Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  193  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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24
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59442235--59442285
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65
49
1
1
47
1.23
59444521--59444684
68
2.5
65
86
10
214
45
8
4
41
1.54
59446999--59447043
23
2.0
23
95
0
81
20
11
0
68
1.19
59451781--59451842
31
2.0
31
100
0
124
32
12
25
29
1.93
59456474--59456589
50
2.3
50
90
0
187
32
13
24
29
1.94
59456566--59456910
44
7.5
44
68
14
144
35
17
18
28
1.94
59456604--59456849
95
2.6
93
81
5
251
35
18
17
28
1.93
59456713--59457001
138
2.1
138
86
0
389
35
17
20
26
1.95
59456860--59457084
94
2.4
94
84
3
290
36
18
17
26
1.93
59457026--59457156
44
3.0
43
78
6
138
36
15
17
30
1.91
59458860--59458899
21
1.9
22
85
10
57
27
17
10
45
1.80
59459120--59459159
13
3.3
13
73
20
50
20
10
0
70
1.16
59459116--59459160
23
2.0
22
95
4
81
20
8
0
71
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59480714--59480763
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1.9
26
91
4
75
56
0
0
44
0.99
59480836--59480932
30
3.2
30
64
16
81
48
9
9
32
1.67
59480831--59480958
62
2.0
65
92
4
217
50
8
7
33
1.60
59480962--59480992
16
1.9
16
100
0
62
58
9
6
25
1.54
59484153--59484298
47
3.2
47
72
16
151
45
2
3
49
1.30
59484136--59484351
91
2.4
91
93
0
369
46
3
3
46
1.36
59484228--59484419
101
2.0
92
77
15
185
46
3
2
47
1.32
59484369--59484677
59
5.2
58
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20
197
41
2
5
50
1.40
59484358--59484775
120
3.5
120
93
2
714
41
2
6
50
1.39
59484418--59484738
61
5.3
61
66
20
208
40
2
7
49
1.44
59484492--59484537
16
2.9
16
78
12
51
45
0
2
52
1.13
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16
3.0
16
78
12
53
46
0
2
51
1.13
59484604--59484658
15
3.7
15
81
13
53
43
0
1
54
1.10
59484718--59484773
16
3.5
16
78
11
53
42
0
1
55
1.10
59484723--59484764
15
2.9
15
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10
52
47
0
0
52
1.00
59485445--59485706
131
2.0
131
100
0
524
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17
29
1.92
59488504--59488546
22
2.0
22
100
0
86
46
27
2
23
1.64
59491079--59491263
53
3.5
54
83
7
213
31
19
24
23
1.98
59495933--59495974
22
2.0
22
90
4
68
54
16
14
14
1.71
59503230--59503263
15
2.3
15
100
0
68
58
0
14
26
1.36
59504050--59504105
21
2.7
21
85
0
76
26
8
35
28
1.87
59504422--59505082
331
2.0
325
96
2
1207
36
15
14
33
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59511174--59511269
31
3.1
31
95
3
174
31
9
13
45
1.75
59511476--59511537
31
2.0
31
100
0
124
32
9
16
41
1.80
59512529--59512600
21
3.4
21
96
1
126
47
15
36
1
1.54
59518846--59518879
15
2.1
17
89
10
54
35
0
11
52
1.38
59519915--59520112
46
4.6
45
83
13
265
35
13
22
28
1.91
59519951--59520069
36
3.0
36
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16
139
36
12
21
29
1.90
59519915--59520069
82
1.9
82
97
0
292
36
11
21
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1.89
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2.2
40
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5
103
34
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23
20
1.97
59525895--59526030
40
3.4
38
77
8
130
38
22
19
19
1.93
59526071--59526306
41
5.8
41
86
2
314
23
21
25
30
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313