Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  265  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81123997--81124111
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3.5
33
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0
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0
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4
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0
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0
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81125967--81125998
3
11.0
3
93
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0
31
0
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108
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16
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1.95
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228
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20
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137
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186
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1.94
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28
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3
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22
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14
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2
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2.0
53
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12
25
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1.93
81177835--81178014
46
3.8
47
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5
204
26
13
27
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81177835--81178014
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13
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1.94
81196989--81197031
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1.9
22
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4
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65
2
0
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1.06
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22
21
30
1.98
81198918--81199043
40
3.1
40
84
1
162
24
23
21
30
1.99
81199290--81199327
15
2.5
15
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2
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1.9
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0
277
24
21
25
28
1.99
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10.3
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227
25
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22
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1.99
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3.0
52
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2
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20
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2.4
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2.9
15
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0
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9
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0.87
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1.9
22
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9
68
4
4
7
83
0.91
81206697--81206751
28
2.0
28
82
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67
5
7
7
80
1.04
81210100--81210351
126
2.0
127
86
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26
17
18
38
1.92
81210413--81210516
34
3.1
33
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127
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15
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40
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2.0
37
100
0
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2
18
49
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1.9
123
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17
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1.97
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2.8
144
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2
480
27
26
17
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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8
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68
1.39
81212839--81212883
11
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89
10
72
11
8
11
68
1.39
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20
2.8
21
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63
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1.30
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21
2.1
21
100
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2.0
21
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55
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0
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6
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1.59
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26
1.61
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17
2.1
16
89
5
52
65
0
0
34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81333740--81333769
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51
20
0
0
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0.72
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10
10.6
10
68
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63
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2
1
38
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1
37
1.17
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2.0
18
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2
0
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1.04
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1.56
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23
10
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15
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15
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43
7
23
25
1.79
81345807--81345921
30
3.8
30
97
0
203
44
6
23
25
1.78
81347803--81347874
37
1.9
37
97
0
135
20
11
16
51
1.75
81349602--81349636
12
2.9
12
95
0
61
20
17
11
51
1.75
81349605--81349636
6
5.3
6
92
0
55
18
15
12
53
1.73
81350196--81350236
19
2.2
19
100
0
82
48
21
9
19
1.77
81357654--81357682
10
2.7
11
94
5
51
31
24
10
34
1.89
81359317--81359351
18
1.9
17
88
11
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2
5
28
1.32
81359340--81359368
12
2.5
12
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75
3
6
13
1.13
81359349--81359383
15
2.3
15
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0
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77
2
5
14
1.07
81360247--81360286
18
2.4
16
87
8
53
62
0
25
12
1.30
81364162--81364200
20
2.0
20
85
10
53
25
2
12
58
1.47
81373844--81373884
19
2.2
19
86
0
55
65
9
0
24
1.22
81374282--81374462
91
2.0
91
94
0
317
32
25
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81380551--81380858
23
13.1
23
71
7
170
39
16
13
29
1.88
81380551--81380845
93
3.1
93
95
1
509
40
16
13
29
1.87
81381578--81381700
28
4.5
28
81
8
146
30
26
11
31
1.91
81384315--81384505
50
3.7
51
80
6
206
24
28
21
25
1.99
81386913--81386961
23
2.1
24
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11
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12
12
10
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1.48
81387217--81387242
5
5.2
5
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0
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0
0
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1.9
30
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3
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19
0
5
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0.99
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2.3
24
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6
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18
0
7
74
1.04
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14
0
4
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0.87
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14
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19
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12
0
7
80
0.90
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1.9
18
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19
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1.81
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2.0
49
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23
29
21
24
1.99
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1.9
18
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5
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32
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0
55
1.36
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5
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6
61
17
0
0
82
0.66
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2.4
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7
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2
40
1.48
81414806--81415148
50
6.8
50
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1
508
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29
21
1.99
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33
2.9
34
78
9
97
22
19
15
42
1.89
81425879--81425907
14
2.1
14
100
0
58
24
20
27
27
1.99
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24
2.2
24
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0
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38
1
7
51
1.42
81437184--81437247
31
2.0
31
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25
12
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1.83
81439921--81439951
16
1.9
16
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0
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41
0
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1.54
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18
2.1
18
89
0
56
32
5
13
48
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81440823--81440865
18
2.3
19
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4
52
27
4
2
65
1.25
81454307--81454517
43
5.0
41
86
4
287
32
20
21
25
1.98
81454307--81454517
42
5.0
42
87
1
296
32
20
21
25
1.98
81454515--81454547
16
2.1
16
94
0
57
24
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12
33
1.91
81454842--81454887
19
2.4
19
100
0
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19
8
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50
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9
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9
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14
231
32
1
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1.61
81460291--81460568
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10.7
25
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2
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46
1.64
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3.4
16
73
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34
2
18
46
1.60
81460674--81460742
28
2.4
28
90
2
111
34
2
15
46
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313