Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  10  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
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2.5
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2.0
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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10
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0
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1
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5
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2
1
43
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2
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2.2
31
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2
129
52
13
5
28
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3410891--3410957
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1.9
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0
0
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2
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0
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0
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10
64
1.25
3418200--3418261
10
6.2
10
75
14
56
0
24
9
66
1.22
3418223--3418256
13
2.7
13
95
4
61
0
29
8
61
1.26
3418218--3418287
30
2.3
30
85
7
88
4
30
11
54
1.55
3420128--3420165
19
2.0
19
100
0
76
10
10
31
47
1.72
3420569--3420616
18
2.8
18
74
22
50
43
0
0
56
0.99
3420586--3420637
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
3420634--3420828
56
3.1
65
65
22
182
41
2
6
49
1.40
3420552--3420872
119
2.7
120
98
1
619
43
1
4
50
1.32
3420705--3420756
15
3.6
15
80
12
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44
0
1
53
1.11
3420834--3420875
15
2.7
16
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14
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45
0
2
52
1.13
3420825--3420866
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
3425715--3425752
17
2.2
18
85
4
51
63
2
23
10
1.39
3425734--3425788
12
4.6
12
73
15
51
63
0
23
12
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3431155--3431197
17
2.5
17
96
0
77
39
4
6
48
1.51
3437621--3437782
67
2.4
66
80
7
182
30
22
14
31
1.94
3442388--3443066
216
3.1
215
86
3
952
33
18
16
32
1.93
3451008--3451042
17
2.0
17
88
5
52
34
0
0
65
0.93
3451039--3451072
16
2.1
16
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10
52
52
5
0
41
1.25
3455070--3455111
19
2.2
20
83
8
52
57
2
2
38
1.25
3456414--3456455
20
2.1
20
95
0
75
19
11
11
57
1.65
3457181--3457234
27
2.0
27
92
0
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9
5
42
1.60
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11
2.4
11
100
0
52
19
0
7
73
1.07
3459039--3459118
36
2.2
38
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6
103
21
6
3
68
1.27
3459045--3459100
25
2.3
24
84
3
67
19
3
5
71
1.21
3468730--3468831
10
10.7
9
72
11
69
60
2
1
34
1.23
3468730--3468831
19
5.3
19
74
15
75
60
2
1
34
1.23
3468730--3468831
39
2.7
38
79
10
118
60
2
1
34
1.23
3468752--3468831
29
2.8
29
79
9
74
60
2
1
36
1.18
3469022--3469199
9
19.0
9
65
20
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28
3
5
62
1.32
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20
3.0
20
73
14
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22
5
1
70
1.16
3469067--3469171
29
3.8
28
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10
108
32
3
4
59
1.36
3472055--3472191
68
2.0
67
98
1
265
28
16
16
39
1.89
3474598--3474666
22
3.1
21
71
18
68
20
0
20
59
1.38
3474598--3474662
23
3.0
21
72
18
60
21
0
20
58
1.39
3478235--3478264
15
2.0
15
93
0
51
66
3
0
30
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3484079--3484140
23
2.8
21
79
20
56
43
1
4
50
1.33
3490174--3490217
22
2.0
21
82
4
52
63
0
31
4
1.14
3494263--3494321
31
1.9
31
89
6
93
40
8
13
37
1.75
3499905--3499942
15
2.5
15
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39
0
0
60
0.97
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1
0
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1.11
3509616--3509690
9
8.3
9
74
11
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6
44
17
1.75
3509613--3509690
27
2.9
28
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9
72
32
6
43
17
1.75
3521018--3521061
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2.1
21
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4
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4
0
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1.14
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22
12
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1.91
3535735--3535772
16
2.3
17
86
4
51
73
5
5
15
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345