Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  92  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30363090--30363163
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0
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0
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14
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177
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4.0
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242
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6.6
46
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421
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22
14
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.2
52
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12
35
1.91
30395820--30396134
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427
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22
14
34
1.93
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4.2
24
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10
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10
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2.0
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2.0
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51
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15
1.01
30398860--30398898
18
2.2
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15
0.99
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19
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23
23
1.99
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1.9
20
88
0
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34
26
10
28
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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28
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1.98
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2.0
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2.1
18
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30448671--30448724
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25
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1.94
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20
2.7
20
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54
15
35
22
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30463688--30463730
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0.90
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130
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29
20
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202
24
18
32
24
1.97
30477931--30478340
94
4.3
96
73
13
257
28
18
29
24
1.98
30479857--30479962
44
2.4
44
92
1
178
27
11
23
37
1.89
30482352--30482521
46
3.7
45
75
14
159
27
27
23
21
1.99
30482962--30482988
14
1.9
14
100
0
54
18
37
7
37
1.79
30493446--30493780
136
2.5
136
91
2
541
53
15
4
26
1.60
30497765--30497811
23
2.0
23
84
15
62
29
4
6
59
1.41
30498180--30498208
3
9.7
3
100
0
58
34
0
34
31
1.58
30498715--30498818
52
2.0
52
100
0
208
40
17
13
28
1.87
30501119--30501157
20
2.0
20
84
0
51
43
20
2
33
1.65
30502591--30502763
48
3.6
48
77
3
186
36
26
17
19
1.94
30512142--30512187
24
2.0
23
82
4
56
34
2
15
47
1.57
30514397--30514566
27
6.3
27
82
2
171
27
26
12
33
1.93
30514397--30514564
54
3.1
54
86
0
219
27
26
13
33
1.93
30514397--30514566
81
2.1
81
80
0
196
27
26
12
33
1.93
30515939--30516011
37
2.0
37
82
15
89
39
19
9
31
1.84
30517403--30517495
43
2.2
43
90
0
141
24
20
17
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30517717--30517759
17
2.6
17
81
3
52
41
20
4
32
1.73
30518474--30518505
12
2.7
12
100
0
64
18
0
6
75
1.01
30521316--30521381
33
2.0
33
93
0
114
34
10
9
45
1.70
30524395--30524435
16
2.6
16
92
0
64
43
17
14
24
1.86
30526377--30526406
13
2.4
13
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5
53
46
0
6
46
1.29
30537253--30537289
2
19.0
2
94
5
67
48
0
0
51
1.00
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2.3
25
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0
107
0
34
0
65
0.93
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3
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3
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33
0
3
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1.10
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3
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3
100
0
50
36
0
0
64
0.94
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22
2.5
24
75
21
58
35
3
6
54
1.42
30552375--30552413
19
2.1
19
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0
51
71
7
5
15
1.26
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55
2.1
56
83
8
146
34
21
24
19
1.96
30552876--30552965
27
3.2
27
85
7
119
32
23
24
20
1.98
30553071--30553135
28
2.3
28
91
0
103
32
7
27
32
1.85
30558555--30558624
32
2.2
32
92
2
113
30
31
12
25
1.93
30559483--30559507
13
1.9
13
100
0
50
64
8
0
28
1.22
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41
2.1
41
90
2
134
46
10
32
10
1.73
30565602--30565640
20
2.0
20
89
0
60
51
0
7
41
1.31
30565637--30565681
22
2.0
22
83
8
56
60
2
0
37
1.09
30565926--30565959
17
2.1
17
88
5
52
50
0
0
50
1.00
30569024--30569442
206
2.0
206
99
0
820
26
23
10
38
1.88
30573685--30573735
28
1.9
27
84
11
70
56
0
13
29
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30574831--30574995
69
2.4
68
80
2
161
36
23
20
19
1.95
30577266--30577366
43
2.3
43
81
6
116
26
11
24
36
1.90
30580761--30580792
16
2.0
16
100
0
64
37
6
31
25
1.81
30586592--30586865
46
6.0
46
85
0
334
41
12
22
23
1.88
30586949--30586991
13
3.3
13
76
0
50
37
2
23
37
1.68
30586949--30587043
26
3.6
26
75
13
70
40
4
18
36
1.71
30588148--30588206
22
2.7
22
86
0
73
18
23
18
38
1.93
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22
3.2
21
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8
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27
1.83
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46
90
1
446
40
12
23
23
1.88
30595338--30595692
69
5.1
69
80
4
356
35
20
22
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345