Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  34  of  345  ( 41358 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9740868--9740904
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18
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0
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0
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1.54
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4.0
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16
1
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1.47
9741341--9741440
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3.2
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77
11
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2
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1.57
9741332--9741411
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2.1
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133
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1
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1.53
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17
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2.2
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1.9
30
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30
2.1
30
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0
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2.1
29
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100
0
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1.84
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10
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3
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9798016--9798150
23
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13
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2
4
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1.31
9798061--9798139
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2.1
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2
5
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9798276--9798317
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4.8
9
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11
52
38
0
4
57
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9798283--9798319
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0
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1.10
9798651--9798713
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19
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0
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9798650--9798701
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1.12
9798650--9798686
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5
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0
0
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10.9
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23
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3
5
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9798850--9798912
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2.9
22
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2.2
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1.34
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9811236--9811625
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174
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81
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1.25
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2.3
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1.22
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0
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2.9
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5
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1.42
9814284--9814386
24
4.8
21
76
19
74
32
1
4
61
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.35
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24
2.8
24
75
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77
32
1
7
58
1.34
9814510--9814553
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2.0
22
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72
20
22
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13
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28
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1.38
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19
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16
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32
0
3
64
1.12
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0
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1.10
9831305--9831357
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0
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31
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2
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2
0
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1.09
9848165--9848211
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20
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2
0
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25
3
5
65
1.31
9848919--9848995
31
2.5
31
78
14
88
28
3
3
63
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9848963--9849052
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4.8
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3
5
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1.30
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18
82
0
55
68
2
2
26
1.15
9879529--9879562
16
2.1
16
100
0
68
17
11
23
47
1.81
9881535--9881784
46
5.5
46
90
3
380
19
23
12
44
1.85
9881536--9881817
137
2.1
136
84
5
363
20
23
13
42
1.87
9881766--9881877
43
2.5
44
84
8
138
22
23
16
37
1.94
9883634--9883681
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
9893151--9893260
9
11.4
9
68
15
60
20
6
5
68
1.32
9893142--9893201
20
3.2
19
79
6
68
23
1
3
71
1.10
9893189--9893251
20
3.3
19
76
13
58
19
9
4
66
1.38
9893150--9893261
28
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27
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19
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21
6
5
66
1.34
9893219--9893269
19
2.7
18
80
14
59
25
5
5
62
1.41
9893808--9893881
29
2.7
27
78
17
98
58
0
0
41
0.98
9898896--9898969
18
4.1
18
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6
87
37
14
13
33
1.86
9899889--9899935
15
2.9
17
72
15
55
55
2
0
42
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9900029--9900301
149
1.8
148
79
6
318
43
9
3
43
1.54
9905342--9905449
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
9912402--9912509
26
4.2
26
90
4
173
36
23
7
33
1.83
9918108--9918144
12
3.0
12
84
7
56
59
0
5
35
1.20
9918108--9918141
13
2.7
13
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58
0
5
35
1.22
9918087--9918166
32
2.5
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10
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60
0
3
36
1.15
9918101--9918158
25
2.3
26
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6
73
60
0
3
36
1.14
9918137--9918171
17
2.1
17
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0
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0
0
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0.93
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18
2.0
18
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10
56
50
0
5
44
1.25
9923254--9923356
48
2.1
48
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3
145
38
8
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1.79
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139
2.0
139
94
0
488
32
11
18
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1.87
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1.9
14
100
0
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40
7
14
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1.74
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13
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13
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0
55
56
15
0
28
1.40
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19
1.9
19
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0
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43
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5
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1.76
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22
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17
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1.76
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17
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52
0
4
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1.22
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7
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1.61
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2.0
21
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4
59
47
4
0
47
1.23
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31
1.9
31
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0
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8
16
38
1.79
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75
2.0
75
100
0
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23
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2
16.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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7
22.9
7
65
22
55
58
0
3
37
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9956585--9956672
46
1.9
46
86
9
126
56
0
4
38
1.20
9957046--9957118
18
4.1
18
85
5
103
35
13
10
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1.80
9957045--9957116
35
2.0
36
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5
128
34
13
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1.81
9957454--9957537
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3.2
26
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0
141
34
4
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2.1
16
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5
50
35
8
11
44
1.72
9960611--9960961
164
2.1
166
93
1
589
28
20
19
31
1.97
9960611--9960961
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4.2
83
92
2
562
28
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119
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0
824
29
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44
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159
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23
17
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1.97
9962407--9962463
8
6.9
8
79
15
55
1
14
0
84
0.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345