Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   

This is table  280  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95528766--95528902
48
2.9
48
84
4
186
25
16
30
27
1.96
95528989--95529123
49
2.7
49
81
3
155
25
20
28
25
1.99
95528851--95529091
123
2.0
123
90
1
385
26
18
28
25
1.98
95529849--95530209
168
2.1
168
86
3
494
20
24
31
24
1.98
95534836--95534893
24
2.3
26
79
8
66
41
0
3
55
1.17
95540664--95540705
15
2.9
14
86
10
57
85
0
11
2
0.68
95544318--95544362
21
2.1
21
87
0
63
4
40
20
35
1.72
95544769--95544797
13
2.1
14
93
6
51
55
6
0
37
1.27
95549855--95549965
9
12.3
9
68
16
52
39
0
15
45
1.46
95549849--95549985
47
3.0
43
80
13
159
40
0
13
45
1.49
95549872--95549985
47
2.4
47
94
0
192
40
0
14
44
1.51
95550181--95550246
28
2.3
29
92
2
107
57
10
13
18
1.64
95550185--95550250
16
4.4
16
76
18
70
59
12
10
18
1.61
95553129--95553204
40
1.9
40
86
2
109
25
21
15
38
1.92
95554535--95554612
7
11.0
7
75
2
57
20
0
30
48
1.50
95554921--95555663
41
18.2
41
81
6
819
26
16
24
32
1.96
95554933--95555663
81
8.9
82
82
5
838
26
16
23
33
1.96
95560990--95561124
54
2.4
54
84
10
157
25
17
24
31
1.97
95570106--95570143
19
2.0
19
100
0
76
26
10
15
47
1.78
95576579--95576686
37
3.0
36
77
18
100
40
2
2
53
1.30
95576637--95576686
20
2.7
19
80
20
61
42
2
2
54
1.23
95583703--95583815
28
3.9
28
71
18
88
26
26
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95583713--95583853
60
2.3
59
85
8
178
26
26
19
26
1.99
95588732--95588798
5
13.6
5
71
20
52
22
0
1
76
0.87
95588732--95588795
21
3.0
20
78
15
65
21
0
1
76
0.87
95588745--95588804
14
4.0
15
81
12
70
26
0
0
73
0.84
95588745--95588788
7
6.3
7
92
7
72
25
0
0
75
0.81
95588743--95588798
21
2.6
21
78
16
69
23
0
0
76
0.78
95593104--95593157
27
2.0
27
85
7
74
46
37
1
14
1.56
95623357--95623397
21
2.0
21
85
4
57
34
7
2
56
1.40
95628220--95628262
16
2.6
17
82
7
54
53
4
0
41
1.21
95628401--95628462
32
1.9
33
83
3
81
40
8
8
43
1.64
95632372--95632462
23
4.0
23
79
0
101
48
23
12
16
1.79
95632373--95632545
46
3.8
46
84
3
168
46
21
13
17
1.83
95632372--95632545
69
2.5
69
83
1
215
46
21
13
17
1.83
95632442--95632545
23
4.5
23
83
0
136
46
21
13
19
1.84
95634166--95634220
28
2.0
28
82
13
69
76
0
20
3
0.94
95639935--95639967
17
1.9
17
93
0
57
33
12
27
27
1.92
95643807--95643835
7
4.3
7
95
4
51
89
10
0
0
0.48
95648346--95648385
20
2.0
20
90
0
62
50
7
10
32
1.64
95648334--95648400
34
1.9
35
90
3
109
46
10
8
34
1.70
95658624--95658660
18
2.1
18
100
0
74
51
16
5
27
1.66
95658745--95658812
29
2.2
32
80
15
81
48
5
4
41
1.47
95658694--95658870
68
2.7
65
74
13
170
51
3
5
39
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95659614--95659666
26
2.0
26
100
0
106
33
16
11
37
1.85
95662627--95662690
32
2.0
32
96
0
119
25
23
18
32
1.97
95665565--95665684
52
2.3
54
85
4
156
30
20
23
26
1.98
95669912--95670015
52
2.0
52
98
0
199
45
21
7
25
1.78
95676132--95676180
24
2.0
24
100
0
98
46
16
12
24
1.81
95682397--95682432
18
2.0
18
88
0
54
8
41
2
47
1.48
95686539--95686583
22
2.0
23
82
8
56
53
2
6
37
1.40
95695556--95695838
140
2.0
140
100
0
566
28
15
18
37
1.92
95702981--95703171
86
2.2
86
85
1
247
21
19
23
35
1.96
95703045--95703171
44
3.0
41
71
8
110
21
19
22
36
1.95
95703356--95703456
43
2.4
42
84
1
121
19
18
24
36
1.95
95711722--95711751
9
3.4
9
95
4
53
33
13
30
23
1.93
95721451--95721533
41
2.0
41
97
0
157
39
20
16
22
1.92
95722024--95722078
23
2.4
23
82
8
69
43
21
0
34
1.53
95722158--95722183
11
2.4
11
100
0
52
46
0
0
53
1.00
95722089--95722209
62
2.0
62
96
3
226
36
14
6
42
1.72
95730412--95730457
17
2.7
17
100
0
92
58
13
6
21
1.57
95732851--95732981
61
2.2
59
79
5
145
35
4
16
43
1.68
95737995--95738044
8
6.5
8
79
9
50
80
2
16
2
0.91
95738003--95738044
22
1.9
22
85
0
57
78
2
16
2
0.96
95742904--95742951
24
2.0
24
84
8
62
0
0
29
70
0.87
95743882--95743949
29
2.4
28
81
16
77
48
20
0
30
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95748143--95748382
49
4.8
49
82
3
282
29
26
17
26
1.97
95749964--95749999
18
1.9
19
94
5
65
33
0
0
66
0.92
95749967--95750024
15
3.6
16
80
15
66
27
1
0
70
0.97
95756791--95756827
19
1.9
19
100
0
74
37
10
8
43
1.69
95782082--95782111
15
1.9
16
93
6
53
36
20
0
43
1.52
95782176--95782288
42
2.6
42
80
5
120
28
26
18
26
1.98
95784692--95784841
42
3.5
43
75
13
121
26
20
26
27
1.99
95784907--95784936
15
1.9
16
93
6
53
43
0
20
36
1.52
95785984--95786014
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
95793267--95793427
53
3.0
54
83
5
218
34
17
25
22
1.95
95793403--95793519
49
2.4
48
84
5
137
38
13
23
23
1.91
95793435--95793535
49
2.1
49
100
0
202
36
13
22
26
1.92
95795087--95795527
43
10.3
43
81
7
468
25
17
25
31
1.97
95795473--95795661
56
3.4
56
88
1
272
25
14
26
33
1.94
95809592--95809732
40
3.5
40
97
0
255
21
18
29
30
1.97
95812330--95812489
41
3.9
41
90
3
239
35
25
18
20
1.95
95812334--95812489
84
1.9
82
90
2
249
35
26
19
19
1.95
95822102--95822147
21
2.2
21
92
0
74
30
26
15
28
1.96
95822108--95822154
21
2.3
21
96
3
87
29
23
12
34
1.92
95827585--95827609
12
2.1
12
100
0
50
52
16
0
32
1.44
95832122--95832226
37
2.8
37
92
0
165
25
30
19
24
1.98
95832392--95832577
47
4.0
47
93
0
309
26
29
11
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95832477--95832552
22
3.3
22
68
22
66
26
28
11
32
1.92
95837026--95837094
27
2.6
27
81
9
88
37
15
21
24
1.93
95839993--95840017
12
2.1
12
100
0
50
52
16
0
32
1.44
95850802--95850846
20
2.2
20
80
0
54
46
4
6
42
1.50
95851549--95851659
35
3.2
35
77
10
111
33
27
16
23
1.95
95858665--95858775
35
3.2
35
81
7
127
33
26
18
22
1.96
95867411--95867594
40
4.6
40
82
6
196
23
20
27
28
1.99
95867411--95867591
80
2.3
81
83
9
221
23
20
27
27
1.99
95867479--95867641
40
4.1
39
82
7
141
26
20
26
26
1.99
95869306--95869331
8
3.2
8
100
0
52
11
11
0
76
1.01
95872148--95872182
13
2.7
13
90
0
52
31
28
25
14
1.95
95883172--95883293
47
2.6
47
84
8
144
27
29
22
20
1.98
95885444--95885489
22
2.1
22
87
0
65
23
15
21
39
1.92
95887709--95887932
40
5.7
40
85
6
287
25
28
21
24
1.99
95887709--95887932
79
2.8
79
83
6
283
25
28
21
24
1.99
95895730--95895954
40
5.7
40
83
5
242
26
27
21
24
2.00
95895756--95895954
79
2.5
78
81
6
211
26
27
20
25
1.99
95895732--95895954
119
1.9
120
81
6
274
26
26
21
25
2.00
95899034--95899166
47
2.8
47
94
0
230
31
27
16
24
1.96
95907746--95907778
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
95912041--95912120
30
2.6
31
81
11
94
56
15
16
12
1.68
95912041--95912111
15
4.7
15
79
10
83
57
12
16
12
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95912043--95912120
15
5.2
15
78
9
79
56
15
15
12
1.68
95915064--95915233
46
3.7
45
77
7
180
30
29
19
21
1.97
95915072--95915243
93
1.8
93
90
2
274
28
29
20
22
1.98
95918000--95918077
6
12.5
6
82
10
86
79
1
5
14
0.96
95918004--95918080
32
2.4
32
85
8
104
79
1
5
14
0.97
95918000--95918080
26
3.2
25
81
13
78
79
1
4
14
0.97
95923165--95923192
5
5.6
5
100
0
56
78
0
0
21
0.75
95923473--95923505
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
95927000--95927220
49
4.6
47
80
10
209
27
30
16
26
1.97
95926999--95927176
48
3.6
48
83
8
191
26
29
17
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345