Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   

This is table  192  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58944422--58944532
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58956997--58957152
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28
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2.2
23
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2.0
175
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0
702
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35
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1.9
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178
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10
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2.0
51
88
4
148
44
3
27
26
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59028272--59028347
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6.8
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43
1
30
25
1.63
59028272--59028347
22
3.4
22
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12
95
43
1
30
25
1.63
59028272--59028348
33
2.3
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24
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133
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2.0
248
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2.0
23
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0
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30
7
32
1.85
59058344--59058758
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2.2
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704
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26
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26
20
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3.4
22
76
16
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23
8
2
65
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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0
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1.43
59082155--59082199
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2.2
20
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54
44
0
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42
1.43
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2.0
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1.45
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3.2
21
95
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116
35
17
41
4
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59125461--59125752
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7.0
40
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239
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19
23
31
1.98
59125462--59125752
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19
24
31
1.98
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11
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3
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70
0
27
2
1.01
59137951--59137989
19
2.0
21
85
10
55
23
0
10
66
1.22
59138069--59138107
19
2.2
19
90
9
64
33
0
17
48
1.48
59138827--59138871
18
2.5
18
81
0
63
28
8
48
13
1.72
59144598--59144792
38
5.1
36
72
19
146
0
28
0
71
0.90
59144603--59144796
16
11.4
17
68
19
111
0
28
0
70
0.91
59144640--59144797
4
37.0
4
74
19
101
0
29
0
70
0.92
59144645--59144795
44
3.5
44
79
18
158
0
29
0
70
0.92
59144712--59144808
30
3.3
29
75
13
92
0
31
0
68
0.90
59144668--59144766
43
2.2
46
77
15
66
1
26
0
72
0.91
59144640--59144808
18
9.8
17
68
23
79
0
30
0
69
0.93
59144840--59144915
27
2.8
27
81
0
98
15
27
28
27
1.96
59144967--59145018
27
2.0
26
88
7
79
50
1
7
40
1.42
59144967--59145025
27
2.2
26
85
11
75
49
1
8
40
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59144968--59145038
28
2.6
27
84
6
81
47
2
9
39
1.51
59147462--59147546
41
2.1
41
97
0
161
32
14
22
30
1.93
59147479--59147542
21
3.1
21
66
20
62
35
14
23
26
1.93
59151496--59151692
98
2.0
98
96
0
367
37
24
9
28
1.87
59152593--59152644
22
2.5
20
77
17
52
75
3
3
17
1.11
59152423--59152671
129
1.9
130
91
2
412
63
5
5
26
1.37
59158648--59158830
79
2.3
81
83
7
223
24
27
22
24
2.00
59158627--59158830
40
5.1
40
81
8
229
24
27
22
25
2.00
59165189--59165228
13
3.1
13
88
0
53
47
5
22
25
1.71
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16
2.2
16
100
0
72
25
0
36
38
1.56
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15
2.1
15
100
0
62
38
6
32
22
1.80
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18
2.3
17
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8
53
38
5
12
43
1.65
59170156--59170185
15
2.0
15
93
0
51
23
6
46
23
1.75
59173157--59173365
92
2.3
91
85
6
253
45
3
3
46
1.37
59186152--59186177
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
59187677--59187821
73
2.0
73
95
0
263
44
13
20
21
1.85
59190268--59190313
21
2.1
22
84
4
58
17
23
19
39
1.92
59193092--59193167
9
8.4
9
88
0
116
40
21
11
26
1.87
59199757--59199910
20
7.7
20
67
7
89
16
31
16
35
1.91
59199764--59199880
40
2.9
40
92
0
198
17
31
17
33
1.93
59199883--59199931
20
2.4
21
90
6
75
14
30
14
40
1.85
59199757--59199907
80
1.9
80
84
2
196
16
31
17
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59199883--59199941
20
3.0
20
85
5
66
11
30
20
37
1.89
59202734--59202758
9
2.8
9
100
0
50
20
0
24
56
1.43
59203700--59203733
6
5.5
6
86
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50
14
2
2
79
0.97
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30
2.3
32
80
14
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47
9
7
35
1.64
59211069--59211114
21
2.3
20
78
14
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45
17
6
30
1.73
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2.3
43
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128
30
19
16
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2.0
37
94
0
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2
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1.20
59229678--59229718
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73
2
17
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1.17
59237615--59237896
155
1.8
155
89
2
451
42
4
10
41
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313