Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   

This is table  6  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1897080--1897117
18
2.1
18
100
0
76
39
5
5
50
1.48
1902901--1902966
18
3.8
18
74
7
66
57
6
1
34
1.33
1903937--1903979
20
2.0
22
91
8
72
11
27
32
27
1.92
1907553--1907597
23
2.0
23
86
0
63
17
13
31
37
1.89
1909300--1909329
13
2.2
14
94
5
53
43
6
6
43
1.57
1910206--1910230
12
2.1
12
100
0
50
24
36
24
16
1.94
1910391--1910442
9
5.8
9
90
0
86
36
28
9
25
1.87
1911107--1911154
22
2.2
22
85
3
62
41
39
2
16
1.60
1912659--1912751
10
8.4
11
69
21
52
30
9
2
58
1.42
1918143--1918186
21
2.1
21
91
0
70
20
4
6
68
1.31
1928923--1928964
16
2.6
16
78
14
50
54
19
4
21
1.62
1931913--1931943
16
1.9
16
93
0
53
9
0
25
64
1.24
1932050--1932093
22
2.0
22
86
4
63
40
4
11
43
1.61
1932816--1932882
31
2.2
31
88
0
98
35
7
11
44
1.70
1933809--1933856
24
2.0
24
100
0
96
37
12
29
20
1.90
1938697--1938751
25
2.2
26
83
3
67
52
3
3
40
1.36
1941601--1941665
30
2.1
31
94
2
114
26
0
12
61
1.31
1941789--1941821
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
1945137--1945244
45
2.4
45
83
8
125
26
26
23
23
2.00
1945575--1945685
43
2.6
43
95
0
204
30
33
25
10
1.90
1945678--1945841
38
4.3
38
82
3
202
30
25
21
22
1.99
1951554--1951702
72
2.0
74
80
6
169
48
18
3
29
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1957341--1957391
26
2.0
26
96
0
93
17
23
21
37
1.94
1963488--1963622
69
2.0
69
97
2
254
35
13
12
38
1.82
1970575--1970615
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
1973266--1973301
6
6.0
6
100
0
72
50
16
16
16
1.79
1975841--1975865
11
2.3
11
100
0
50
44
12
8
36
1.71
1982145--1982178
6
5.7
6
100
0
68
35
0
0
64
0.94
1982130--1982180
18
2.8
19
79
5
54
37
0
0
62
0.95
2015547--2015721
70
2.5
69
85
2
217
28
14
22
33
1.94
2015739--2016078
76
4.5
75
87
5
463
32
15
20
32
1.94
2015725--2016073
148
2.3
148
85
6
479
31
15
19
33
1.93
2016355--2017025
71
8.8
72
76
15
391
29
15
20
34
1.93
2016521--2017020
83
6.3
81
75
16
437
28
16
20
34
1.94
2016584--2017020
72
5.7
71
77
16
399
29
15
20
34
1.94
2016724--2016750
12
2.2
12
100
0
54
14
14
7
62
1.51
2016442--2017025
160
3.7
160
85
8
688
29
15
21
33
1.94
2016651--2016825
88
2.0
83
89
8
262
27
16
19
36
1.93
2017330--2017698
73
5.0
74
82
6
421
27
16
22
33
1.96
2017311--2017698
148
2.6
148
86
2
505
28
15
21
34
1.94
2017330--2017661
73
4.5
73
84
2
425
28
15
23
31
1.96
2017678--2017728
14
3.6
14
77
12
50
19
11
3
64
1.41
2017692--2017725
16
2.1
16
88
0
50
17
8
2
70
1.25
2017800--2018051
77
3.3
76
89
3
382
25
18
21
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2018763--2018907
30
4.8
29
84
5
173
27
47
4
20
1.68
2019471--2019610
25
5.5
25
74
13
99
32
7
2
57
1.41
2019732--2019812
16
4.8
16
76
23
69
30
2
1
65
1.13
2019761--2019812
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
2027318--2027352
6
5.8
6
100
0
70
34
65
0
0
0.93
2028817--2028893
38
2.0
38
92
0
127
32
6
12
48
1.67
2029417--2029456
15
2.6
16
84
11
57
35
12
7
45
1.70
2038966--2038996
14
2.2
14
100
0
62
6
16
45
32
1.72
2044086--2044117
14
2.3
14
100
0
64
6
15
46
31
1.71
2045824--2045883
26
2.2
27
82
8
68
15
11
3
70
1.30
2048290--2048368
28
2.7
29
84
5
97
59
2
2
35
1.24
2054045--2054102
29
2.0
28
83
9
73
53
6
15
24
1.66
2055655--2056021
92
4.0
91
80
6
314
32
8
14
43
1.76
2064081--2064188
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
2065106--2065178
5
14.6
5
76
20
64
56
4
0
39
1.19
2065107--2065149
19
2.3
19
92
8
70
58
0
0
41
0.98
2065113--2065177
24
2.6
25
80
9
71
58
4
0
36
1.19
2070216--2070323
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
2071200--2071233
9
3.9
9
84
7
52
2
17
0
79
0.86
2071200--2071233
17
2.0
17
94
0
59
2
17
0
79
0.86
2071242--2071314
5
14.6
5
76
20
64
56
4
0
39
1.19
2071243--2071285
19
2.3
19
92
8
70
58
0
0
41
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2071249--2071313
24
2.6
25
80
9
71
58
4
0
36
1.19
2075538--2075817
141
2.0
141
90
2
438
27
21
20
30
1.98
2076001--2076412
142
2.9
142
86
1
585
28
19
20
30
1.97
2076609--2077305
141
5.0
141
86
3
919
28
21
20
30
1.98
2076663--2077305
276
2.3
279
87
3
904
27
21
20
30
1.98
2078740--2078769
13
2.4
13
94
5
53
0
10
0
90
0.47
2084428--2084474
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
2087540--2088463
45
20.9
46
78
4
450
29
26
16
26
1.97
2087540--2088463
88
10.5
90
79
4
873
29
26
16
26
1.97
2087622--2088426
133
6.1
133
93
1
1348
29
26
17
26
1.97
2087622--2088426
396
2.0
398
98
0
1551
29
26
17
26
1.97
2101157--2101191
11
3.1
12
88
12
56
48
0
51
0
1.00
2106666--2106984
118
2.6
121
82
6
367
33
17
7
41
1.78
2117743--2117786
14
3.1
15
87
6
56
40
0
2
56
1.11
2117743--2117787
15
3.0
16
84
12
60
40
0
2
57
1.11
2121813--2121886
25
3.0
24
72
20
62
43
2
1
52
1.23
2123910--2123961
25
2.1
25
96
0
95
32
26
7
32
1.85
2129764--2130044
151
1.9
151
83
1
375
44
16
13
24
1.84
2139433--2139525
18
5.2
18
86
0
132
31
17
23
27
1.97
2139433--2139525
36
2.6
36
91
0
150
31
17
23
27
1.97
2141016--2141066
26
2.0
26
96
0
93
19
21
15
43
1.88
2143467--2143508
13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2143471--2143507
16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
2151392--2151426
12
2.9
12
84
16
54
57
0
0
42
0.99
2152275--2152313
18
2.2
18
90
4
62
51
0
2
46
1.14
2152299--2152356
28
2.1
28
81
12
66
56
8
3
31
1.46
2152495--2152565
19
3.6
19
70
12
63
50
0
4
45
1.21
2152526--2152569
20
2.4
19
82
14
56
59
0
2
38
1.10
2157380--2157443
34
1.9
33
84
9
85
46
7
4
40
1.53
2161091--2161120
5
5.8
5
92
7
51
3
56
40
0
1.16
2161148--2161203
24
2.3
25
81
6
71
66
7
0
26
1.18
2161160--2161205
25
1.9
23
86
8
65
63
6
0
30
1.20
2162444--2162481
3
13.0
3
83
5
51
31
5
0
63
1.17
2162885--2162956
32
2.3
32
83
6
96
34
4
4
56
1.37
2165600--2165641
11
3.6
11
81
12
57
59
4
0
35
1.19
2168093--2168136
18
2.4
18
84
3
61
59
0
0
40
0.98
2168092--2168156
19
3.3
19
77
14
60
60
3
1
35
1.22
2168652--2168701
16
3.1
15
80
11
55
66
6
0
28
1.15
2168641--2168701
16
3.8
16
76
12
54
68
4
1
24
1.18
2172098--2172170
29
2.5
28
75
18
69
49
4
5
41
1.45
2182037--2182085
24
2.0
24
100
0
98
34
8
24
32
1.85
2185823--2185855
15
2.3
15
89
5
50
45
0
12
42
1.41
2186035--2186119
42
2.0
42
93
0
143
40
7
12
40
1.71
2188522--2188559
19
2.0
20
94
5
69
21
0
21
57
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2196668--2196732
25
2.5
26
75
7
71
66
7
4
21
1.36
2196669--2196732
26
2.6
25
77
5
76
67
7
4
20
1.35
2196965--2197000
19
2.0
17
89
10
54
44
2
2
50
1.31
2204793--2204933
53
2.7
52
85
4
178
31
27
13
26
1.94
2207876--2207943
29
2.4
28
79
13
77
19
7
35
38
1.79
2223876--2223903
5
5.6
5
100
0
56
21
0
0
78
0.75
2225639--2225677
11
3.5
11
82
0
51
61
5
10
23
1.48
2225636--2225706
22
3.3
22
76
7
58
67
4
9
18
1.35
2226740--2226824
42
2.0
42
100
0
170
31
16
18
32
1.94
2232225--2232492
57
4.7
57
87
0
333
24
25
22
27
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345