Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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This is table  196  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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53
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19
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53
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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21
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.18
60330046--60330083
20
1.9
20
88
0
58
26
2
2
68
1.16
60330050--60330083
17
2.0
17
88
0
50
26
2
2
67
1.19
60331420--60331502
11
7.4
11
77
18
66
16
2
7
73
1.16
60331420--60331502
6
14.8
5
80
15
60
16
2
7
73
1.16
60333959--60334154
50
3.8
50
82
4
203
26
19
29
24
1.99
60338821--60338863
22
2.0
22
95
0
77
39
4
11
44
1.62
60341175--60341223
20
2.5
20
86
3
64
36
12
28
22
1.90
60347135--60347618
70
6.9
70
81
0
491
30
25
18
25
1.98
60347135--60347598
140
3.3
140
82
1
563
30
26
18
25
1.98
60350821--60350875
25
2.2
26
78
12
62
60
12
5
21
1.53
60357122--60357162
3
13.7
3
94
0
64
26
34
0
39
1.57
60360258--60360300
17
2.6
16
82
7
50
2
16
2
79
0.95
60366531--60366579
15
3.3
15
80
2
55
42
0
4
53
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60366517--60366579
9
7.0
9
73
20
51
39
0
6
53
1.26
60366554--60366587
9
3.9
9
92
3
52
47
0
5
47
1.26
60367460--60367515
28
2.0
28
100
0
112
21
14
28
35
1.92
60374072--60374123
18
2.9
17
73
18
52
73
13
11
1
1.19
60382584--60382654
35
2.0
35
97
0
133
23
25
7
43
1.79
60384074--60384187
45
2.7
46
76
13
118
32
26
4
36
1.76
60384166--60384203
16
2.4
16
90
0
58
34
34
0
31
1.58
60384857--60384918
23
2.5
25
77
15
67
33
1
6
58
1.34
60386598--60386674
40
1.9
40
86
0
109
22
28
27
22
1.99
60386928--60387502
127
4.5
127
92
1
888
30
17
22
28
1.97
60388230--60388267
20
1.9
20
84
10
51
55
7
2
34
1.43
60389233--60389332
11
9.4
11
67
17
50
43
2
30
25
1.66
60389268--60389336
22
3.0
23
81
10
79
42
1
31
24
1.64
60391551--60391586
18
2.0
18
94
0
63
38
0
13
47
1.44
60395329--60395364
18
2.0
18
100
0
72
50
11
5
33
1.61
60403381--60403498
43
2.8
44
80
6
127
38
22
14
23
1.91
60403395--60403532
43
3.2
43
79
8
154
34
23
16
25
1.95
60405545--60405590
21
2.2
21
100
0
92
50
23
8
17
1.74
60407786--60407952
7
23.7
7
76
8
97
41
34
0
22
1.59
60407779--60407986
14
14.7
14
72
11
111
44
32
0
22
1.60
60407829--60407972
7
20.4
7
80
4
92
44
31
1
22
1.61
60407948--60407996
14
3.4
15
83
11
66
48
24
2
24
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60408020--60408058
7
5.6
7
81
0
51
43
35
0
20
1.52
60408207--60408305
40
2.5
40
80
5
110
27
19
19
34
1.95
60410657--60410923
68
3.9
68
85
0
345
23
22
16
37
1.93
60410657--60410923
136
2.0
136
87
0
381
23
22
16
37
1.93
60417149--60417187
14
2.9
14
85
7
55
71
0
0
28
0.86
60417137--60417209
27
2.7
26
74
8
65
61
1
0
36
1.05
60417426--60417482
19
2.9
20
82
7
64
68
0
3
28
1.06
60417426--60417482
20
2.9
20
84
7
64
68
0
3
28
1.06
60417537--60417575
16
2.5
16
83
4
53
41
0
5
53
1.23
60417567--60417635
22
3.2
22
79
6
79
39
4
0
56
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313