2
39
1.49
28414853--28414964
17
6.4
17
79
14
113
50
9
13
26
1.73
28414853--28414963
35
3.2
35
82
10
113
50
9
13
26
1.72
28414705--28414964
128
2.0
128
86
6
357
50
8
9
31
1.65
28420166--28420200
17
2.0
18
88
5
54
45
5
5
42
1.51
28420168--28420208
17
2.5
17
80
11
50
39
2
7
51
1.43
28421143--28421194
18
3.3
15
76
21
52
69
0
1
28
0.99
28421701--28421758
29
2.0
29
100
0
116
34
10
10
44
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28423356--28423403
20
2.5
20
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3
62
64
2
6
27
1.28
28423427--28423456
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
28425035--28425107
5
13.8
5
79
15
60
73
1
2
21
1.03
28425056--28425106
16
3.2
16
81
15
52
72
0
1
25
0.95
28430876--28430938
27
2.3
26
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10
63
50
11
0
38
1.38
28430905--28430934
15
2.0
15
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0
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10
0
50
1.36
28433933--28434037
44
2.5
42
80
9
106
26
19
23
30
1.98
28436153--28436181
14
2.1
14
100
0
58
20
6
20
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1.70
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16
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17
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8
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42
0
0
58
0.98
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2.4
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5
169
40
12
20
26
1.87
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16
3.1
17
80
8
59
42
0
0
58
0.98
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51
2.4
51
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2
176
39
12
21
26
1.88
28445795--28445850
28
2.0
28
96
0
103
41
0
19
39
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13
3.2
13
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50
25
25
0
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25
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26
23
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50
1.50
28449842--28449882
18
2.2
19
87
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29
24
0
46
1.53
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10
4.3
10
81
12
50
31
24
0
43
1.54
28450506--28450530
11
2.3
11
100
0
50
48
0
0
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1.00
28450527--28450576
15
3.3
15
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0
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50
12
2
36
1.51
28451531--28451587
21
2.6
22
73
15
64
66
5
0
28
1.13
28457393--28457452
21
3.0
22
76
13
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23
3
5
68
1.24
28457400--28457451
25
2.0
26
82
10
63
25
3
3
67
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28457543--28457590
20
2.6
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12
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22
4
0
72
1.01
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22
2.3
22
100
0
102
35
3
9
50
1.54
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4.9
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71
17
258
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2.1
30
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101
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28
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3.3
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262
34
18
18
29
1.94
28463867--28464082
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2.7
78
85
5
265
34
17
18
30
1.94
28463488--28464302
254
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242
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2.1
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7
233
34
18
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26
1.96
28464080--28464426
75
4.6
74
80
7
351
34
19
16
29
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313