Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  285  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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10
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1
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2.5
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10
100
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2
4
27
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2.2
21
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2
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1.08
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0
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0
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0
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9
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78
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2.9
42
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4
151
34
27
15
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.0
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1.97
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2.2
16
90
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13
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19
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2.0
29
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0
109
22
47
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16
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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23
21
26
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1.99
87130838--87130924
24
3.6
24
81
6
88
44
13
18
22
1.85
87130823--87130869
18
2.6
18
80
6
51
46
14
19
19
1.84
87131235--87131448
27
8.0
27
79
1
216
42
17
14
24
1.87
87134993--87135232
27
9.0
27
86
3
297
43
19
13
23
1.86
87155549--87155629
40
2.0
40
100
0
162
29
20
19
29
1.97
87155629--87155806
27
6.6
27
81
5
171
28
28
16
26
1.97
87155650--87155805
82
1.9
81
86
3
224
28
28
16
26
1.97
87159728--87159780
27
2.0
27
85
3
72
28
11
20
39
1.87
87163923--87164899
47
20.7
47
97
0
1810
34
8
28
29
1.86
87165018--87165118
37
2.7
37
98
0
193
24
18
31
24
1.98
87166083--87166337
45
5.7
45
90
2
388
24
21
27
26
1.99
87176669--87177020
177
2.0
177
97
0
668
30
16
20
32
1.94
87181641--87181794
38
3.8
38
75
17
157
30
12
25
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87181606--87181794
85
2.2
85
93
0
324
30
13
24
31
1.93
87198623--87198799
47
3.8
46
82
10
225
25
20
31
22
1.98
87198623--87198799
94
1.9
93
89
5
277
25
20
31
22
1.98
87206128--87206298
94
1.8
93
85
6
238
27
17
29
25
1.97
87210773--87210886
42
2.7
42
83
0
147
30
15
26
27
1.96
87210770--87210908
42
3.3
41
76
4
134
31
17
24
26
1.97
87219674--87219831
40
4.0
40
89
0
235
30
28
18
22
1.97
87227959--87228010
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
87231776--87231887
42
2.7
42
79
5
111
32
16
25
26
1.96
87243256--87243367
56
2.0
56
92
0
188
41
7
13
38
1.72
87244566--87244597
17
1.9
17
93
6
57
50
0
12
37
1.41
87244711--87245203
247
2.0
246
95
0
896
36
8
19
35
1.83
87245325--87245402
38
2.1
38
92
0
129
25
16
32
25
1.96
87248801--87249157
47
7.6
47
91
1
552
32
8
30
28
1.87
87248801--87249157
143
2.5
141
92
0
570
32
8
30
28
1.87
87257625--87257818
49
3.9
49
83
4
248
26
19
25
28
1.99
87257627--87257813
100
1.9
99
92
1
311
25
20
25
28
1.99
87261965--87261989
13
1.9
13
100
0
50
56
36
0
8
1.29
87263365--87263397
15
2.1
16
88
5
50
60
12
0
27
1.32
87266787--87266858
27
2.7
27
82
4
92
36
16
18
29
1.93
87266891--87267152
27
9.7
27
79
5
217
39
22
9
28
1.85
87266865--87267234
54
6.8
53
75
8
214
39
21
9
28
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87267075--87267224
27
5.5
28
75
9
76
40
15
10
34
1.81
87267181--87267237
27
2.1
27
83
0
69
31
19
14
35
1.91
87267026--87267237
83
2.6
81
76
4
201
40
18
9
31
1.83
87267268--87267327
27
2.2
27
87
0
84
35
20
26
18
1.95
87267279--87267358
27
3.0
27
85
3
99
32
17
25
25
1.97
87267500--87267586
27
3.2
27
81
0
93
20
21
19
37
1.94
87268103--87268151
17
2.8
18
75
6
55
38
20
14
26
1.91
87270559--87270594
16
2.2
17
95
5
65
66
13
8
11
1.44
87270602--87270632
16
1.9
16
93
0
53
12
32
12
41
1.81
87273108--87273185
29
2.7
28
82
11
95
24
16
30
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313