Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  209  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70963795--70963981
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99
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2
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28
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30
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29
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1.86
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25
3.2
25
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10
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32
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5
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1.79
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3.8
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162
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29
18
21
1.97
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0
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51
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0
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33
0
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0
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5
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1
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0
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2.3
50
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131
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0
19
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.99
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2.0
40
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2
115
40
18
20
21
1.92
71031465--71031780
41
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41
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1
528
27
23
27
21
1.99
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21
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1.96
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29
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2.0
30
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29
1.97
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5
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2.0
61
95
0
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1.91
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52
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26
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1.97
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0
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0
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136
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1.9
13
100
0
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24
4
32
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
1.98
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2.8
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255
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30
17
26
1.97
71079446--71079761
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3.3
97
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300
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30
17
26
1.98
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1.9
13
100
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1.97
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2.8
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288
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16
26
1.97
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140
1.8
140
83
7
346
25
30
16
27
1.97
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2.5
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2.3
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19
20
31
1.97
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0
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23
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1.99
71143826--71144030
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27
21
24
1.99
71143826--71144033
79
2.6
78
80
8
226
26
27
21
25
1.99
71143881--71144035
77
2.0
74
81
10
179
26
28
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71148605--71148796
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4.8
40
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5
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24
22
27
25
2.00
71169253--71169444
40
4.8
40
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1
278
25
28
21
24
1.99
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32
8
29
29
1.87
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235
91
2
806
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8
29
29
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6
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0
17
0
0.66
71187073--71187237
44
3.8
44
82
0
215
29
20
21
28
1.98
71187071--71187429
88
4.0
88
78
4
315
31
20
20
27
1.98
71187200--71187455
140
1.8
139
87
0
377
32
19
18
28
1.96
71187349--71187540
44
4.3
44
71
5
145
31
17
21
29
1.96
71189062--71189151
22
4.0
22
72
18
62
33
2
2
62
1.20
71189126--71189199
20
3.7
21
75
12
59
24
8
2
64
1.34
71189254--71189309
27
2.1
27
83
6
69
32
5
1
60
1.29
71189314--71189360
23
2.0
23
84
8
60
29
12
2
55
1.49
71192523--71192573
18
2.7
19
78
3
59
70
3
0
25
1.04
71192797--71192853
19
3.0
20
75
10
57
54
0
0
45
0.99
71193034--71193076
17
2.6
16
78
7
50
46
2
0
51
1.13
71195978--71196021
3
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100
0
88
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0
0
34
0.93
71197290--71197335
20
2.2
21
80
7
58
21
19
4
54
1.61
71198502--71198638
66
2.1
66
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4
170
13
25
18
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1.88
71202165--71202252
42
2.2
40
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8
122
22
28
27
21
1.99
71203636--71203885
40
6.6
39
70
11
173
32
20
18
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71203624--71203888
75
3.5
75
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0
422
31
21
19
27
1.97
71210589--71210704
51
2.3
51
82
5
128
28
19
24
27
1.99
71210626--71210767
51
2.8
50
82
8
144
28
16
27
27
1.97
71222410--71222629
48
4.7
46
77
10
214
27
18
30
23
1.97
71222410--71222726
48
6.6
48
76
9
199
28
17
29
24
1.98
71222547--71222730
49
3.7
50
81
6
180
29
19
27
23
1.98
71222407--71222729
94
3.4
96
78
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297
27
18
29
24
1.98
71226203--71226262
24
2.5
24
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0
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46
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18
26
1.77
71227067--71227149
31
2.7
31
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143
27
25
16
30
1.97
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25
2.8
25
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10
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28
21
20
28
1.98
71228364--71228471
27
3.9
27
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33
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16
40
1.80
71228428--71228550
27
4.6
27
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8
135
27
8
21
42
1.81
71228428--71228550
54
2.3
54
85
2
158
27
8
21
42
1.81
71228582--71228673
27
3.4
27
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3
123
43
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19
27
1.82
71232912--71232948
3
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0
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29
0
37
32
1.58
71237822--71237866
16
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15
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1.09
71237818--71237868
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2.0
25
84
3
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74
5
7
11
1.21
71241902--71241937
12
3.1
12
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4
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52
0
25
22
1.47
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47
4.8
48
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12
225
23
31
17
27
1.97
71246000--71246268
46
5.7
46
78
12
194
24
30
17
27
1.97
71250808--71250920
42
2.6
42
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113
32
27
17
22
1.96
71253406--71253587
48
3.9
47
78
9
203
29
25
19
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71253413--71253587
90
1.9
90
88
2
262
29
25
18
26
1.98
71254974--71255328
187
1.9
186
97
0
665
35
10
19
34
1.87
71257595--71258179
47
12.4
47
95
0
990
32
8
29
29
1.87
71264227--71264325
27
3.7
27
82
5
103
41
18
9
31
1.81
71264322--71264532
27
7.8
27
89
0
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27
22
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40
1.83
71264484--71264814
27
12.2
27
73
10
174
39
19
8
32
1.82
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2.4
81
89
2
286
40
19
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1.81
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1.81
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25
1.9
25
91
0
78
35
25
14
25
1.94
71266129--71266239
20
5.6
20
92
0
186
35
10
20
33
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345