Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  248  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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12
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12
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22
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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1.34
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3.5
39
78
13
140
34
2
52
10
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76623668--76623821
25
6.2
25
83
2
175
18
33
17
29
1.94
76623668--76623831
50
3.3
50
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1
204
18
35
17
28
1.94
76623668--76623827
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2.1
75
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23
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10
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1.28
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2.1
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0
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0
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10
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1.62
76656186--76656217
10
3.1
10
95
4
55
34
9
18
37
1.83
76659232--76659274
7
6.0
7
86
5
59
37
0
16
46
1.47
76659240--76659283
22
2.0
22
82
8
54
36
0
18
45
1.49
76659751--76659811
30
2.1
27
85
8
77
16
11
22
49
1.78
76660691--76660782
39
2.3
40
90
1
141
33
3
0
63
1.11
76660780--76660840
31
2.0
31
87
6
88
36
1
1
60
1.16
76660701--76660834
49
2.7
49
89
5
191
32
2
0
63
1.15
76664203--76664282
38
2.0
40
92
4
137
28
1
38
31
1.65
76665779--76665843
34
1.9
35
90
6
107
33
18
24
23
1.96
76667596--76667693
42
2.3
43
82
5
119
24
16
28
30
1.96
76667551--76667709
43
3.7
42
75
7
133
22
17
28
30
1.97
76676110--76676141
16
2.0
16
93
0
55
25
15
0
59
1.36
76676359--76676559
51
4.0
51
79
8
221
29
30
16
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76676369--76676551
101
1.8
102
89
3
289
30
28
16
23
1.97
76676760--76676790
16
1.9
16
93
0
53
45
9
9
35
1.70
76679441--76679508
34
2.0
35
85
5
95
36
19
20
23
1.95
76681821--76681862
21
2.0
21
86
4
59
52
2
11
33
1.51
76683759--76683799
13
3.2
13
85
0
64
80
0
0
19
0.71
76684864--76684900
19
1.9
19
94
0
65
35
8
18
37
1.81
76685664--76685713
24
2.1
24
100
0
100
26
14
36
24
1.93
76688725--76688765
19
2.2
19
100
0
82
36
4
14
43
1.67
76692762--76692791
15
2.0
15
100
0
60
40
13
6
40
1.71
76693765--76693863
34
3.2
33
66
26
88
51
13
1
34
1.47
76693756--76693874
60
2.0
60
96
0
220
53
13
0
31
1.45
76694139--76694195
23
2.3
25
76
17
73
59
0
1
38
1.08
76694478--76694559
32
2.4
33
88
8
112
47
4
17
30
1.68
76697266--76697325
25
2.4
25
94
0
102
55
0
6
38
1.27
76705474--76705516
22
2.0
21
95
0
68
34
20
9
32
1.85
76706020--76706065
18
2.6
17
83
12
58
6
21
0
71
1.08
76708237--76708316
28
2.9
28
85
7
101
18
10
2
68
1.29
76710943--76710978
16
2.3
16
90
4
56
72
8
0
19
1.10
76713085--76713150
34
1.9
34
87
6
98
45
15
7
31
1.74
76713625--76713665
10
4.0
10
84
6
55
60
9
0
29
1.28
76713626--76713665
21
1.9
21
89
0
62
62
7
0
30
1.23
76719365--76719436
35
2.0
37
89
8
112
62
1
1
34
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76719451--76719486
5
7.0
5
93
3
54
2
36
58
2
1.27
76720139--76720189
13
3.9
13
77
10
59
33
5
23
37
1.79
76723275--76723313
16
2.4
16
95
0
69
30
25
5
38
1.78
76727286--76727332
22
2.1
22
88
7
69
65
0
0
34
0.93
76727301--76727342
18
2.3
18
83
0
57
66
2
0
30
1.04
76734204--76734257
28
2.0
27
82
10
65
66
1
3
27
1.19
76741151--76741201
24
2.1
24
85
7
68
29
0
1
68
1.00
76742757--76742799
18
2.4
18
92
0
68
20
27
9
41
1.83
76746369--76746889
126
4.1
126
87
1
731
28
16
17
37
1.92
76746369--76746889
251
2.1
253
87
1
760
28
16
17
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313