Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
493038--493154
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23
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2.0
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517873--517923
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0
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28
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
131
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2
504
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3
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2.0
32
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3
110
30
22
14
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591903--591962
21
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21
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6
4.9
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0
12
31
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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20
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22
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3.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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0
24
0.80
678416--678477
21
3.0
21
70
21
51
66
0
0
33
0.92
681865--681942
30
2.5
32
75
4
88
44
6
11
37
1.66
682079--682126
21
2.3
21
78
7
53
50
0
4
45
1.21
686238--686486
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
686237--686486
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
686581--686612
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
686824--686881
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
688343--688388
19
2.4
19
81
3
56
36
0
2
60
1.09
688347--688401
20
2.9
19
81
10
60
38
0
3
58
1.16
690844--690901
23
2.5
23
80
0
62
32
6
5
55
1.49
698263--698335
25
2.8
26
78
15
71
38
2
5
53
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
700863--700946
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
705386--705416
16
1.9
16
100
0
62
6
19
0
74
1.03
706693--706759
33
2.0
34
97
2
127
38
2
5
52
1.41
707298--707359
31
2.0
31
100
0
124
32
19
3
45
1.66
715680--715754
31
2.5
30
79
10
84
26
8
8
57
1.55
719215--719256
3
14.0
3
94
0
75
64
0
2
33
1.07
720963--721357
131
3.0
132
76
10
500
25
22
21
30
1.98
720842--721267
218
2.0
218
85
2
588
26
22
20
30
1.98
720894--721311
44
9.6
44
76
7
343
25
22
21
30
1.99
733889--733930
3
14.0
3
94
0
75
64
0
2
33
1.07
758221--758293
30
2.3
32
77
9
80
54
2
1
41
1.23
758412--758457
23
2.1
21
84
15
58
47
0
2
50
1.13
761171--761215
23
2.0
22
86
4
63
51
6
2
40
1.41
767857--768174
161
2.0
160
96
0
591
27
9
19
43
1.82
768704--768738
16
2.2
16
100
0
70
11
5
17
65
1.43
768708--768743
16
2.4
15
90
9
56
13
8
13
63
1.50
770493--770540
23
2.0
24
84
11
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25
37
6
31
1.81
788770--788833
28
2.2
28
83
8
76
60
1
6
31
1.30
789079--789111
17
1.9
17
88
11
50
54
3
6
36
1.41
789565--789642
37
2.1
36
86
4
111
56
16
2
24
1.53
789574--789646
37
2.0
37
97
0
137
60
16
4
19
1.51
790684--790749
32
2.0
32
82
8
80
33
10
6
50
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
798007--798037
5
6.2
5
92
0
53
19
3
0
77
0.90
802565--802637
26
3.0
25
77
16
73
42
1
1
54
1.17
805675--805708
17
1.9
18
94
5
61
64
0
0
35
0.94
806530--806554
6
4.2
6
100
0
50
32
0
0
68
0.90
806690--806717
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
807142--807200
26
2.2
26
87
3
91
55
8
5
30
1.51
807499--807546
17
2.7
18
83
9
62
64
2
4
29
1.23
807499--807547
16
2.8
17
84
9
55
65
2
4
28
1.22
807793--807849
8
7.9
8
77
15
54
38
0
0
61
0.96
807777--807828
16
3.4
15
79
12
52
42
0
1
55
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345